More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6904 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  44.02 
 
 		 1059 aa  647    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  43.69 
 
 		 1063 aa  652    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2142  Rhs element Vgr protein  62.12 
 
 		 961 aa  1182    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  43.34 
 
 		 1057 aa  669    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0636  Rhs element Vgr protein  71.83 
 
 		 912 aa  1345    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4173  type VI secretion system Vgr family protein  54.04 
 
 		 784 aa  838    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  43.57 
 
 		 1063 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  44.25 
 
 		 1074 aa  657    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  42.81 
 
 		 892 aa  655    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6904  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 928 aa  1917    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  44.52 
 
 		 852 aa  638    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  43.68 
 
 		 853 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  43.8 
 
 		 1063 aa  654    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  43.91 
 
 		 1057 aa  655    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  43.34 
 
 		 853 aa  634  1e-180  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0933  Rhs element Vgr protein, putative  46.6 
 
 		 780 aa  634  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218046  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1531  Rhs element Vgr protein, putative  46.6 
 
 		 780 aa  634  1e-180  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398232  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  42.72 
 
 		 923 aa  631  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  42.56 
 
 		 850 aa  624  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  40.81 
 
 		 895 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  44.02 
 
 		 853 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  41.85 
 
 		 868 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  40.59 
 
 		 895 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  40.7 
 
 		 895 aa  611  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  40.7 
 
 		 891 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  40.13 
 
 		 895 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  39.8 
 
 		 957 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  44.7 
 
 		 730 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  41.19 
 
 		 843 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1281  type VI secretion system Vgr family protein  41.43 
 
 		 843 aa  538  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435024  normal  0.300855 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  44.02 
 
 		 847 aa  531  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  38.22 
 
 		 850 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  38.22 
 
 		 850 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  38.22 
 
 		 850 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2225  Rhs element Vgr protein  37.57 
 
 		 835 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  35.43 
 
 		 910 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  33.45 
 
 		 871 aa  421  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  33.49 
 
 		 869 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  33.41 
 
 		 875 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  34.22 
 
 		 890 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  32.9 
 
 		 855 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  32.27 
 
 		 958 aa  395  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  26.84 
 
 		 851 aa  230  8e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  27.65 
 
 		 886 aa  219  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  26.65 
 
 		 885 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  26.53 
 
 		 918 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  27.68 
 
 		 898 aa  211  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  25.78 
 
 		 853 aa  208  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  25.48 
 
 		 911 aa  208  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  27.88 
 
 		 975 aa  206  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5267  Rhs element Vgr protein  28.05 
 
 		 822 aa  206  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  25.84 
 
 		 842 aa  206  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  27.17 
 
 		 822 aa  201  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  24.33 
 
 		 933 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  26.51 
 
 		 901 aa  197  8.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  26.79 
 
 		 920 aa  194  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  25.51 
 
 		 968 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  25.7 
 
 		 906 aa  188  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6106  type VI secretion system Vgr family protein  27.68 
 
 		 952 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894358  normal  0.984753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  25.92 
 
 		 837 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  26.05 
 
 		 918 aa  185  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  25.48 
 
 		 906 aa  184  8.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2595  Rhs element Vgr protein  24.86 
 
 		 912 aa  183  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.43186  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  25.86 
 
 		 1006 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1019 aa  181  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  26.76 
 
 		 1284 aa  181  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  25.05 
 
 		 1114 aa  180  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  24.45 
 
 		 1048 aa  180  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_003296  RS00397  putative VGR-related protein  26.21 
 
 		 908 aa  179  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6610  type VI secretion system Vgr family protein  30.45 
 
 		 924 aa  179  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  26.06 
 
 		 1284 aa  179  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3640  type VI secretion system Vgr family protein  25.55 
 
 		 941 aa  178  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  23.9 
 
 		 862 aa  174  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0958  putative VGR-related protein  26.63 
 
 		 907 aa  173  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  24.49 
 
 		 1019 aa  173  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  26.3 
 
 		 920 aa  172  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  25.66 
 
 		 840 aa  171  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  25.67 
 
 		 920 aa  170  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6429  type VI secretion system Vgr family protein  25.16 
 
 		 955 aa  170  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.727988 
 
 
-
 
NC_003296  RS03020  putative VGR-related protein  26.91 
 
 		 885 aa  169  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.318268 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  23.68 
 
 		 862 aa  169  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3371  type VI secretion system Vgr family protein  26.23 
 
 		 922 aa  168  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  24.29 
 
 		 1111 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  27.13 
 
 		 895 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  24.13 
 
 		 1111 aa  165  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  25.74 
 
 		 902 aa  164  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  24.19 
 
 		 1111 aa  163  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5209  Rhs element Vgr protein  26.05 
 
 		 922 aa  162  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  25.41 
 
 		 618 aa  161  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  23.92 
 
 		 1111 aa  161  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  25.93 
 
 		 616 aa  160  8e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1411  Rhs element Vgr protein  25.82 
 
 		 956 aa  160  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6418  Rhs element Vgr protein  25.82 
 
 		 956 aa  160  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.149183 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1944  putative VGR-related protein  26.31 
 
 		 865 aa  160  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.463314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  25.35 
 
 		 847 aa  160  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  26.49 
 
 		 614 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  25.32 
 
 		 846 aa  159  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  24.66 
 
 		 613 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  25.19 
 
 		 845 aa  157  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  24.66 
 
 		 845 aa  155  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>