More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1374 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1613  Rhs element Vgr protein  48 
 
 		 858 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1374  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 916 aa  1845    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1486  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 922 aa  1380    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0129  Rhs element Vgr protein  48.3 
 
 		 872 aa  666    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176404  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6682  type VI secretion system Vgr family protein  48.8 
 
 		 1057 aa  673    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1934  hypothetical protein  100 
 
 		 874 aa  1380    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.652792  normal  0.85907 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3019  type VI secretion system Vgr family protein  48.95 
 
 		 1048 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0143  Rhs element Vgr protein  48 
 
 		 896 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420233  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0166  Rhs element Vgr protein  48 
 
 		 930 aa  662    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275346  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4429  Rhs element Vgr protein  44.84 
 
 		 724 aa  586  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  43.63 
 
 		 725 aa  554  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6124  type VI secretion system Vgr family protein  41.81 
 
 		 714 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.029227  normal  0.478766 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  44.07 
 
 		 1981 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1281  Rhs element Vgr protein  44.99 
 
 		 676 aa  534  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1901  Rhs element Vgr protein  46.67 
 
 		 775 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1703  Rhs element Vgr protein  46.67 
 
 		 775 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2174  Rhs element Vgr protein  46.67 
 
 		 775 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1199  Rhs element Vgr protein  46.67 
 
 		 775 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0251  Rhs element Vgr protein  46.67 
 
 		 775 aa  530  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.628249  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0912  Rhs element Vgr protein  46.67 
 
 		 775 aa  529  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0342  Rhs element Vgr protein  46.48 
 
 		 775 aa  529  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795549  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  42.06 
 
 		 794 aa  502  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0310  Rhs family protein  39.02 
 
 		 729 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261642  normal  0.473286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0329  Rhs family protein  43.91 
 
 		 743 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312709  normal  0.985789 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0319  Rhs family protein  39.02 
 
 		 729 aa  496  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.946115  normal  0.027027 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0322  Rhs-family protein  38.28 
 
 		 730 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1827  Rhs element Vgr protein  47.34 
 
 		 540 aa  476  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.336809 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  36.2 
 
 		 731 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  35.09 
 
 		 734 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  35.09 
 
 		 734 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  35.09 
 
 		 734 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  35.09 
 
 		 731 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1505  type VI secretion system Vgr family protein  42.49 
 
 		 826 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.483265 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  35.09 
 
 		 734 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  35.09 
 
 		 734 aa  424  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  39.01 
 
 		 757 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  34.94 
 
 		 734 aa  422  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  35.09 
 
 		 734 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3479  Rhs element Vgr protein  39.62 
 
 		 845 aa  412  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.380247 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  34.81 
 
 		 734 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  38.46 
 
 		 796 aa  406  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0985  Rhs element Vgr protein  39.5 
 
 		 843 aa  406  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3914  type VI secretion system Vgr family protein  38.2 
 
 		 845 aa  403  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.120628  normal  0.788068 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1679  type VI secretion system Vgr family protein  38.45 
 
 		 1048 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  35.76 
 
 		 777 aa  402  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2254  type VI secretion system Vgr family protein  40.66 
 
 		 862 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  35.66 
 
 		 778 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0065  type VI secretion system Vgr family protein  35.89 
 
 		 822 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  34.68 
 
 		 748 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0300  type VI secretion system Vgr family protein  35.66 
 
 		 794 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  34.07 
 
 		 780 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1930  type VI secretion system Vgr family protein  40.46 
 
 		 862 aa  389  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.931752  normal  0.0420074 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  33.04 
 
 		 774 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  34.44 
 
 		 788 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  35.44 
 
 		 689 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  34.85 
 
 		 689 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  36.01 
 
 		 646 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  33.65 
 
 		 741 aa  376  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  33.88 
 
 		 712 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  34.2 
 
 		 730 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5366  Rhs element Vgr protein  38.39 
 
 		 1284 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.317319  normal  0.534977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  36.26 
 
 		 643 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  33.65 
 
 		 741 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  33.29 
 
 		 756 aa  375  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  35.33 
 
 		 907 aa  372  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3752  Rhs element Vgr protein  33.15 
 
 		 755 aa  369  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.617325 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2047  Rhs element Vgr protein  38.07 
 
 		 572 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2788  type VI secretion system Vgr family protein  35.29 
 
 		 889 aa  365  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.154315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0698  type VI secretion system Vgr family protein  35.38 
 
 		 792 aa  363  6e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  33.44 
 
 		 741 aa  360  9e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  33.66 
 
 		 785 aa  359  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  35.09 
 
 		 683 aa  356  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  36.87 
 
 		 687 aa  356  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1932  type VI secretion system Vgr family protein  34.78 
 
 		 918 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0481  Rhs element Vgr protein  39.06 
 
 		 841 aa  354  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3347  Rhs element Vgr protein  39.06 
 
 		 841 aa  354  4e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.57735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5197  type VI secretion system Vgr family protein  34.78 
 
 		 837 aa  354  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0918871 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  34.78 
 
 		 885 aa  354  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3015  Rhs element Vgr protein  35.35 
 
 		 645 aa  353  5.9999999999999994e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  38.48 
 
 		 841 aa  353  8e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5469  type VI secretion system Vgr family protein  38.65 
 
 		 1284 aa  353  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.387829  normal  0.0913862 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5744  type VI secretion system Vgr family protein  34.6 
 
 		 920 aa  353  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  38.13 
 
 		 975 aa  352  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  38.98 
 
 		 838 aa  351  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  35.8 
 
 		 771 aa  350  6e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  37.94 
 
 		 901 aa  349  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  33.59 
 
 		 683 aa  345  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  35.03 
 
 		 886 aa  340  5.9999999999999996e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  37.29 
 
 		 767 aa  340  9e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0449  type VI secretion system Vgr family protein  35 
 
 		 840 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.462145  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4187  Rhs element Vgr protein  33.23 
 
 		 769 aa  338  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  36.78 
 
 		 767 aa  332  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2455  Rhs element Vgr protein  33.82 
 
 		 783 aa  327  8.000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0279877  normal  0.549341 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  34.09 
 
 		 619 aa  323  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7022  type VI secretion system Vgr family protein  32.13 
 
 		 846 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  33.18 
 
 		 661 aa  320  6e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  32.36 
 
 		 661 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  32.36 
 
 		 661 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  32.36 
 
 		 661 aa  318  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  33.73 
 
 		 703 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>