More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0735 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0735  YD repeat protein  100 
 
 		 1938 aa  4003    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206584  normal  0.0550996 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2152  YD repeat protein  41.4 
 
 		 1912 aa  1176    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0482725 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0983  YD repeat protein  42.52 
 
 		 1929 aa  1173    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.984855 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0036  YD repeat protein  58.38 
 
 		 1957 aa  2004    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.13873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1143  YD repeat protein  42.32 
 
 		 1991 aa  1052    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0172483 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  29.79 
 
 		 1935 aa  317  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1145  hypothetical protein  39.74 
 
 		 535 aa  276  2.0000000000000002e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0989818  hitchhiker  0.0000170395 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  30.83 
 
 		 909 aa  257  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  30.94 
 
 		 972 aa  241  8e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3067  hypothetical protein  24.88 
 
 		 2801 aa  202  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14527 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2045  YD repeat-containing protein  32.25 
 
 		 740 aa  194  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8866  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  23.94 
 
 		 3027 aa  160  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  25.99 
 
 		 1464 aa  148  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.42 
 
 		 2096 aa  139  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  24.42 
 
 		 1271 aa  136  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  25.51 
 
 		 3193 aa  115  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  24.93 
 
 		 1352 aa  115  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.81 
 
 		 1600 aa  114  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  24.95 
 
 		 1614 aa  113  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  24.97 
 
 		 1379 aa  112  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  24.03 
 
 		 3689 aa  110  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.66 
 
 		 1527 aa  109  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.95 
 
 		 2035 aa  109  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  25.81 
 
 		 1981 aa  109  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.96 
 
 		 1576 aa  109  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.67 
 
 		 1520 aa  108  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1390 aa  107  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.31 
 
 		 1560 aa  105  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.07 
 
 		 1568 aa  105  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.03 
 
 		 924 aa  103  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  30.4 
 
 		 2178 aa  103  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  30.6 
 
 		 1528 aa  103  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.84 
 
 		 1551 aa  103  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  26.29 
 
 		 1572 aa  103  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  25.58 
 
 		 1547 aa  101  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  27.56 
 
 		 927 aa  101  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  26.16 
 
 		 1550 aa  100  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  25.61 
 
 		 1599 aa  100  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  30.94 
 
 		 2225 aa  99.4  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  23.33 
 
 		 1467 aa  99.4  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  31.46 
 
 		 765 aa  99  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  23.6 
 
 		 1386 aa  97.1  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  30.72 
 
 		 2221 aa  95.5  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  24.57 
 
 		 1400 aa  95.5  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  24.68 
 
 		 867 aa  94.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  23.85 
 
 		 1359 aa  94.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0982  hypothetical protein  40.88 
 
 		 284 aa  94  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.859705 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  23.68 
 
 		 1681 aa  92.8  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  25.07 
 
 		 2277 aa  93.2  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.16 
 
 		 1840 aa  92.8  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  29.77 
 
 		 2224 aa  92  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1146  hypothetical protein  41.04 
 
 		 109 aa  92  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.199573  hitchhiker  0.0000217042 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1255  wall-associated protein  29.71 
 
 		 504 aa  91.7  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  30.22 
 
 		 2224 aa  90.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  24.03 
 
 		 2731 aa  90.9  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  30.22 
 
 		 2224 aa  90.9  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  24.48 
 
 		 1531 aa  90.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  24.54 
 
 		 1409 aa  90.1  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  23.85 
 
 		 1517 aa  89  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  23.5 
 
 		 866 aa  88.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  25.19 
 
 		 1415 aa  88.6  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  22.78 
 
 		 1485 aa  87.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  23.28 
 
 		 1368 aa  87.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  23.99 
 
 		 1429 aa  87  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  23.67 
 
 		 1362 aa  86.7  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  24.22 
 
 		 1495 aa  86.7  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  23.53 
 
 		 1259 aa  86.7  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  24.13 
 
 		 1419 aa  85.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  24.49 
 
 		 2003 aa  85.9  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  25.98 
 
 		 1595 aa  85.9  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1206  cell wall-associated protein, putative  30.84 
 
 		 400 aa  84.7  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00333262  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.51 
 
 		 1586 aa  85.5  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  22.39 
 
 		 1626 aa  85.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  26.66 
 
 		 1834 aa  84.3  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  24.67 
 
 		 1385 aa  84.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  23.63 
 
 		 1381 aa  84  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  23.95 
 
 		 1410 aa  83.2  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  29.9 
 
 		 2246 aa  82.8  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  26.96 
 
 		 690 aa  82.4  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  24.37 
 
 		 1485 aa  82.4  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  28.57 
 
 		 678 aa  82  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  25.03 
 
 		 1732 aa  81.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  23.99 
 
 		 1509 aa  82  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  25 
 
 		 1953 aa  82  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  24.2 
 
 		 1433 aa  81.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  25.07 
 
 		 1348 aa  80.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  23.65 
 
 		 2145 aa  80.5  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  25.45 
 
 		 1405 aa  80.1  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  25.76 
 
 		 1400 aa  80.1  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  22.56 
 
 		 1552 aa  79.7  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.27 
 
 		 1611 aa  79  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  23.98 
 
 		 1411 aa  79  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  22.65 
 
 		 2149 aa  78.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  25.1 
 
 		 1377 aa  78.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  23.98 
 
 		 1411 aa  78.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  25.1 
 
 		 1377 aa  78.6  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  23.7 
 
 		 1411 aa  78.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  25.17 
 
 		 1268 aa  77.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  25.62 
 
 		 1046 aa  77.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  23.66 
 
 		 1554 aa  78.2  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>