More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01531 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  95.98 
 
 		 920 aa  1302    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  96.26 
 
 		 920 aa  1302    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  97.42 
 
 		 849 aa  1355    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01531  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 892 aa  1791    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  43.8 
 
 		 927 aa  533  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1615  Rhs element Vgr protein  44.96 
 
 		 946 aa  534  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1771  Rhs element Vgr protein  44.83 
 
 		 946 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156841  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1590  Rhs element Vgr protein  44.83 
 
 		 946 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  44.61 
 
 		 947 aa  521  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2693  Rhs element Vgr protein, putative  44.09 
 
 		 942 aa  519  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  40.34 
 
 		 933 aa  500  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  44.32 
 
 		 918 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00272  hypothetical protein  96.27 
 
 		 944 aa  328  3e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01369  hypothetical protein  95.03 
 
 		 944 aa  325  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00500  hypothetical protein  93.79 
 
 		 945 aa  320  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01534  hypothetical protein  93.17 
 
 		 944 aa  319  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410343  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00279  hypothetical protein  93.17 
 
 		 376 aa  317  5e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00498  hypothetical protein  92.55 
 
 		 780 aa  317  7e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00492  hypothetical protein  91.93 
 
 		 770 aa  317  8e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.998785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00274  hypothetical protein  88.2 
 
 		 655 aa  291  5.0000000000000004e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01372  hypothetical protein  79.19 
 
 		 202 aa  274  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  30.14 
 
 		 1094 aa  256  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  29.48 
 
 		 811 aa  249  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  30.01 
 
 		 958 aa  242  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  30.16 
 
 		 911 aa  241  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  32.91 
 
 		 979 aa  238  5.0000000000000005e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  29.62 
 
 		 869 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  29.2 
 
 		 875 aa  233  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  29.29 
 
 		 871 aa  233  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  33.07 
 
 		 928 aa  231  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  29.81 
 
 		 898 aa  229  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  28.57 
 
 		 1057 aa  229  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  28.83 
 
 		 923 aa  222  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  28.67 
 
 		 868 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  28.29 
 
 		 1074 aa  221  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  28.71 
 
 		 1057 aa  221  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  28.94 
 
 		 853 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  28.83 
 
 		 853 aa  218  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  28.46 
 
 		 892 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  28.37 
 
 		 853 aa  214  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  28.06 
 
 		 1063 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  28.21 
 
 		 1063 aa  213  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  28.35 
 
 		 1063 aa  213  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  28.08 
 
 		 1059 aa  211  4e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  31.5 
 
 		 847 aa  204  8e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  28.28 
 
 		 853 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  27.36 
 
 		 850 aa  201  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  27.86 
 
 		 957 aa  201  7e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  28.97 
 
 		 1006 aa  199  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  28.59 
 
 		 962 aa  196  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  28.7 
 
 		 843 aa  196  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1766  Rhs element Vgr protein  29.22 
 
 		 935 aa  195  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  28.61 
 
 		 851 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  30 
 
 		 1114 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  29.04 
 
 		 843 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  28.74 
 
 		 852 aa  191  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  27.23 
 
 		 902 aa  190  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04253  Rhs element Vgr protein  31.73 
 
 		 612 aa  190  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02165  ISxac3 transposase  89.11 
 
 		 171 aa  189  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  26.65 
 
 		 891 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1580  Rhs element Vgr protein  29.12 
 
 		 935 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0659  Rhs element Vgr protein  29.12 
 
 		 935 aa  188  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1377  Rhs element Vgr protein  29.12 
 
 		 935 aa  188  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369821  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0498  Rhs element Vgr protein  29.12 
 
 		 935 aa  188  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  28.31 
 
 		 895 aa  187  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1606  Rhs element Vgr protein  28.99 
 
 		 935 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0855  Rhs element Vgr protein  29.12 
 
 		 935 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02036  Rhs element Vgr protein  32.31 
 
 		 587 aa  186  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372394  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2705  Rhs element Vgr protein  28.48 
 
 		 932 aa  183  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1111 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  25.31 
 
 		 895 aa  183  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  28.71 
 
 		 1111 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  28.51 
 
 		 1111 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  25.17 
 
 		 895 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  25.17 
 
 		 895 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 		 1111 aa  180  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7615  Rhs element Vgr protein  30.9 
 
 		 984 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  24.86 
 
 		 895 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  28.81 
 
 		 730 aa  174  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  27.99 
 
 		 955 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  26.41 
 
 		 901 aa  166  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  28.35 
 
 		 975 aa  164  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2212  type VI secretion system Vgr family protein  27.95 
 
 		 981 aa  162  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  29.29 
 
 		 847 aa  160  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  27.54 
 
 		 850 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  27.7 
 
 		 922 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  27.41 
 
 		 850 aa  159  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  27.41 
 
 		 850 aa  159  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  27.8 
 
 		 835 aa  159  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  28.99 
 
 		 886 aa  157  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  27.19 
 
 		 956 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  27.19 
 
 		 956 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  25.14 
 
 		 968 aa  153  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04713  Rhs element Vgr protein  36.31 
 
 		 564 aa  152  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02038  Rhs element Vgr protein  33.2 
 
 		 477 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.307189  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0089  Rhs element Vgr protein, putative  28.43 
 
 		 926 aa  145  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3225  Rhs element Vgr protein, putative  28.43 
 
 		 926 aa  145  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  25.41 
 
 		 822 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  25.34 
 
 		 910 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  27.12 
 
 		 922 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>