191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4455 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4454  insecticidal toxin protein, putative  57.1 
 
 		 928 aa  738    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.543889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4455  insecticidal toxin protein, putative  100 
 
 		 944 aa  1954    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4456  insecticidal toxin protein, putative  63.35 
 
 		 891 aa  977    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.859155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0586  YD repeat-containing protein  40.53 
 
 		 956 aa  452  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4344  insecticidal toxin protein, putative  39.85 
 
 		 886 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4032  YD repeat-containing protein  38.86 
 
 		 920 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0529613 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4033  YD repeat-containing protein  39.06 
 
 		 939 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.195324 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4037  YD repeat-containing protein  39.64 
 
 		 955 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4038  YD repeat-containing protein  40.09 
 
 		 881 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.23853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4340  insecticidal toxin protein, putative  37.28 
 
 		 940 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1051  YD repeat-containing protein  39.24 
 
 		 927 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2412  YD repeat-containing protein  34.13 
 
 		 923 aa  379  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.394725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0162  TccC3  36.03 
 
 		 989 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0948  insecticidal toxin protein, putative  36.4 
 
 		 942 aa  365  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.920867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1231  insecticidal toxin protein, putative  38.71 
 
 		 922 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.644961  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0473  YD repeat-containing protein  37.52 
 
 		 952 aa  353  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0589964  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0408  putative insecticidal toxin complex protein  37.59 
 
 		 910 aa  352  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0947  insecticidal toxin protein, putative  37.71 
 
 		 893 aa  350  7e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.81125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0407  putative insecticidal toxin complex protein  37.09 
 
 		 921 aa  349  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0406  putative insecticidal toxin complex protein  37.07 
 
 		 929 aa  349  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0160  TccC4  35.34 
 
 		 952 aa  347  7e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.189077  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0409  putative insecticial toxin complex protein  35.8 
 
 		 958 aa  339  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1189  RHS repeat family protein  37.42 
 
 		 952 aa  333  7.000000000000001e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.667138  hitchhiker  0.0000780044 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2566  hypothetical protein  35.76 
 
 		 980 aa  325  2e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00381829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  35.56 
 
 		 2417 aa  320  7e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  35.67 
 
 		 2458 aa  319  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1823  putative toxin protein  35.3 
 
 		 994 aa  308  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0293647  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0382  YD repeat-containing protein  35.4 
 
 		 852 aa  305  4.0000000000000003e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.835506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0610  YD repeat protein  34.24 
 
 		 954 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0604  YD repeat-containing protein  34.24 
 
 		 954 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.244718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0579  YD repeat-containing protein  34.24 
 
 		 954 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0609  YD repeat protein  33.95 
 
 		 958 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0603  YD repeat-containing protein  33.95 
 
 		 962 aa  291  4e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0578  YD repeat-containing protein  33.95 
 
 		 962 aa  291  4e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2868  YD repeat protein  30.28 
 
 		 2554 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0998  YD repeat-containing protein  29.53 
 
 		 2558 aa  248  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2155  Rhs family protein-like protein  32.98 
 
 		 2698 aa  227  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  28.94 
 
 		 2534 aa  204  5e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  30.26 
 
 		 2652 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1893  YD repeat protein  32.38 
 
 		 2510 aa  197  6e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.111399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2269  YD repeat protein  28.59 
 
 		 2479 aa  170  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1894  YD repeat protein  28.09 
 
 		 2443 aa  164  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.179364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  25.13 
 
 		 690 aa  87  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  24.84 
 
 		 927 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  23.86 
 
 		 1976 aa  72.8  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.98 
 
 		 1840 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  24.19 
 
 		 1917 aa  72.4  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  24.59 
 
 		 1942 aa  71.2  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  24.37 
 
 		 1467 aa  67.4  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1870  Rhs family protein-like protein  33.84 
 
 		 334 aa  67  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0949212  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1512  YD repeat protein  24.82 
 
 		 2059 aa  65.9  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384432 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  28.14 
 
 		 1464 aa  65.9  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5751  YD repeat protein  24.96 
 
 		 2035 aa  65.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2925  YD repeat protein  35.92 
 
 		 3456 aa  65.1  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  22.29 
 
 		 1959 aa  64.7  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  38.53 
 
 		 1600 aa  63.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  22.24 
 
 		 2145 aa  62.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  39.66 
 
 		 1352 aa  62.4  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1669 aa  62  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  30.88 
 
 		 1381 aa  62  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  24.15 
 
 		 2076 aa  61.6  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  23.99 
 
 		 605 aa  61.2  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  37.39 
 
 		 1791 aa  61.2  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1558  YD repeat-containing protein  27.31 
 
 		 3320 aa  60.8  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.44 
 
 		 2035 aa  61.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33070  Rhs family protein  23.99 
 
 		 1140 aa  60.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  21.8 
 
 		 2497 aa  60.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  25.13 
 
 		 1338 aa  60.1  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  40 
 
 		 1935 aa  58.9  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1458  hypothetical protein  31.69 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  31.06 
 
 		 869 aa  59.3  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  36.36 
 
 		 1892 aa  58.9  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  24.67 
 
 		 788 aa  58.5  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  24.67 
 
 		 788 aa  58.5  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  23.4 
 
 		 738 aa  58.5  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1703  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  25.74 
 
 		 2094 aa  58.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  35.16 
 
 		 1147 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  24.5 
 
 		 1271 aa  58.2  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2020  YD repeat-containing protein  32.84 
 
 		 1140 aa  57.8  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  47.46 
 
 		 1998 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0045  hypothetical protein  36.79 
 
 		 302 aa  57  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01120  Rhs family protein  35.09 
 
 		 1053 aa  57.4  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  26.27 
 
 		 2117 aa  56.6  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1560  YD repeat-containing protein  27.92 
 
 		 1126 aa  56.6  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  23.6 
 
 		 1485 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3067  hypothetical protein  36.45 
 
 		 2801 aa  56.6  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14527 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  35.51 
 
 		 1681 aa  56.6  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  34.95 
 
 		 2294 aa  55.5  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  23.86 
 
 		 1434 aa  55.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2022  YD repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1488 aa  55.1  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.904557  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  21.34 
 
 		 2003 aa  55.1  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1054  YD repeat-containing protein  23.61 
 
 		 2286 aa  55.1  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.740201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4405  hypothetical protein  34.11 
 
 		 298 aa  54.7  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2323  hypothetical protein  31.36 
 
 		 554 aa  54.7  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4266  hypothetical protein  34.11 
 
 		 298 aa  54.7  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  22.49 
 
 		 1385 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  33.64 
 
 		 482 aa  54.7  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  22.99 
 
 		 1834 aa  53.9  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4180  hypothetical protein  34.11 
 
 		 316 aa  54.3  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  28.57 
 
 		 1599 aa  54.3  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>