More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_2152 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0983  YD repeat protein  97.94 
 
 		 1929 aa  3474    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.984855 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0735  YD repeat protein  43.28 
 
 		 1938 aa  1181    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206584  normal  0.0550996 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1143  YD repeat protein  39.73 
 
 		 1991 aa  1042    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0172483 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2152  YD repeat protein  100 
 
 		 1912 aa  3929    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0482725 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0036  YD repeat protein  40.71 
 
 		 1957 aa  1156    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.13873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1145  hypothetical protein  49.34 
 
 		 535 aa  428  1e-118  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0989818  hitchhiker  0.0000170395 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  28.2 
 
 		 1935 aa  308  9.000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0982  hypothetical protein  85.93 
 
 		 284 aa  256  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.859705 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  30.96 
 
 		 909 aa  236  5e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3067  hypothetical protein  26.33 
 
 		 2801 aa  233  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14527 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  29.96 
 
 		 972 aa  223  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2045  YD repeat-containing protein  31.82 
 
 		 740 aa  181  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  25.73 
 
 		 1464 aa  173  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  24.95 
 
 		 1599 aa  160  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.24 
 
 		 1352 aa  138  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.43 
 
 		 1600 aa  137  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.75 
 
 		 2096 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  25.35 
 
 		 1271 aa  117  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  25 
 
 		 1379 aa  113  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  21.62 
 
 		 1840 aa  110  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1146  hypothetical protein  45.04 
 
 		 109 aa  108  8e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.199573  hitchhiker  0.0000217042 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  23.27 
 
 		 1384 aa  106  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  25.03 
 
 		 1981 aa  105  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  26.37 
 
 		 690 aa  104  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.73 
 
 		 3193 aa  103  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  25.88 
 
 		 927 aa  102  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.92 
 
 		 1572 aa  100  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  21.99 
 
 		 2035 aa  98.6  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  25.44 
 
 		 2003 aa  98.6  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  26.05 
 
 		 1595 aa  98.6  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.05 
 
 		 1586 aa  97.8  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.04 
 
 		 3027 aa  97.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  27.19 
 
 		 1763 aa  95.9  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  22.97 
 
 		 1429 aa  95.1  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  25.29 
 
 		 1576 aa  94.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  26.8 
 
 		 1381 aa  93.6  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.94 
 
 		 1558 aa  92  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  22.53 
 
 		 1547 aa  91.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  21.54 
 
 		 1917 aa  90.5  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.07 
 
 		 1611 aa  90.1  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  24.28 
 
 		 2831 aa  90.1  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  25.84 
 
 		 1681 aa  89  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  23.47 
 
 		 1953 aa  87.4  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  21.89 
 
 		 1942 aa  87.4  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  23.17 
 
 		 1527 aa  87.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  24.66 
 
 		 1046 aa  86.7  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  24.25 
 
 		 1554 aa  86.3  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  23.39 
 
 		 2149 aa  85.9  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  23.83 
 
 		 1362 aa  85.9  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  24.01 
 
 		 1390 aa  85.5  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  23.49 
 
 		 1520 aa  85.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  24.27 
 
 		 1568 aa  84.7  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  25.53 
 
 		 869 aa  83.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  24.22 
 
 		 924 aa  83.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2154  hypothetical protein  95 
 
 		 73 aa  83.2  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.307116  hitchhiker  0.00807837 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4158  YD repeat-containing protein  23.95 
 
 		 1198 aa  82.4  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.529985 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  24.93 
 
 		 1614 aa  82  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  23.54 
 
 		 1259 aa  82  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  25.07 
 
 		 423 aa  81.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  24.08 
 
 		 1418 aa  81.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  24.25 
 
 		 1509 aa  81.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  22.28 
 
 		 1560 aa  80.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  22.81 
 
 		 1551 aa  81.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  23.28 
 
 		 1368 aa  80.9  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  22.75 
 
 		 1550 aa  80.1  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  23.82 
 
 		 867 aa  79.7  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  21.61 
 
 		 1669 aa  79.7  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  24.84 
 
 		 788 aa  79.3  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  24.84 
 
 		 788 aa  79.3  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  23.4 
 
 		 1409 aa  77.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  23.63 
 
 		 2731 aa  77.8  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  21.71 
 
 		 1959 aa  78.2  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  25.41 
 
 		 1433 aa  77.8  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  22.63 
 
 		 1385 aa  77.4  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  23.62 
 
 		 1400 aa  77  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  25.45 
 
 		 1345 aa  76.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  25.45 
 
 		 1345 aa  76.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  23.4 
 
 		 1467 aa  77  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  23.78 
 
 		 1489 aa  77  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  23.17 
 
 		 866 aa  76.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  25.41 
 
 		 1008 aa  76.3  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  25.41 
 
 		 1008 aa  76.3  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  30.2 
 
 		 920 aa  75.9  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  28.57 
 
 		 955 aa  75.9  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  25.05 
 
 		 1427 aa  75.9  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  24.52 
 
 		 1531 aa  75.9  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  25.21 
 
 		 3689 aa  75.5  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  23.71 
 
 		 1251 aa  75.5  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  32.46 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  23.73 
 
 		 1386 aa  75.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  23.54 
 
 		 1402 aa  74.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  24.16 
 
 		 2961 aa  75.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  23.8 
 
 		 1197 aa  75.1  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  23.64 
 
 		 1390 aa  74.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  31.33 
 
 		 1419 aa  74.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  26.38 
 
 		 1998 aa  74.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  25.28 
 
 		 1517 aa  73.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  24.56 
 
 		 1495 aa  73.6  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  23.72 
 
 		 705 aa  73.6  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0360  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  28.63 
 
 		 306 aa  73.2  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>