More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1606 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1580  Rhs element Vgr protein  99.47 
 
 
935 aa  1870    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0659  Rhs element Vgr protein  99.89 
 
 
935 aa  1880    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0855  Rhs element Vgr protein  99.68 
 
 
935 aa  1875    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0498  Rhs element Vgr protein  99.89 
 
 
935 aa  1880    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1766  Rhs element Vgr protein  99.36 
 
 
935 aa  1870    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7615  Rhs element Vgr protein  73.43 
 
 
984 aa  1360    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  44.93 
 
 
928 aa  690    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1606  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
935 aa  1882    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2705  Rhs element Vgr protein  93.37 
 
 
932 aa  1749    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2212  type VI secretion system Vgr family protein  69.62 
 
 
981 aa  1261    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1377  Rhs element Vgr protein  99.89 
 
 
935 aa  1880    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369821  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  45.03 
 
 
979 aa  674    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  40.43 
 
 
1094 aa  632  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  40.18 
 
 
962 aa  619  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  40.15 
 
 
1006 aa  600  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0394  Rhs element Vgr protein  40 
 
 
811 aa  494  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.787309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04713  Rhs element Vgr protein  44.84 
 
 
564 aa  313  6.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  29.63 
 
 
871 aa  295  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  28.38 
 
 
869 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  29.14 
 
 
875 aa  284  5.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  28.34 
 
 
958 aa  274  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  28.87 
 
 
853 aa  271  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  28.62 
 
 
911 aa  270  7e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04712  Rhs element Vgr protein  45.21 
 
 
336 aa  261  6e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  28.68 
 
 
851 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  28.38 
 
 
933 aa  256  2.0000000000000002e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  28.09 
 
 
927 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  26.24 
 
 
850 aa  245  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  26.23 
 
 
895 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  26.53 
 
 
891 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  26.36 
 
 
895 aa  234  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  29.47 
 
 
920 aa  234  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  29.32 
 
 
918 aa  232  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  26.17 
 
 
1057 aa  231  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  25.68 
 
 
895 aa  230  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  26.3 
 
 
1059 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  25.68 
 
 
895 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  26.11 
 
 
923 aa  229  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  28.87 
 
 
920 aa  228  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  26.76 
 
 
1063 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  26.76 
 
 
1063 aa  225  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  26.89 
 
 
1063 aa  225  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  26.55 
 
 
1074 aa  224  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2693  Rhs element Vgr protein, putative  28.72 
 
 
942 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  29.33 
 
 
906 aa  221  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  26 
 
 
853 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  26.09 
 
 
1057 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 
947 aa  218  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  29.26 
 
 
906 aa  217  7e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  24.73 
 
 
853 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  24.58 
 
 
868 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  26.73 
 
 
850 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  26.62 
 
 
850 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  28.97 
 
 
849 aa  213  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  26.62 
 
 
850 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1590  Rhs element Vgr protein  28.84 
 
 
946 aa  207  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1615  Rhs element Vgr protein  29.22 
 
 
946 aa  207  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1771  Rhs element Vgr protein  28.92 
 
 
946 aa  206  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156841  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  26.66 
 
 
957 aa  205  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  25.39 
 
 
892 aa  201  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  25.79 
 
 
895 aa  198  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  24.73 
 
 
853 aa  197  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  25.41 
 
 
843 aa  197  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  25.9 
 
 
843 aa  195  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  24.64 
 
 
852 aa  193  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  27.3 
 
 
847 aa  190  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  26.55 
 
 
1114 aa  187  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  25.89 
 
 
910 aa  187  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  25.76 
 
 
855 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  25.25 
 
 
1111 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  25.14 
 
 
1111 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  26.22 
 
 
902 aa  178  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  29.52 
 
 
618 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  26.59 
 
 
898 aa  174  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  29.44 
 
 
613 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  24.92 
 
 
1111 aa  173  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01531  Rhs element Vgr protein  28.13 
 
 
892 aa  172  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  24.24 
 
 
968 aa  171  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  25.08 
 
 
1111 aa  171  5e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  28.8 
 
 
618 aa  171  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  28.27 
 
 
616 aa  171  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  28.88 
 
 
661 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  28.88 
 
 
661 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  28.88 
 
 
661 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  29.08 
 
 
661 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  28.88 
 
 
661 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  28.88 
 
 
661 aa  169  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  28.88 
 
 
661 aa  169  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  26.81 
 
 
922 aa  168  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  24.73 
 
 
730 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  28.69 
 
 
661 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  28.08 
 
 
614 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  25.42 
 
 
847 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  25.13 
 
 
834 aa  158  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  25.13 
 
 
834 aa  158  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  25.13 
 
 
834 aa  158  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  24.86 
 
 
975 aa  157  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  28.01 
 
 
703 aa  157  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  25.97 
 
 
922 aa  157  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1615  putative Rhs element Vgr protein  26.68 
 
 
928 aa  156  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>