More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0874 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  48.18 
 
 		 2658 aa  1158    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  100 
 
 		 1732 aa  3541    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  96.72 
 
 		 396 aa  794    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  52.77 
 
 		 765 aa  724    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  47.35 
 
 		 2349 aa  1141    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  27.04 
 
 		 2225 aa  367  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  28.15 
 
 		 2224 aa  353  2e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  28.43 
 
 		 2224 aa  350  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  28.43 
 
 		 2224 aa  350  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  27.88 
 
 		 2178 aa  344  7e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  28.1 
 
 		 2221 aa  341  8e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  27.19 
 
 		 2246 aa  335  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0152  YD repeat protein  47.85 
 
 		 307 aa  249  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  31.55 
 
 		 765 aa  209  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  29.94 
 
 		 2096 aa  194  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  28.61 
 
 		 1271 aa  187  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  31 
 
 		 678 aa  187  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  26.16 
 
 		 1600 aa  178  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  28.01 
 
 		 1840 aa  170  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  28.26 
 
 		 1959 aa  168  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  26.02 
 
 		 1464 aa  167  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  27.75 
 
 		 1352 aa  166  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  26.94 
 
 		 1917 aa  165  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  27.33 
 
 		 1942 aa  160  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  22.8 
 
 		 2731 aa  153  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  26.82 
 
 		 1669 aa  150  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  27.3 
 
 		 1467 aa  150  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  27.95 
 
 		 1599 aa  148  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  27.06 
 
 		 1381 aa  148  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  26.14 
 
 		 927 aa  144  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  26.72 
 
 		 2003 aa  142  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  26.51 
 
 		 2486 aa  142  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0188  YD repeat-containing protein  26.07 
 
 		 1147 aa  142  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.336651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25.58 
 
 		 3027 aa  138  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  23.32 
 
 		 1348 aa  138  8e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.44 
 
 		 3193 aa  134  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  25.18 
 
 		 2294 aa  134  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  25.55 
 
 		 1976 aa  131  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1206  cell wall-associated protein, putative  37.6 
 
 		 400 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00333262  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1255  wall-associated protein  33.33 
 
 		 504 aa  129  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  25.29 
 
 		 1531 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  26.2 
 
 		 1595 aa  129  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.38 
 
 		 1586 aa  129  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1132  wall-associated protein  38.36 
 
 		 382 aa  129  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0407345  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7071  YD repeat protein  27.94 
 
 		 1160 aa  128  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  27.3 
 
 		 1427 aa  128  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  25.41 
 
 		 2035 aa  128  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  25.46 
 
 		 1576 aa  127  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  24.25 
 
 		 1386 aa  126  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  25.82 
 
 		 690 aa  126  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  24.04 
 
 		 1572 aa  125  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  25.14 
 
 		 1409 aa  125  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  23.72 
 
 		 1614 aa  125  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  25.2 
 
 		 1953 aa  124  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  26.6 
 
 		 1485 aa  124  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  25.77 
 
 		 1384 aa  124  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  24.91 
 
 		 2277 aa  123  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  24.34 
 
 		 1008 aa  122  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  24.34 
 
 		 1008 aa  122  7.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  26.57 
 
 		 867 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  23.37 
 
 		 1495 aa  120  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  23.1 
 
 		 1488 aa  120  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  28.26 
 
 		 2942 aa  120  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  24.19 
 
 		 1345 aa  120  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  24.19 
 
 		 1345 aa  120  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.28 
 
 		 1551 aa  119  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  24.86 
 
 		 1527 aa  119  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  24.37 
 
 		 1419 aa  119  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  25.31 
 
 		 2374 aa  117  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.35 
 
 		 903 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  24.72 
 
 		 3073 aa  116  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  23.68 
 
 		 1411 aa  117  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  21.74 
 
 		 1602 aa  116  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  27.21 
 
 		 1834 aa  116  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  22.11 
 
 		 1558 aa  116  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  26.52 
 
 		 2350 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.65 
 
 		 1547 aa  115  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  26.16 
 
 		 1611 aa  114  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.6 
 
 		 1550 aa  114  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  25.62 
 
 		 741 aa  113  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  25.42 
 
 		 2138 aa  113  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  25.85 
 
 		 1433 aa  113  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  25.56 
 
 		 1520 aa  112  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  24.84 
 
 		 1528 aa  112  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4802  hypothetical protein  26.41 
 
 		 2017 aa  112  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772458  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  24.17 
 
 		 1568 aa  111  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  25.14 
 
 		 889 aa  111  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  21.4 
 
 		 1509 aa  110  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  25.61 
 
 		 788 aa  109  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  25.61 
 
 		 788 aa  109  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  24.02 
 
 		 924 aa  110  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1310  YD repeat protein  28.99 
 
 		 2387 aa  109  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2251  YD repeat protein  25.08 
 
 		 1577 aa  108  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.37026  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  25.55 
 
 		 705 aa  108  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  25.36 
 
 		 913 aa  108  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  25.91 
 
 		 1046 aa  108  9e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  23.28 
 
 		 1400 aa  108  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  22.81 
 
 		 1385 aa  107  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  25.51 
 
 		 1530 aa  107  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  27.45 
 
 		 869 aa  107  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>