More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4983 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  69.63 
 
 		 618 aa  899    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 614 aa  1274    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  60.93 
 
 		 613 aa  798    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  62.91 
 
 		 616 aa  824    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  67.67 
 
 		 618 aa  879    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  54.58 
 
 		 853 aa  589  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  53.44 
 
 		 851 aa  579  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  49.73 
 
 		 661 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  49.37 
 
 		 661 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  49.37 
 
 		 661 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  49.19 
 
 		 661 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  49.37 
 
 		 661 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  49.19 
 
 		 661 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  49.37 
 
 		 661 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  49.37 
 
 		 661 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  46.02 
 
 		 703 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  36.38 
 
 		 683 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  36.53 
 
 		 683 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  38.19 
 
 		 788 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  37.69 
 
 		 774 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  37.69 
 
 		 748 aa  386  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  38.73 
 
 		 907 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  38.88 
 
 		 756 aa  383  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  38.84 
 
 		 572 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  38.6 
 
 		 755 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  37.06 
 
 		 778 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  37.84 
 
 		 730 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  36.72 
 
 		 794 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  36.35 
 
 		 741 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  35.99 
 
 		 741 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  35.07 
 
 		 771 aa  370  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  36.6 
 
 		 777 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  35.48 
 
 		 646 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  36.02 
 
 		 689 aa  362  9e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  37.63 
 
 		 757 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  34.3 
 
 		 643 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  34.75 
 
 		 689 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  35.64 
 
 		 741 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  36.41 
 
 		 780 aa  356  7.999999999999999e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  35.52 
 
 		 645 aa  356  7.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  36.6 
 
 		 792 aa  355  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  36.83 
 
 		 785 aa  353  7e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  36.79 
 
 		 734 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  36.79 
 
 		 734 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  36.79 
 
 		 734 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  36.79 
 
 		 731 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  36.79 
 
 		 734 aa  347  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  36.79 
 
 		 734 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  36.79 
 
 		 734 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  37.57 
 
 		 734 aa  347  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  37.21 
 
 		 734 aa  346  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  34.96 
 
 		 712 aa  345  1e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  36.97 
 
 		 731 aa  345  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  35.66 
 
 		 875 aa  340  4e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  35.49 
 
 		 871 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  31.97 
 
 		 618 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  35.34 
 
 		 869 aa  336  7.999999999999999e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  32.58 
 
 		 743 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  36.22 
 
 		 841 aa  333  7.000000000000001e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  36.22 
 
 		 841 aa  333  7.000000000000001e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  32.55 
 
 		 730 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  33.82 
 
 		 687 aa  332  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  34.58 
 
 		 796 aa  332  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  36.22 
 
 		 838 aa  331  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  34.97 
 
 		 754 aa  331  3e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  36.02 
 
 		 841 aa  330  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  32.32 
 
 		 729 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  32.15 
 
 		 729 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  33.94 
 
 		 619 aa  323  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  32.97 
 
 		 692 aa  320  6e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  33.33 
 
 		 735 aa  320  7e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  33.27 
 
 		 692 aa  317  3e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  35.35 
 
 		 901 aa  317  4e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  36.16 
 
 		 855 aa  317  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  34.55 
 
 		 910 aa  317  6e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00004  Rhs element Vgr protein, putative  33.77 
 
 		 748 aa  316  7e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  34.83 
 
 		 754 aa  313  6.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  35.35 
 
 		 975 aa  313  6.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  35.44 
 
 		 886 aa  313  7.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  34.15 
 
 		 724 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2081  Rhs element Vgr protein  32.91 
 
 		 763 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  34.31 
 
 		 794 aa  310  4e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0796  Rhs element Vgr protein  32.91 
 
 		 763 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0707  Rhs element Vgr protein  32.91 
 
 		 763 aa  310  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  33.7 
 
 		 753 aa  310  6.999999999999999e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  33.77 
 
 		 732 aa  309  8e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  35.57 
 
 		 697 aa  309  9e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  33.99 
 
 		 1981 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  33.71 
 
 		 771 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0797  Rhs element Vgr protein  32.79 
 
 		 762 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  35.17 
 
 		 890 aa  306  7e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  32.08 
 
 		 680 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0446  Rhs element Vgr protein  32.6 
 
 		 762 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.232565  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  32.67 
 
 		 740 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2082  Rhs element Vgr protein  32.6 
 
 		 762 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1035  Rhs element Vgr protein  32.6 
 
 		 762 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508183  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2009  Rhs element Vgr protein  32.6 
 
 		 762 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0740  Rhs element Vgr protein  32.6 
 
 		 762 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0709  Rhs element Vgr protein  32.6 
 
 		 762 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.730029  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  32.67 
 
 		 740 aa  306  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>