More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_06221 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  100 
 
 		 1345 aa  2714    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  100 
 
 		 1345 aa  2714    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  99.1 
 
 		 1008 aa  1753    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  99.1 
 
 		 1008 aa  1753    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03365  ISXo8 transposase  72.75 
 
 		 800 aa  528  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  unclonable  0.0000000000642121  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03366  Rhs family protein  73.46 
 
 		 337 aa  481  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000332584  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  32.3 
 
 		 1160 aa  348  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  32.98 
 
 		 1147 aa  347  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  28.81 
 
 		 1600 aa  304  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  28.22 
 
 		 1352 aa  288  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  27.74 
 
 		 2096 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  27.69 
 
 		 1271 aa  240  1e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  26.3 
 
 		 1595 aa  218  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  25.75 
 
 		 1586 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  26.9 
 
 		 2294 aa  210  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  27.25 
 
 		 1599 aa  207  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  30.57 
 
 		 2003 aa  206  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  27.43 
 
 		 1467 aa  205  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  26.3 
 
 		 1464 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  24.67 
 
 		 1981 aa  202  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.37 
 
 		 1576 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.48 
 
 		 1611 aa  196  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.15 
 
 		 1527 aa  195  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  23.33 
 
 		 2035 aa  192  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  26.47 
 
 		 2149 aa  190  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.77 
 
 		 1547 aa  189  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25 
 
 		 1551 aa  190  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  24.34 
 
 		 1485 aa  188  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  23.34 
 
 		 1520 aa  186  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.7 
 
 		 1572 aa  183  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  25.39 
 
 		 2277 aa  183  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  24.85 
 
 		 1560 aa  183  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.33 
 
 		 3193 aa  182  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.73 
 
 		 1614 aa  181  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  26.1 
 
 		 2731 aa  179  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  24.87 
 
 		 1609 aa  178  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  25.25 
 
 		 1485 aa  174  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  25.85 
 
 		 1942 aa  174  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  23.95 
 
 		 1518 aa  173  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.72 
 
 		 3027 aa  172  4e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  26.21 
 
 		 1495 aa  171  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  26.54 
 
 		 1669 aa  170  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  24.23 
 
 		 1348 aa  170  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  26.19 
 
 		 927 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  24.29 
 
 		 1488 aa  169  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  26.36 
 
 		 1917 aa  168  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  22.75 
 
 		 1550 aa  168  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.39 
 
 		 1558 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  25.98 
 
 		 1840 aa  167  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  26.97 
 
 		 913 aa  165  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  26.42 
 
 		 1953 aa  164  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  27.42 
 
 		 2246 aa  164  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  25.71 
 
 		 1487 aa  164  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  26.74 
 
 		 2221 aa  163  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  24.54 
 
 		 1434 aa  163  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  24.27 
 
 		 1259 aa  163  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  24.39 
 
 		 1528 aa  163  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  23.94 
 
 		 1959 aa  162  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25.4 
 
 		 1568 aa  162  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  23.7 
 
 		 1384 aa  162  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  25.75 
 
 		 1494 aa  161  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  25.75 
 
 		 1494 aa  161  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  29.41 
 
 		 678 aa  161  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  25.79 
 
 		 1362 aa  161  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  25.6 
 
 		 3073 aa  160  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  26.92 
 
 		 1531 aa  160  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  27.22 
 
 		 1433 aa  160  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  23.54 
 
 		 1197 aa  159  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  25.13 
 
 		 1530 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  23.93 
 
 		 1409 aa  157  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  25.26 
 
 		 924 aa  157  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  26.84 
 
 		 2178 aa  156  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  27.03 
 
 		 765 aa  156  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  23.61 
 
 		 1489 aa  156  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  24.06 
 
 		 1386 aa  156  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  26.69 
 
 		 2224 aa  156  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  23.14 
 
 		 1554 aa  155  5e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  24.93 
 
 		 1508 aa  154  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  25.15 
 
 		 2225 aa  154  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  26.4 
 
 		 2224 aa  153  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  25.14 
 
 		 1381 aa  154  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  26.4 
 
 		 2224 aa  153  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  25.87 
 
 		 1528 aa  152  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  24.89 
 
 		 1673 aa  152  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  25.54 
 
 		 1418 aa  150  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  24.39 
 
 		 1509 aa  150  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  24.83 
 
 		 1385 aa  148  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  24.49 
 
 		 1419 aa  148  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  25 
 
 		 1679 aa  145  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  24.92 
 
 		 1626 aa  145  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  24.49 
 
 		 1517 aa  145  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  23.41 
 
 		 1410 aa  145  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  28.49 
 
 		 690 aa  145  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  24.27 
 
 		 1400 aa  145  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  25.48 
 
 		 1390 aa  145  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  24.84 
 
 		 1421 aa  144  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  28.29 
 
 		 1834 aa  144  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  26.76 
 
 		 1429 aa  143  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  24.19 
 
 		 1732 aa  142  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  23.78 
 
 		 1401 aa  142  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>