More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0985 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
843 aa  1744    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  44.62 
 
 
846 aa  697    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  43.04 
 
 
840 aa  684    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  44.31 
 
 
826 aa  676    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  41.98 
 
 
941 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  42.6 
 
 
822 aa  636    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  75.68 
 
 
845 aa  1324    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  48.97 
 
 
1284 aa  781    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  42.79 
 
 
920 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  74.02 
 
 
845 aa  1299    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  48.01 
 
 
1284 aa  758    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  42.79 
 
 
885 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  42.73 
 
 
837 aa  630  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  41.65 
 
 
918 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  42.33 
 
 
952 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  42.05 
 
 
889 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  41.55 
 
 
924 aa  596  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  39.17 
 
 
912 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  39.66 
 
 
975 aa  538  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  39.71 
 
 
901 aa  532  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  40.93 
 
 
886 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  36.82 
 
 
1048 aa  502  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  38.3 
 
 
862 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  37.75 
 
 
862 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  46.64 
 
 
676 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  42.47 
 
 
1057 aa  450  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  46.58 
 
 
725 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  43.01 
 
 
1048 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  43.29 
 
 
872 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  43.11 
 
 
930 aa  445  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  43.11 
 
 
858 aa  445  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  43.11 
 
 
896 aa  445  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  35.06 
 
 
855 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  43.88 
 
 
775 aa  429  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  43.71 
 
 
775 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  43.88 
 
 
775 aa  429  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  42.51 
 
 
714 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  43.71 
 
 
775 aa  426  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  43.71 
 
 
775 aa  426  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  43.71 
 
 
775 aa  426  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  43.71 
 
 
775 aa  426  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  41.29 
 
 
724 aa  415  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  34.6 
 
 
968 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  39.5 
 
 
874 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  39.5 
 
 
916 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  39.5 
 
 
922 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  41.68 
 
 
743 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  41.06 
 
 
729 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  40.88 
 
 
729 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  32.86 
 
 
910 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  42.67 
 
 
540 aa  392  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  39.96 
 
 
730 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  41.29 
 
 
1981 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  38.42 
 
 
794 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  34.4 
 
 
890 aa  362  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  31.07 
 
 
838 aa  345  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  33.51 
 
 
834 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  33.51 
 
 
834 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  33.51 
 
 
834 aa  339  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  29.79 
 
 
841 aa  328  4.0000000000000003e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  34.72 
 
 
841 aa  326  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  34.72 
 
 
841 aa  326  1e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  36.04 
 
 
780 aa  313  7.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  35.23 
 
 
796 aa  313  7.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  37.14 
 
 
778 aa  313  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  35.95 
 
 
731 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  35.95 
 
 
734 aa  312  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  35.95 
 
 
734 aa  312  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  35.95 
 
 
734 aa  312  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  35.74 
 
 
734 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  35.95 
 
 
734 aa  312  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  35.95 
 
 
734 aa  312  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  35.76 
 
 
731 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1944  putative VGR-related protein  44.92 
 
 
865 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.463314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  36.61 
 
 
794 aa  306  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  34.4 
 
 
777 aa  300  6e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  35.85 
 
 
572 aa  299  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  35.75 
 
 
756 aa  298  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  28.3 
 
 
869 aa  298  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  35.11 
 
 
907 aa  298  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  35.4 
 
 
774 aa  298  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  35.58 
 
 
748 aa  297  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  35.11 
 
 
755 aa  297  5e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  35.74 
 
 
792 aa  297  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  36.02 
 
 
757 aa  297  6e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  36.02 
 
 
734 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  35.22 
 
 
788 aa  296  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  35.82 
 
 
734 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0958  putative VGR-related protein  43.65 
 
 
907 aa  294  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677133  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  28.46 
 
 
871 aa  293  7e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  35.42 
 
 
785 aa  293  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  28.79 
 
 
852 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  32.6 
 
 
842 aa  291  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  28.42 
 
 
1057 aa  290  9e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  34.66 
 
 
687 aa  289  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  32.46 
 
 
1019 aa  289  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  33.93 
 
 
646 aa  287  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03020  putative VGR-related protein  42.43 
 
 
885 aa  287  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.318268 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  33.95 
 
 
643 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  28.36 
 
 
1074 aa  284  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.321828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>