209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3067 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3067  hypothetical protein  100 
 
 		 2801 aa  5724    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14527 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  29.83 
 
 		 1935 aa  420  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  33.3 
 
 		 972 aa  298  1e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  33.52 
 
 		 909 aa  289  4e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2045  YD repeat-containing protein  37.29 
 
 		 740 aa  267  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8866  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1143  YD repeat protein  26.04 
 
 		 1991 aa  248  9e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0172483 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2152  YD repeat protein  26.56 
 
 		 1912 aa  230  3e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0482725 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0983  YD repeat protein  26.58 
 
 		 1929 aa  229  6e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.984855 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0036  YD repeat protein  26.64 
 
 		 1957 aa  220  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.13873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0735  YD repeat protein  24.87 
 
 		 1938 aa  209  6e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206584  normal  0.0550996 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.67 
 
 		 1600 aa  140  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  25.06 
 
 		 1464 aa  139  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1145  hypothetical protein  28.31 
 
 		 535 aa  122  9e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0989818  hitchhiker  0.0000170395 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24 
 
 		 2096 aa  114  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  24.67 
 
 		 1352 aa  114  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  24.68 
 
 		 1599 aa  112  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  23.21 
 
 		 3027 aa  108  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.66 
 
 		 1558 aa  99.4  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  23.97 
 
 		 1271 aa  98.6  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  25.49 
 
 		 2003 aa  89  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  24.64 
 
 		 869 aa  85.5  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  24.41 
 
 		 3193 aa  83.6  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0982  hypothetical protein  41 
 
 		 284 aa  83.6  0.00000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.859705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  24.47 
 
 		 1568 aa  80.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  26.14 
 
 		 690 aa  79  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  21.46 
 
 		 2277 aa  78.2  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  24.34 
 
 		 924 aa  76.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.79 
 
 		 927 aa  76.3  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  25.09 
 
 		 1485 aa  75.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  22.21 
 
 		 1560 aa  75.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.01 
 
 		 2035 aa  73.6  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  24.77 
 
 		 1710 aa  72.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  24.55 
 
 		 1614 aa  72.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  22.26 
 
 		 678 aa  72.4  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  22.18 
 
 		 1385 aa  71.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  23.28 
 
 		 1259 aa  71.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  27.92 
 
 		 1998 aa  71.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  24.25 
 
 		 1489 aa  70.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  24.83 
 
 		 1485 aa  70.5  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  24.56 
 
 		 1681 aa  70.9  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  24.19 
 
 		 3689 aa  70.5  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  22.12 
 
 		 1467 aa  70.1  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  23.18 
 
 		 1509 aa  70.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  23.39 
 
 		 1368 aa  69.3  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  21.29 
 
 		 1531 aa  68.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  22.62 
 
 		 1411 aa  68.6  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  24.25 
 
 		 2294 aa  68.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  23.99 
 
 		 1494 aa  68.6  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  23.99 
 
 		 1494 aa  68.6  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  22.73 
 
 		 1422 aa  68.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  22.21 
 
 		 1400 aa  67.4  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  22.03 
 
 		 1418 aa  66.6  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  23.95 
 
 		 1669 aa  65.9  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  24.78 
 
 		 2961 aa  65.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  25.24 
 
 		 1528 aa  65.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  23.03 
 
 		 2149 aa  64.7  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  23.98 
 
 		 1362 aa  64.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  23.63 
 
 		 1611 aa  64.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.65 
 
 		 1959 aa  64.3  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.65 
 
 		 1547 aa  63.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  23.26 
 
 		 1487 aa  63.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  23.41 
 
 		 1576 aa  63.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  23.71 
 
 		 956 aa  63.2  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  23.88 
 
 		 2831 aa  62.8  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  23.98 
 
 		 1595 aa  62.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  21.79 
 
 		 1942 aa  62  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  22.08 
 
 		 1732 aa  60.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  23.68 
 
 		 1586 aa  61.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  22.29 
 
 		 1917 aa  60.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  21.7 
 
 		 1409 aa  60.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  26.95 
 
 		 423 aa  60.5  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  21.99 
 
 		 1390 aa  60.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  22.6 
 
 		 1530 aa  60.1  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  22.1 
 
 		 1402 aa  60.1  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  22.49 
 
 		 1379 aa  60.1  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0360  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  28.42 
 
 		 306 aa  60.1  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  26.37 
 
 		 927 aa  59.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  27.35 
 
 		 955 aa  58.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  29.31 
 
 		 1381 aa  58.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  26.09 
 
 		 2510 aa  58.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  31.93 
 
 		 920 aa  58.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  32.76 
 
 		 939 aa  58.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  23.14 
 
 		 396 aa  57.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  28.99 
 
 		 1981 aa  57.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  22.78 
 
 		 3073 aa  57.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  21.85 
 
 		 1495 aa  57.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  30.56 
 
 		 989 aa  57.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  27.13 
 
 		 1429 aa  57.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1923  peptidoglycan-binding LysM  25.33 
 
 		 5189 aa  57.4  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  26.69 
 
 		 1673 aa  57.4  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  31.37 
 
 		 1763 aa  57.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  23.86 
 
 		 1488 aa  57.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3683  peptidoglycan-binding LysM  25.33 
 
 		 5236 aa  57  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  23.69 
 
 		 1602 aa  57  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  24.32 
 
 		 3273 aa  57  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  23.01 
 
 		 1386 aa  56.6  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1603  YD repeat protein  21.68 
 
 		 840 aa  57  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  26.73 
 
 		 1679 aa  56.6  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  25 
 
 		 1953 aa  56.6  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4455  insecticidal toxin protein, putative  36.45 
 
 		 944 aa  56.6  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>