More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02969 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00354  putative RHS-related transmembrane protein  63.41 
 
 		 1368 aa  1444    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02969  putative RHS-related protein  100 
 
 		 1710 aa  3511    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00316448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2107  YD repeat protein  44.64 
 
 		 1681 aa  1243    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  44.85 
 
 		 1599 aa  1247    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  47.31 
 
 		 1558 aa  961    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_003296  RS05520  hypothetical protein  88.83 
 
 		 237 aa  338  3.9999999999999995e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.57644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  29.75 
 
 		 1464 aa  216  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  23.55 
 
 		 2096 aa  200  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.69 
 
 		 1600 aa  197  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  25.07 
 
 		 1467 aa  178  6e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  21.92 
 
 		 2035 aa  164  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  25.04 
 
 		 2149 aa  164  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.64 
 
 		 1352 aa  162  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  25.79 
 
 		 1614 aa  155  8e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  26.05 
 
 		 1550 aa  154  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  25.87 
 
 		 1547 aa  154  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  25.75 
 
 		 1348 aa  154  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  24.84 
 
 		 1602 aa  150  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  26.62 
 
 		 1488 aa  148  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  25.97 
 
 		 3193 aa  148  9e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.79 
 
 		 3027 aa  145  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.84 
 
 		 1520 aa  145  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  26.79 
 
 		 2277 aa  145  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  22.92 
 
 		 1485 aa  145  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.89 
 
 		 1527 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  27.22 
 
 		 1271 aa  143  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  24.4 
 
 		 1359 aa  142  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  23.36 
 
 		 1409 aa  141  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  24.56 
 
 		 1429 aa  140  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  22.15 
 
 		 1386 aa  139  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  24.32 
 
 		 1551 aa  138  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  24.63 
 
 		 1417 aa  137  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  24.76 
 
 		 1981 aa  135  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  25.42 
 
 		 1197 aa  135  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  23.42 
 
 		 1508 aa  134  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  23.91 
 
 		 1840 aa  133  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  25.72 
 
 		 1609 aa  132  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  24.6 
 
 		 1576 aa  132  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2106  hypothetical protein  38.25 
 
 		 335 aa  132  8.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  26.05 
 
 		 903 aa  132  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  22.49 
 
 		 1411 aa  131  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  22.85 
 
 		 1400 aa  131  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  24 
 
 		 1586 aa  131  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  21.87 
 
 		 1385 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  24.34 
 
 		 1573 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  24.97 
 
 		 1517 aa  129  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  24.39 
 
 		 1509 aa  127  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  24.13 
 
 		 1362 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  23.21 
 
 		 1531 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  22.49 
 
 		 1942 aa  124  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  22.78 
 
 		 1553 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  25.85 
 
 		 1518 aa  120  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  25.81 
 
 		 1579 aa  120  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  25.3 
 
 		 913 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  25.81 
 
 		 1428 aa  119  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  27.14 
 
 		 1620 aa  118  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  23.17 
 
 		 867 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  25.22 
 
 		 1147 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  23.22 
 
 		 1419 aa  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.54 
 
 		 1527 aa  117  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  25.49 
 
 		 1400 aa  116  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  25.78 
 
 		 1160 aa  115  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  22.93 
 
 		 1379 aa  115  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  22.75 
 
 		 1669 aa  114  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  22.87 
 
 		 1572 aa  112  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  26.52 
 
 		 741 aa  112  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00283  RhsD protein  26.71 
 
 		 613 aa  111  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333499  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  22.81 
 
 		 1917 aa  111  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  25.72 
 
 		 889 aa  111  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  23.91 
 
 		 1530 aa  110  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  21.69 
 
 		 1959 aa  110  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  28.46 
 
 		 1528 aa  109  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  22.12 
 
 		 866 aa  109  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  23.42 
 
 		 1539 aa  108  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  25.39 
 
 		 1953 aa  108  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  24.66 
 
 		 1679 aa  107  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1615  Rhs1 protein  22.42 
 
 		 1150 aa  107  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  23.81 
 
 		 1595 aa  107  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  25.65 
 
 		 917 aa  107  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0145  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  22.42 
 
 		 1150 aa  106  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  24.86 
 
 		 1528 aa  106  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  25.28 
 
 		 1434 aa  106  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  26.5 
 
 		 3689 aa  105  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  24.44 
 
 		 1639 aa  105  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  24.34 
 
 		 1673 aa  105  9e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0168  Rhs1 protein  22.33 
 
 		 1150 aa  104  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  25.03 
 
 		 1301 aa  104  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  26.76 
 
 		 2003 aa  104  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  24.3 
 
 		 1008 aa  104  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  24.3 
 
 		 1008 aa  104  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  25.68 
 
 		 1345 aa  104  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  25.68 
 
 		 1345 aa  104  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  25.72 
 
 		 1626 aa  103  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  26.38 
 
 		 1446 aa  103  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  24.36 
 
 		 1604 aa  102  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2647  YD repeat-containing protein  24.64 
 
 		 934 aa  102  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.217872  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  24.67 
 
 		 1485 aa  102  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  27.36 
 
 		 1554 aa  102  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  29.2 
 
 		 1568 aa  102  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  24.48 
 
 		 1189 aa  100  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>