More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A1057 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
661 aa  1367    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  99.24 
 
 
661 aa  1362    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
661 aa  1367    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
661 aa  1367    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  97.13 
 
 
661 aa  1333    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  100 
 
 
661 aa  1367    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  99.7 
 
 
661 aa  1367    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  55.72 
 
 
703 aa  763    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  99.55 
 
 
661 aa  1365    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  52.78 
 
 
616 aa  601  1e-170  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  47.32 
 
 
613 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  48.25 
 
 
618 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  48.25 
 
 
618 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  49.37 
 
 
614 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  45.33 
 
 
853 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  46.03 
 
 
851 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  39.59 
 
 
741 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  39.7 
 
 
741 aa  425  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  36.93 
 
 
689 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  35.83 
 
 
683 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  38.58 
 
 
741 aa  410  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  36.29 
 
 
683 aa  412  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  37.52 
 
 
771 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  37.04 
 
 
777 aa  405  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  38.75 
 
 
689 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  37.79 
 
 
646 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  37.48 
 
 
643 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  38.02 
 
 
756 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  38.47 
 
 
907 aa  399  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  37.25 
 
 
755 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  35.48 
 
 
730 aa  390  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  38.82 
 
 
572 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  37.5 
 
 
788 aa  389  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  36.86 
 
 
748 aa  388  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  37.25 
 
 
778 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  37.18 
 
 
774 aa  388  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  35.2 
 
 
734 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  35.2 
 
 
734 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  37.25 
 
 
794 aa  385  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  35.2 
 
 
734 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  37.73 
 
 
712 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  35.34 
 
 
731 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  35.2 
 
 
734 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  35.98 
 
 
645 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  36.89 
 
 
780 aa  385  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  35.2 
 
 
734 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  37.34 
 
 
734 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  35.2 
 
 
734 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  37.17 
 
 
734 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  35 
 
 
709 aa  382  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  34.95 
 
 
731 aa  378  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  36.91 
 
 
757 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2360  Rhs element Vgr protein  33.74 
 
 
618 aa  375  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  37.46 
 
 
785 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  36.62 
 
 
792 aa  369  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00004  Rhs element Vgr protein, putative  35.53 
 
 
748 aa  367  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  35.1 
 
 
714 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  39.53 
 
 
794 aa  365  1e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  33.71 
 
 
724 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  37.06 
 
 
743 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  35.75 
 
 
796 aa  357  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  37.73 
 
 
875 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  37.17 
 
 
871 aa  353  7e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  34.71 
 
 
769 aa  352  8.999999999999999e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  33.94 
 
 
767 aa  350  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  33.79 
 
 
767 aa  348  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  37.43 
 
 
869 aa  347  3e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  35.21 
 
 
697 aa  346  8.999999999999999e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  33.38 
 
 
692 aa  343  5e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  35.24 
 
 
725 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  33.33 
 
 
619 aa  342  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  36.35 
 
 
753 aa  341  2e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  35.3 
 
 
687 aa  341  2.9999999999999998e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2447  type VI secretion system Vgr family protein  33.49 
 
 
735 aa  339  9.999999999999999e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.764507  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  34.63 
 
 
1981 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  32.22 
 
 
692 aa  336  9e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  37.16 
 
 
841 aa  335  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  33.28 
 
 
730 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  37.16 
 
 
841 aa  335  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  34.96 
 
 
676 aa  335  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  37.48 
 
 
855 aa  335  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  37.23 
 
 
775 aa  334  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  37.23 
 
 
775 aa  334  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  37.23 
 
 
775 aa  334  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  37.23 
 
 
775 aa  334  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  34.23 
 
 
792 aa  333  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  37.23 
 
 
775 aa  333  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  37.23 
 
 
775 aa  333  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  37.16 
 
 
838 aa  333  7.000000000000001e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  33.33 
 
 
729 aa  333  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  36.97 
 
 
841 aa  331  2e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  33.18 
 
 
754 aa  332  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  37.05 
 
 
775 aa  332  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3430  putative VGR-related protein  32.83 
 
 
921 aa  331  3e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  33.01 
 
 
729 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  32.94 
 
 
896 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  32.94 
 
 
858 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  32.94 
 
 
930 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  36.86 
 
 
910 aa  327  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  33.23 
 
 
872 aa  327  6e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>