More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1143 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1143  YD repeat protein  100 
 
 		 1991 aa  4101    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0172483 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0036  YD repeat protein  40.73 
 
 		 1957 aa  1005    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.13873 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0735  YD repeat protein  43.54 
 
 		 1938 aa  1058    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.206584  normal  0.0550996 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2152  YD repeat protein  39.74 
 
 		 1912 aa  1052    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0482725 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0983  YD repeat protein  39.64 
 
 		 1929 aa  1050    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.474988  normal  0.984855 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1145  hypothetical protein  45.07 
 
 		 535 aa  384  1e-104  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0989818  hitchhiker  0.0000170395 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2050  YD repeat-containing protein  28.93 
 
 		 1935 aa  347  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.149487  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2048  YD repeat-containing protein  32.68 
 
 		 972 aa  264  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2046  YD repeat-containing protein  31.12 
 
 		 909 aa  256  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3067  hypothetical protein  26.09 
 
 		 2801 aa  245  7.999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14527 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2045  YD repeat-containing protein  34.67 
 
 		 740 aa  211  9e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.8866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  24.35 
 
 		 1464 aa  143  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.35 
 
 		 2096 aa  141  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.67 
 
 		 2035 aa  136  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.83 
 
 		 1600 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  26.93 
 
 		 1599 aa  131  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.35 
 
 		 1352 aa  130  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  24.84 
 
 		 1271 aa  127  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  24.01 
 
 		 1147 aa  113  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0982  hypothetical protein  44.3 
 
 		 284 aa  112  5e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.859705 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  28.07 
 
 		 1558 aa  110  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1146  hypothetical protein  45.45 
 
 		 109 aa  110  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.199573  hitchhiker  0.0000217042 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  23.12 
 
 		 3027 aa  108  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  25.56 
 
 		 1467 aa  107  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  25.48 
 
 		 927 aa  104  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.16 
 
 		 3193 aa  104  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  22.71 
 
 		 2149 aa  103  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  24.35 
 
 		 1390 aa  102  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  26.39 
 
 		 1379 aa  101  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  24.78 
 
 		 1433 aa  102  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  26.72 
 
 		 2003 aa  101  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  24.67 
 
 		 867 aa  101  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4937  Rhs family protein  25.48 
 
 		 1998 aa  101  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.363198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  26.03 
 
 		 1411 aa  99  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  25.76 
 
 		 690 aa  99  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  25.52 
 
 		 1409 aa  97.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  23.77 
 
 		 2277 aa  97.8  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.78 
 
 		 1614 aa  96.3  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.69 
 
 		 1576 aa  95.5  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  23.67 
 
 		 1981 aa  94.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  25.42 
 
 		 1681 aa  94  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  25.26 
 
 		 3689 aa  93.6  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  25.53 
 
 		 1572 aa  92.8  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  25.04 
 
 		 1386 aa  91.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  25.74 
 
 		 1485 aa  91.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  27.81 
 
 		 451 aa  90.5  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0984  hypothetical protein  38.51 
 
 		 286 aa  90.5  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  25.96 
 
 		 1509 aa  90.1  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  24.81 
 
 		 1595 aa  90.1  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  24.49 
 
 		 1586 aa  89.4  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  25.1 
 
 		 1385 aa  88.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  24.33 
 
 		 1197 aa  88.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  23.47 
 
 		 1429 aa  88.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  25.62 
 
 		 1348 aa  87.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  24.7 
 
 		 1531 aa  87.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  20.67 
 
 		 1942 aa  87.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  26.63 
 
 		 1611 aa  87.8  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  21.75 
 
 		 1917 aa  87.4  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.11 
 
 		 1560 aa  87.4  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  23.46 
 
 		 1547 aa  87  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  25.62 
 
 		 866 aa  86.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  25.88 
 
 		 1400 aa  85.9  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  25.64 
 
 		 1359 aa  85.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  24.81 
 
 		 1508 aa  84.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  23.84 
 
 		 2658 aa  84.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.96 
 
 		 903 aa  84.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  26.79 
 
 		 605 aa  84.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  25.62 
 
 		 1381 aa  84  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  25.38 
 
 		 1602 aa  83.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  23.13 
 
 		 1520 aa  83.2  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  24.89 
 
 		 788 aa  82.8  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  24.89 
 
 		 788 aa  82.8  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  26.12 
 
 		 1485 aa  82.4  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  24.29 
 
 		 2225 aa  82.4  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  23.4 
 
 		 1411 aa  82  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0017  YD repeat protein  25.85 
 
 		 738 aa  80.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.215545  hitchhiker  0.000002636 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  23.97 
 
 		 2178 aa  81.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  22.84 
 
 		 1959 aa  80.1  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  21.89 
 
 		 1669 aa  80.1  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  26.21 
 
 		 741 aa  79.7  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1899  YD repeat-containing protein  31.5 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.126482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  21.67 
 
 		 1840 aa  79.3  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  25.79 
 
 		 678 aa  79.3  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  27.75 
 
 		 561 aa  79  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  28.26 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  24.88 
 
 		 1568 aa  78.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  24.96 
 
 		 2246 aa  78.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  22.68 
 
 		 1377 aa  78.6  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  23.36 
 
 		 1397 aa  78.2  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  23.3 
 
 		 1673 aa  77.8  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  23.23 
 
 		 1528 aa  77.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  24.93 
 
 		 1362 aa  77  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  24.53 
 
 		 1259 aa  76.3  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.45 
 
 		 924 aa  76.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  25.66 
 
 		 889 aa  75.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  28.04 
 
 		 1419 aa  75.5  0.000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  23.9 
 
 		 1527 aa  75.5  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  27.4 
 
 		 1541 aa  75.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  26.17 
 
 		 1517 aa  74.7  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  23.08 
 
 		 1551 aa  74.7  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>