38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00272 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01369  hypothetical protein  92.89 
 
 
944 aa  1818    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00272  hypothetical protein  100 
 
 
944 aa  1954    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00274  hypothetical protein  91.91 
 
 
655 aa  1220    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00279  hypothetical protein  95.72 
 
 
376 aa  744    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00492  hypothetical protein  90.34 
 
 
770 aa  1407    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.998785  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00498  hypothetical protein  90.49 
 
 
780 aa  1451    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.10002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00500  hypothetical protein  91.51 
 
 
945 aa  1795    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01534  hypothetical protein  91.84 
 
 
944 aa  1807    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.410343  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2204  hypothetical protein  29.6 
 
 
949 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0482789  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1283  hypothetical protein  27.68 
 
 
944 aa  360  9e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0978442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0012  hypothetical protein  29.32 
 
 
945 aa  355  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01531  Rhs element Vgr protein  96.27 
 
 
892 aa  327  5e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01372  hypothetical protein  75.37 
 
 
202 aa  296  9e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2691  hypothetical protein  30.78 
 
 
1007 aa  242  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02165  ISxac3 transposase  92.31 
 
 
171 aa  224  6e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0008  hypothetical protein  27.97 
 
 
960 aa  204  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0209378  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6438  hypothetical protein  26.86 
 
 
966 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.85217 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3775  hypothetical protein  25.7 
 
 
853 aa  93.2  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0306647 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3748  hypothetical protein  25.05 
 
 
858 aa  91.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.064336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4615  hypothetical protein  25.05 
 
 
858 aa  91.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2248  hypothetical protein  25.87 
 
 
1160 aa  85.9  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0206  hypothetical protein  22.07 
 
 
887 aa  75.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.337696  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7607  hypothetical protein  31.38 
 
 
893 aa  72.4  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2252  hypothetical protein  22.34 
 
 
875 aa  72  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0063  conserved hypothetical membrane anchored protein  29.28 
 
 
862 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7020  hypothetical protein  30.27 
 
 
856 aa  64.7  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0820471  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3916  hypothetical protein  29.57 
 
 
852 aa  62  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.437576 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02056  hypothetical protein  32.56 
 
 
953 aa  59.7  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.234691  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01528  hypothetical protein  32.56 
 
 
870 aa  59.7  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679638  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1592  hypothetical protein  26.32 
 
 
947 aa  57.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.933754  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1617  hypothetical protein  26.01 
 
 
947 aa  56.2  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.396343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1773  hypothetical protein  26.01 
 
 
947 aa  56.2  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0117917  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01956  putative transmembrane protein  27.49 
 
 
925 aa  55.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.196739  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01953  hypothetical protein  31.17 
 
 
1049 aa  53.9  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2856  hypothetical protein  28.65 
 
 
1072 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.563865  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2276  hypothetical protein  26.49 
 
 
880 aa  50.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.696419  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2494  hypothetical protein  32.99 
 
 
1013 aa  50.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.645652  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2201  hypothetical protein  28.35 
 
 
1082 aa  47.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.692448 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>