More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6440 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  49.46 
 
 		 868 aa  759    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  50.67 
 
 		 1057 aa  806    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  50.93 
 
 		 957 aa  770    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  50 
 
 		 853 aa  801    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  90.63 
 
 		 843 aa  1540    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  47.43 
 
 		 850 aa  698    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  51.45 
 
 		 895 aa  827    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  49.36 
 
 		 853 aa  770    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  51.81 
 
 		 895 aa  817    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  50.14 
 
 		 730 aa  681    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  50.6 
 
 		 853 aa  807    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  50.47 
 
 		 850 aa  803    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  51.05 
 
 		 1074 aa  783    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  51.09 
 
 		 892 aa  787    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  50.18 
 
 		 923 aa  798    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 843 aa  1746    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  60.21 
 
 		 852 aa  965    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  50.8 
 
 		 1063 aa  780    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  47.43 
 
 		 850 aa  696    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  49.69 
 
 		 1059 aa  759    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  51.45 
 
 		 895 aa  824    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  51.33 
 
 		 895 aa  821    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  51.28 
 
 		 847 aa  666    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  50.8 
 
 		 1063 aa  780    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  47.43 
 
 		 850 aa  696    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  51.16 
 
 		 1057 aa  788    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  58.18 
 
 		 835 aa  939    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  51.64 
 
 		 891 aa  806    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  50.8 
 
 		 1063 aa  781    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  41.59 
 
 		 910 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  40.95 
 
 		 869 aa  585  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  41.27 
 
 		 871 aa  581  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  40.51 
 
 		 875 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  38.3 
 
 		 855 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6904  Rhs element Vgr protein  41.31 
 
 		 928 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  39.19 
 
 		 890 aa  530  1e-149  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  39.52 
 
 		 961 aa  531  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0636  Rhs element Vgr protein  38.81 
 
 		 912 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4173  type VI secretion system Vgr family protein  41.25 
 
 		 784 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  37.27 
 
 		 958 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0933  Rhs element Vgr protein, putative  40.65 
 
 		 780 aa  481  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1531  Rhs element Vgr protein, putative  40.52 
 
 		 780 aa  481  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398232  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  30.58 
 
 		 851 aa  331  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  29.94 
 
 		 853 aa  325  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  30.44 
 
 		 975 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  30.31 
 
 		 886 aa  310  5e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  29.79 
 
 		 901 aa  305  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  28.91 
 
 		 918 aa  303  8.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  28.57 
 
 		 885 aa  300  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  29.92 
 
 		 968 aa  298  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  29.13 
 
 		 918 aa  293  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  28.2 
 
 		 837 aa  289  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  29 
 
 		 933 aa  288  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  28.6 
 
 		 911 aa  282  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  34.91 
 
 		 618 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  35.84 
 
 		 661 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  35.26 
 
 		 661 aa  272  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  35.6 
 
 		 703 aa  272  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  31.37 
 
 		 952 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  35.65 
 
 		 661 aa  270  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  35.45 
 
 		 661 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  28.23 
 
 		 898 aa  269  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  30.38 
 
 		 924 aa  269  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  35.45 
 
 		 661 aa  269  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  35.45 
 
 		 661 aa  269  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  35.45 
 
 		 661 aa  269  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  35.45 
 
 		 661 aa  269  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  33.94 
 
 		 618 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  33.2 
 
 		 613 aa  267  5e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  27.58 
 
 		 1094 aa  266  8.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  34.69 
 
 		 616 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  29.35 
 
 		 920 aa  252  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  29.24 
 
 		 920 aa  251  4e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  28.48 
 
 		 822 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  32.12 
 
 		 614 aa  248  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  26.61 
 
 		 845 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  28.44 
 
 		 1114 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  27.49 
 
 		 843 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  26.7 
 
 		 845 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  27.57 
 
 		 847 aa  244  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  28.47 
 
 		 1284 aa  242  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1019 aa  241  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  27.59 
 
 		 834 aa  238  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  25.33 
 
 		 920 aa  238  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  27.59 
 
 		 834 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  27.14 
 
 		 838 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  27.42 
 
 		 842 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  27.59 
 
 		 834 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1019 aa  236  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  27.6 
 
 		 1048 aa  233  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1111 aa  233  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  28.62 
 
 		 849 aa  233  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 		 906 aa  232  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  27.16 
 
 		 841 aa  233  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  27.16 
 
 		 841 aa  232  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  27.95 
 
 		 1111 aa  232  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  26.36 
 
 		 840 aa  232  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  29.11 
 
 		 906 aa  231  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  27.83 
 
 		 1111 aa  231  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00004  Rhs element Vgr protein, putative  31.9 
 
 		 748 aa  231  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>