More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2922 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  49.88 
 
 
843 aa  771    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  50.12 
 
 
850 aa  813    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  62.09 
 
 
868 aa  1050    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  54.19 
 
 
957 aa  897    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  61.85 
 
 
895 aa  1053    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  85.58 
 
 
853 aa  1521    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  87.22 
 
 
853 aa  1539    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  60.87 
 
 
850 aa  1060    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  67.43 
 
 
1063 aa  1157    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  66.83 
 
 
1063 aa  1153    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  61.97 
 
 
895 aa  1056    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  66.76 
 
 
730 aa  986    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  65.98 
 
 
1074 aa  1144    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  82.38 
 
 
892 aa  1410    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  75.69 
 
 
923 aa  1321    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  43.66 
 
 
890 aa  681    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  67.91 
 
 
1059 aa  1162    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  61.96 
 
 
852 aa  1051    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  47.73 
 
 
910 aa  774    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  66.59 
 
 
1057 aa  1175    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  61.03 
 
 
895 aa  1045    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 
853 aa  1758    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0933  Rhs element Vgr protein, putative  48.24 
 
 
780 aa  684    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1531  Rhs element Vgr protein, putative  48.37 
 
 
780 aa  684    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398232  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  44.12 
 
 
961 aa  686    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  45.68 
 
 
869 aa  714    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  45.02 
 
 
875 aa  700    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  45.57 
 
 
871 aa  710    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  61.73 
 
 
895 aa  1050    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  85.67 
 
 
847 aa  1201    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  66.71 
 
 
1063 aa  1152    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  50.12 
 
 
850 aa  810    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  50.12 
 
 
850 aa  810    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  45.52 
 
 
855 aa  741    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  66.83 
 
 
1057 aa  1157    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  45.99 
 
 
835 aa  678    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  61.52 
 
 
891 aa  1040    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  49.1 
 
 
843 aa  751    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6904  Rhs element Vgr protein  43.9 
 
 
928 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  40.54 
 
 
958 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4173  type VI secretion system Vgr family protein  46.37 
 
 
784 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0636  Rhs element Vgr protein  40 
 
 
912 aa  572  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  32.22 
 
 
851 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  31.7 
 
 
853 aa  357  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  30.65 
 
 
933 aa  352  2e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  30.29 
 
 
911 aa  340  4e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  31.31 
 
 
918 aa  335  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  30.24 
 
 
886 aa  333  5e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  29.69 
 
 
898 aa  326  9e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  29.8 
 
 
975 aa  324  3e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  29.25 
 
 
901 aa  317  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  29.93 
 
 
834 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  29.93 
 
 
834 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  29.82 
 
 
834 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  30.96 
 
 
906 aa  304  6.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  30.84 
 
 
906 aa  303  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  33.33 
 
 
613 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  33.83 
 
 
616 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  27.47 
 
 
845 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  28.85 
 
 
968 aa  293  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  34.8 
 
 
618 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  28.2 
 
 
1094 aa  292  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  33.46 
 
 
618 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  26.99 
 
 
845 aa  289  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  29.49 
 
 
1019 aa  289  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  29.37 
 
 
822 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  28.59 
 
 
920 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  29.56 
 
 
842 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  28.99 
 
 
837 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  34.4 
 
 
661 aa  283  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  27.63 
 
 
843 aa  283  1e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  28.29 
 
 
840 aa  282  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  29.22 
 
 
885 aa  281  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  28.75 
 
 
1019 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  34.03 
 
 
661 aa  280  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  34.22 
 
 
661 aa  281  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  28.69 
 
 
902 aa  280  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  33.84 
 
 
661 aa  280  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  33.84 
 
 
661 aa  280  9e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  33.84 
 
 
661 aa  280  9e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  33.84 
 
 
661 aa  280  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  29.48 
 
 
918 aa  279  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  33.9 
 
 
661 aa  277  8e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  26.83 
 
 
1284 aa  270  7e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  28.08 
 
 
1284 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  29.62 
 
 
952 aa  268  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  33.52 
 
 
703 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  28.15 
 
 
847 aa  266  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  27.68 
 
 
928 aa  265  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  26.39 
 
 
962 aa  264  4e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  31.98 
 
 
614 aa  263  8e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  26.35 
 
 
1114 aa  263  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00004  Rhs element Vgr protein, putative  32.2 
 
 
748 aa  261  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  28.76 
 
 
1048 aa  261  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  27.84 
 
 
838 aa  258  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  28.59 
 
 
924 aa  258  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  27.9 
 
 
1111 aa  258  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  28.93 
 
 
920 aa  256  9e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  27.64 
 
 
979 aa  256  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  26.97 
 
 
846 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>