More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5366 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  44.61 
 
 		 920 aa  678    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  43.5 
 
 		 885 aa  691    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  46.22 
 
 		 837 aa  681    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  43.56 
 
 		 846 aa  661    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  48.97 
 
 		 843 aa  781    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  81.93 
 
 		 1284 aa  2150    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  43.65 
 
 		 941 aa  702    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  52.09 
 
 		 845 aa  843    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 1284 aa  2647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  43.56 
 
 		 918 aa  668    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  52.09 
 
 		 845 aa  845    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  42.91 
 
 		 840 aa  637    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  42.1 
 
 		 952 aa  626  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  42.06 
 
 		 924 aa  629  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  42.42 
 
 		 889 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  38.08 
 
 		 822 aa  528  1e-148  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  37 
 
 		 912 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  39.51 
 
 		 826 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  35.62 
 
 		 886 aa  474  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  34.76 
 
 		 1048 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  38.25 
 
 		 975 aa  459  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  35.01 
 
 		 862 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  36.02 
 
 		 901 aa  446  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  34.91 
 
 		 862 aa  443  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  42.24 
 
 		 1057 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  42.51 
 
 		 676 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  42.32 
 
 		 725 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  41.53 
 
 		 858 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  41.53 
 
 		 930 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  41.53 
 
 		 896 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  41.34 
 
 		 872 aa  395  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  42.8 
 
 		 775 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  40.31 
 
 		 1048 aa  397  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  42.61 
 
 		 775 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  42.61 
 
 		 775 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  42.61 
 
 		 775 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  42.61 
 
 		 775 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  42.61 
 
 		 775 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  41.68 
 
 		 724 aa  392  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  42.61 
 
 		 775 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  37.79 
 
 		 874 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  37.79 
 
 		 916 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  37.79 
 
 		 922 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  40.19 
 
 		 714 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  38.86 
 
 		 729 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  40.7 
 
 		 743 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  38.46 
 
 		 730 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  38.86 
 
 		 729 aa  373  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  39.81 
 
 		 540 aa  352  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  32.61 
 
 		 855 aa  346  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  38.89 
 
 		 1981 aa  343  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  32.82 
 
 		 968 aa  340  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  36.31 
 
 		 794 aa  339  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  31.91 
 
 		 875 aa  326  2e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  32.05 
 
 		 871 aa  325  3e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  31.92 
 
 		 869 aa  325  5e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  30.52 
 
 		 838 aa  317  7e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  28.77 
 
 		 841 aa  307  9.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  29.52 
 
 		 841 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  28.57 
 
 		 910 aa  301  4e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  29.12 
 
 		 958 aa  292  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  36.35 
 
 		 734 aa  288  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  36.35 
 
 		 734 aa  288  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  36.35 
 
 		 731 aa  288  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  35.83 
 
 		 757 aa  288  4e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  36.35 
 
 		 731 aa  288  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  36.35 
 
 		 734 aa  288  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  36.35 
 
 		 734 aa  288  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  36.35 
 
 		 734 aa  288  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  36.23 
 
 		 780 aa  288  5e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  30.46 
 
 		 890 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  28.52 
 
 		 868 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  28.67 
 
 		 1074 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  27.65 
 
 		 895 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  34.5 
 
 		 841 aa  285  3.0000000000000004e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  28.3 
 
 		 1057 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  36.15 
 
 		 734 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  31.75 
 
 		 834 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  32.11 
 
 		 834 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1019 aa  285  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  36.02 
 
 		 734 aa  285  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  27.54 
 
 		 895 aa  284  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  35.83 
 
 		 734 aa  283  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  27.84 
 
 		 1063 aa  282  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  31.98 
 
 		 834 aa  283  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  27.87 
 
 		 1063 aa  282  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  28.54 
 
 		 892 aa  282  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  27.66 
 
 		 895 aa  281  4e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1019 aa  281  6e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  27.58 
 
 		 853 aa  281  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  35.6 
 
 		 796 aa  280  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  27.71 
 
 		 1063 aa  280  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  27.98 
 
 		 1057 aa  280  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  26.96 
 
 		 923 aa  278  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  35.92 
 
 		 774 aa  277  7e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  27.72 
 
 		 895 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  37.44 
 
 		 785 aa  276  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  27.65 
 
 		 1059 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  35.58 
 
 		 788 aa  276  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  36.42 
 
 		 687 aa  276  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>