59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1731 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1731  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  142  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.338731  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03401  hypothetical protein  78.18 
 
 		 233 aa  100  9e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4094  RHS domain-containing protein  78.18 
 
 		 314 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.700312  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  78.18 
 
 		 312 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3802  Rhs family protein  78.18 
 
 		 314 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276743  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  78.18 
 
 		 314 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  73.68 
 
 		 1411 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  73.68 
 
 		 1411 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  73.68 
 
 		 1411 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  73.68 
 
 		 1411 aa  99  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  73.68 
 
 		 1397 aa  98.6  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  73.21 
 
 		 1388 aa  97.1  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  71.93 
 
 		 1397 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  73.68 
 
 		 1411 aa  96.7  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  71.93 
 
 		 1397 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  73.68 
 
 		 1411 aa  96.7  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  73.68 
 
 		 1377 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  73.21 
 
 		 477 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  73.68 
 
 		 1377 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  73.21 
 
 		 477 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  73.21 
 
 		 477 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  73.21 
 
 		 477 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  71.43 
 
 		 1216 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  71.43 
 
 		 1200 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  73.21 
 
 		 477 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  73.68 
 
 		 1397 aa  96.7  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  73.21 
 
 		 477 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  75 
 
 		 554 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  71.93 
 
 		 1308 aa  95.5  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  71.43 
 
 		 1268 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  71.93 
 
 		 1394 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  72.73 
 
 		 682 aa  95.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  71.43 
 
 		 1429 aa  94.4  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  71.93 
 
 		 1409 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  71.93 
 
 		 1399 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  71.43 
 
 		 1398 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  71.43 
 
 		 1426 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  71.43 
 
 		 1426 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  71.43 
 
 		 1426 aa  94.4  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  69.64 
 
 		 1400 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  69.64 
 
 		 1405 aa  93.6  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  70.91 
 
 		 586 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  72.22 
 
 		 1388 aa  90.5  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  70.91 
 
 		 1415 aa  90.9  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  70.91 
 
 		 1251 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  70.91 
 
 		 1199 aa  89  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  69.09 
 
 		 1405 aa  88.2  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  64.29 
 
 		 1417 aa  84  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  70.59 
 
 		 502 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  62.5 
 
 		 1410 aa  80.5  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  48.15 
 
 		 1490 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  69.7 
 
 		 1365 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  44.23 
 
 		 1528 aa  52  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  50 
 
 		 1525 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  50 
 
 		 1509 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0538  Rhs domain-containing protein  62.07 
 
 		 236 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00455  hypothetical protein  62.07 
 
 		 236 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3111  RHS protein  62.07 
 
 		 236 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.791839  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00450  conserved protein, rhs-like protein  62.07 
 
 		 236 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>