More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2696 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  81.89 
 
 		 619 aa  1056    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  73.19 
 
 		 656 aa  934    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  84.75 
 
 		 617 aa  1085    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  78.12 
 
 		 618 aa  1019    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  51.19 
 
 		 740 aa  657    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  78.7 
 
 		 610 aa  991    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  94.97 
 
 		 616 aa  1217    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  72.89 
 
 		 655 aa  928    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  69.14 
 
 		 678 aa  924    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  51.19 
 
 		 740 aa  657    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  82.66 
 
 		 617 aa  1085    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  83.47 
 
 		 617 aa  1097    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  100 
 
 		 615 aa  1276    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  81.46 
 
 		 678 aa  934    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  89.43 
 
 		 609 aa  1151    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  83.47 
 
 		 617 aa  1095    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  52.08 
 
 		 741 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  52.08 
 
 		 741 aa  632  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  50.49 
 
 		 732 aa  610  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  46.7 
 
 		 725 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  46.29 
 
 		 687 aa  560  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  46.29 
 
 		 687 aa  560  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  47.13 
 
 		 706 aa  561  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  46.29 
 
 		 687 aa  560  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  45.56 
 
 		 694 aa  556  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  46.08 
 
 		 1095 aa  553  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  46.07 
 
 		 723 aa  552  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  42.75 
 
 		 682 aa  535  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  43.74 
 
 		 1017 aa  532  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  44.09 
 
 		 694 aa  520  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  43.44 
 
 		 699 aa  512  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  42.97 
 
 		 655 aa  510  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  45.21 
 
 		 706 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  42.47 
 
 		 713 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  43.6 
 
 		 704 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2557  type VI secretion system Vgr family protein  41.9 
 
 		 726 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482945  normal  0.0643046 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3234  type VI secretion system Vgr family protein  40 
 
 		 722 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2371  Rhs element Vgr protein  40.13 
 
 		 725 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3386  vgrG protein  39.59 
 
 		 725 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160309  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2117  Rhs element Vgr protein  39.45 
 
 		 722 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2614  vgrG protein  38.4 
 
 		 722 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0110775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2858  type VI secretion system Vgr family protein  42.23 
 
 		 692 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374803  normal  0.207801 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  41.33 
 
 		 702 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  40.56 
 
 		 727 aa  467  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1638  type VI secretion system Vgr family protein  41.33 
 
 		 702 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0243  type VI secretion system Vgr family protein  41.67 
 
 		 713 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4049  vgrG protein  39.38 
 
 		 771 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.253476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0245  type VI secretion system Vgr family protein  41.67 
 
 		 713 aa  464  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  41.5 
 
 		 713 aa  463  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830075 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  40.72 
 
 		 706 aa  464  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  41.16 
 
 		 702 aa  462  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  40.16 
 
 		 697 aa  459  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  43.4 
 
 		 633 aa  458  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  43.4 
 
 		 633 aa  458  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  43.21 
 
 		 633 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  43.02 
 
 		 633 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  45.31 
 
 		 1019 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  45.1 
 
 		 842 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  39.75 
 
 		 692 aa  423  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  43.67 
 
 		 1019 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  38.25 
 
 		 692 aa  411  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  40.32 
 
 		 754 aa  401  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  37.35 
 
 		 754 aa  395  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  38.43 
 
 		 771 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  36.35 
 
 		 680 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  36.36 
 
 		 680 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  36.77 
 
 		 790 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  36.51 
 
 		 709 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  36.19 
 
 		 694 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  35.62 
 
 		 680 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  36.83 
 
 		 678 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  35.3 
 
 		 680 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  36.55 
 
 		 693 aa  369  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  35.34 
 
 		 684 aa  365  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  34.52 
 
 		 702 aa  364  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  35.53 
 
 		 808 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  35.38 
 
 		 688 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  36.66 
 
 		 741 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  33.71 
 
 		 683 aa  356  7.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  35.22 
 
 		 763 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  35.31 
 
 		 680 aa  353  5e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  36.8 
 
 		 741 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  37.57 
 
 		 668 aa  347  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  37.25 
 
 		 668 aa  347  4e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  36.25 
 
 		 741 aa  346  7e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  33.65 
 
 		 689 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  35.54 
 
 		 671 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  36.52 
 
 		 689 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  38.73 
 
 		 668 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  38.43 
 
 		 669 aa  342  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  34.04 
 
 		 683 aa  342  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3949  Rhs element Vgr protein  36.89 
 
 		 691 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  33.84 
 
 		 771 aa  338  9.999999999999999e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0153  Rhs element Vgr protein  37.12 
 
 		 689 aa  337  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  36.63 
 
 		 697 aa  335  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  33.49 
 
 		 703 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  36.62 
 
 		 741 aa  334  3e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  37.84 
 
 		 968 aa  329  9e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3482  Rhs element Vgr protein  36.15 
 
 		 675 aa  325  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192027  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3392  vgrG protein  36.3 
 
 		 695 aa  323  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.92482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>