More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0696 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0648  type VI secretion system Vgr family protein  50.49 
 
 		 609 aa  635    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1162  type VI secretion system Vgr family protein  51.83 
 
 		 617 aa  652    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.754803  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0328  Rhs element Vgr protein  77.63 
 
 		 740 aa  1003    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0418  type VI secretion system Vgr family protein  53.44 
 
 		 617 aa  645    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  99.73 
 
 		 741 aa  1538    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0345  type VI secretion system Vgr family protein  53.53 
 
 		 619 aa  635    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0401  type VI secretion system Vgr family protein  78.18 
 
 		 740 aa  1005    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  100 
 
 		 741 aa  1541    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2559  type VI secretion system Vgr family protein  53.97 
 
 		 618 aa  637    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0339  putative VgrG protein  81.28 
 
 		 732 aa  987    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3533  type VI secretion system Vgr family protein  50.42 
 
 		 725 aa  637    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1502  type VI secretion system Vgr family protein  53.44 
 
 		 617 aa  647    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2696  type VI secretion system Vgr family protein  52.08 
 
 		 615 aa  632  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.187576  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1607  type VI secretion system Vgr family protein  52.77 
 
 		 616 aa  635  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0053  type VI secretion system Vgr family protein  51.3 
 
 		 617 aa  620  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4257  type VI secretion system Vgr family protein  53.87 
 
 		 610 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  44.24 
 
 		 713 aa  608  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  45.07 
 
 		 678 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  45.45 
 
 		 678 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2188  type VI secretion system Vgr family protein  50.73 
 
 		 656 aa  593  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.33539  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1234  Vgr family type VI secretion system  43.12 
 
 		 704 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.270466 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3454  type VI secretion system Vgr family protein  48.36 
 
 		 655 aa  587  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0243  type VI secretion system Vgr family protein  43.34 
 
 		 713 aa  579  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0245  type VI secretion system Vgr family protein  43.34 
 
 		 713 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0251  type VI secretion system Vgr family protein  43.06 
 
 		 713 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830075 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2064  type VI secretion system Vgr family protein  44.25 
 
 		 702 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.201838  normal  0.0713545 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2202  type VI secretion system Vgr family protein  43.51 
 
 		 702 aa  570  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0264417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1638  type VI secretion system Vgr family protein  43.66 
 
 		 702 aa  570  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.674786  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3077  type VI secretion system Vgr family protein  47.86 
 
 		 633 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0616  type VI secretion system Vgr family protein  47.86 
 
 		 633 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0499415  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0649  type VI secretion system Vgr family protein  47.68 
 
 		 633 aa  537  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0587  type VI secretion system Vgr family protein  47.68 
 
 		 633 aa  536  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2557  type VI secretion system Vgr family protein  38.92 
 
 		 726 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482945  normal  0.0643046 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  40.6 
 
 		 682 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  40.29 
 
 		 694 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0115  vgrG protein  40.18 
 
 		 694 aa  497  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  39.97 
 
 		 699 aa  496  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2117  Rhs element Vgr protein  37.09 
 
 		 722 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  42 
 
 		 655 aa  492  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1026  vgrG protein  42.91 
 
 		 1095 aa  489  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3386  vgrG protein  37.48 
 
 		 725 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160309  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2371  Rhs element Vgr protein  37.63 
 
 		 725 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2858  type VI secretion system Vgr family protein  38.91 
 
 		 692 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.374803  normal  0.207801 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2579  Rhs element Vgr protein  42.64 
 
 		 687 aa  480  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0472026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2572  Rhs element Vgr protein  42.64 
 
 		 687 aa  480  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0544876  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  42.67 
 
 		 723 aa  480  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2565  Rhs element Vgr protein  42.64 
 
 		 687 aa  480  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125293  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  42.16 
 
 		 706 aa  478  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0014  vgrG protein  41.45 
 
 		 1017 aa  476  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2614  vgrG protein  36.69 
 
 		 722 aa  475  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0110775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  37.57 
 
 		 706 aa  475  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3234  type VI secretion system Vgr family protein  39.84 
 
 		 722 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4049  vgrG protein  36.63 
 
 		 771 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.253476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0838  Rhs element Vgr protein  37.64 
 
 		 697 aa  431  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0650  Rhs element Vgr protein  35.01 
 
 		 727 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0732792  normal  0.0253872 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1145  Rhs element Vgr protein  35.45 
 
 		 706 aa  426  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  34.88 
 
 		 692 aa  424  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  34.38 
 
 		 692 aa  425  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  33.81 
 
 		 741 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  33.95 
 
 		 741 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  32.96 
 
 		 734 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  32.96 
 
 		 734 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  32.96 
 
 		 734 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  32.96 
 
 		 731 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  32.96 
 
 		 734 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  32.96 
 
 		 734 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  32.96 
 
 		 734 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  42.89 
 
 		 1019 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  42.68 
 
 		 842 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  33.61 
 
 		 741 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2808  Rhs element Vgr protein  34 
 
 		 734 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  33.58 
 
 		 754 aa  398  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  42.68 
 
 		 1019 aa  399  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  33.43 
 
 		 731 aa  398  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  32.36 
 
 		 771 aa  395  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  33.33 
 
 		 754 aa  395  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1173  Rhs element Vgr protein  33.62 
 
 		 734 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  32.81 
 
 		 709 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2127  Rhs element Vgr protein  33.2 
 
 		 748 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  34.99 
 
 		 680 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3486  Rhs element Vgr protein  31.59 
 
 		 774 aa  379  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.740933  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  35.11 
 
 		 680 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0241  Rhs element Vgr protein  33.54 
 
 		 907 aa  373  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3783  Rhs element Vgr protein  32.5 
 
 		 785 aa  370  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  32.95 
 
 		 702 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  36.08 
 
 		 693 aa  372  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  35.6 
 
 		 683 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  33.29 
 
 		 712 aa  368  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  31.85 
 
 		 689 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  32.31 
 
 		 689 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  35.06 
 
 		 688 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  35.09 
 
 		 683 aa  365  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  33.04 
 
 		 680 aa  364  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  35.06 
 
 		 808 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  33.03 
 
 		 763 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  34.03 
 
 		 678 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2735  Rhs element Vgr protein  31.32 
 
 		 788 aa  361  3e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0298298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  35.43 
 
 		 680 aa  360  5e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  34.09 
 
 		 741 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4009  Rhs element Vgr protein  31.5 
 
 		 756 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0849352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>