More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3177 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  100 
 
 		 697 aa  1445    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  51.35 
 
 		 709 aa  705    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  36.07 
 
 		 703 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  36.61 
 
 		 706 aa  411  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  34.2 
 
 		 692 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  34.67 
 
 		 771 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  33.19 
 
 		 741 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  33.06 
 
 		 741 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  33.81 
 
 		 692 aa  388  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  32.64 
 
 		 741 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  33.98 
 
 		 774 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  33.72 
 
 		 754 aa  382  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  33.89 
 
 		 754 aa  376  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  32.61 
 
 		 689 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  33.48 
 
 		 741 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  35.28 
 
 		 661 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  36.5 
 
 		 683 aa  372  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  33.75 
 
 		 748 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  33.94 
 
 		 730 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  33.14 
 
 		 741 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  33.94 
 
 		 788 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  32.88 
 
 		 755 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  34.14 
 
 		 767 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  37.04 
 
 		 683 aa  368  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  36.42 
 
 		 678 aa  364  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  33.64 
 
 		 767 aa  364  3e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  32.83 
 
 		 689 aa  363  6e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  33.28 
 
 		 713 aa  363  7.0000000000000005e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  35.21 
 
 		 661 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  35.21 
 
 		 661 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  35.21 
 
 		 661 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  35.21 
 
 		 661 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  34.69 
 
 		 783 aa  362  9e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  39.47 
 
 		 618 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  35.2 
 
 		 713 aa  362  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830075 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  35.05 
 
 		 661 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  35.21 
 
 		 661 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  35.05 
 
 		 661 aa  360  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0243  type VI secretion system Vgr family protein  34.89 
 
 		 713 aa  360  6e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0245  type VI secretion system Vgr family protein  34.89 
 
 		 713 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  33.29 
 
 		 907 aa  358  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  35.86 
 
 		 668 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  32.43 
 
 		 756 aa  357  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  33.89 
 
 		 704 aa  356  6.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  35.48 
 
 		 669 aa  356  6.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  34.68 
 
 		 702 aa  355  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  36.96 
 
 		 609 aa  351  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  36.58 
 
 		 668 aa  352  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  35.59 
 
 		 616 aa  350  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  35.22 
 
 		 668 aa  350  5e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  32.69 
 
 		 778 aa  350  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  36.63 
 
 		 615 aa  349  8e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  35.47 
 
 		 740 aa  349  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  31.56 
 
 		 771 aa  349  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  35.08 
 
 		 740 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  36.07 
 
 		 694 aa  348  2e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  36.05 
 
 		 680 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  33.9 
 
 		 693 aa  347  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  34.29 
 
 		 896 aa  345  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  34.29 
 
 		 858 aa  345  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  34.29 
 
 		 930 aa  345  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  36.64 
 
 		 790 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  31.56 
 
 		 682 aa  344  4e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  37.19 
 
 		 618 aa  344  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  36.03 
 
 		 618 aa  343  5e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  35.1 
 
 		 678 aa  343  7e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  36.24 
 
 		 702 aa  343  7e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  32.78 
 
 		 731 aa  343  8e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  32.84 
 
 		 678 aa  342  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  35.8 
 
 		 617 aa  342  2e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  35.62 
 
 		 656 aa  341  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  35.7 
 
 		 680 aa  342  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  34.97 
 
 		 684 aa  340  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  33.81 
 
 		 872 aa  340  5e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  36.7 
 
 		 617 aa  339  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  33.03 
 
 		 794 aa  338  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  35.9 
 
 		 702 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 734 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 734 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 731 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 734 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 734 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  36.87 
 
 		 613 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 734 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  33.33 
 
 		 734 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1638  type VI secretion system Vgr family protein  35.73 
 
 		 702 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674786  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  32.33 
 
 		 734 aa  337  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  35.7 
 
 		 680 aa  336  9e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  35.63 
 
 		 610 aa  335  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  36.09 
 
 		 617 aa  335  1e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  35.06 
 
 		 619 aa  336  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  36.35 
 
 		 617 aa  334  3e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  35.94 
 
 		 616 aa  334  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  35.92 
 
 		 618 aa  333  6e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  31.51 
 
 		 792 aa  333  6e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  34.36 
 
 		 763 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  36.16 
 
 		 732 aa  332  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  33.87 
 
 		 643 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  32.03 
 
 		 734 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  32.88 
 
 		 646 aa  332  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>