More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1967 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 2486 aa  5085    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  28.84 
 
 		 2374 aa  405  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  26.75 
 
 		 2096 aa  190  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  26.24 
 
 		 1271 aa  186  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  22.18 
 
 		 1840 aa  178  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  22.64 
 
 		 1917 aa  169  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  23.23 
 
 		 1942 aa  168  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  25.74 
 
 		 3273 aa  165  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  28.28 
 
 		 3073 aa  164  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  22.64 
 
 		 1669 aa  159  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  29.37 
 
 		 2658 aa  158  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  29.59 
 
 		 765 aa  154  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  26.61 
 
 		 1485 aa  153  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  29.11 
 
 		 2349 aa  150  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  26.43 
 
 		 2149 aa  148  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  24.28 
 
 		 1959 aa  146  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  26.51 
 
 		 1732 aa  142  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  25.19 
 
 		 2942 aa  142  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  27.05 
 
 		 1600 aa  140  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  23.74 
 
 		 3027 aa  138  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  26.4 
 
 		 1467 aa  132  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  25.18 
 
 		 2277 aa  129  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  25.53 
 
 		 1599 aa  128  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  25.67 
 
 		 678 aa  125  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.35 
 
 		 1576 aa  124  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  25.19 
 
 		 1508 aa  122  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06218  Rhs family protein  25.54 
 
 		 1008 aa  119  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.374255  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00948  Rhs family protein  25.54 
 
 		 1008 aa  119  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00234387  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05631  RHS Repeat family  25.43 
 
 		 1345 aa  119  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000440631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06221  RHS Repeat family  25.43 
 
 		 1345 aa  119  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0388129  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  26.23 
 
 		 1572 aa  117  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  25.25 
 
 		 2225 aa  117  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  22.98 
 
 		 2035 aa  117  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  25.46 
 
 		 1953 aa  117  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  24.76 
 
 		 1352 aa  115  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  24.04 
 
 		 1384 aa  115  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  28.46 
 
 		 2076 aa  114  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  26.93 
 
 		 764 aa  114  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  25.91 
 
 		 2224 aa  112  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  25.91 
 
 		 2224 aa  112  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  23.83 
 
 		 1489 aa  112  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  23.67 
 
 		 1530 aa  112  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  27.45 
 
 		 788 aa  110  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  27.45 
 
 		 788 aa  110  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  24.27 
 
 		 3193 aa  109  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6268  YD repeat-containing protein  24.26 
 
 		 1623 aa  109  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  25.42 
 
 		 2224 aa  107  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  22.64 
 
 		 1981 aa  107  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  24.74 
 
 		 1494 aa  107  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  24.74 
 
 		 1494 aa  107  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  23.76 
 
 		 1259 aa  107  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  24.05 
 
 		 1568 aa  107  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0876  YD repeat protein  32.41 
 
 		 396 aa  106  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249892 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  25.58 
 
 		 765 aa  106  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  23.43 
 
 		 2221 aa  105  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0129  Rhs family protein  25.11 
 
 		 1427 aa  104  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  24.1 
 
 		 1528 aa  104  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  23.93 
 
 		 2178 aa  104  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25.28 
 
 		 1611 aa  104  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  23.33 
 
 		 927 aa  103  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  25.28 
 
 		 705 aa  103  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  23.86 
 
 		 3689 aa  103  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  25.04 
 
 		 2246 aa  103  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  24.75 
 
 		 1834 aa  102  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  24.31 
 
 		 1464 aa  102  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  24.58 
 
 		 1609 aa  102  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  25.31 
 
 		 913 aa  102  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  24.31 
 
 		 1527 aa  102  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  25.83 
 
 		 741 aa  101  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  24.52 
 
 		 1614 aa  101  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1050  YD repeat protein  24.49 
 
 		 2731 aa  100  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32830  hypothetical protein  25.18 
 
 		 889 aa  99.8  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000050197  hitchhiker  0.0000345173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  24.25 
 
 		 1595 aa  99.4  9e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4370  YD repeat-containing protein  25.68 
 
 		 869 aa  99  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  24.25 
 
 		 1586 aa  98.2  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  23.54 
 
 		 1550 aa  98.2  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  23.75 
 
 		 1197 aa  98.6  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  24.92 
 
 		 1485 aa  98.2  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  23.44 
 
 		 1541 aa  97.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  24.34 
 
 		 924 aa  97.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  24.02 
 
 		 1390 aa  97.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  24.3 
 
 		 1495 aa  96.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  24.7 
 
 		 903 aa  96.7  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  25.63 
 
 		 6109 aa  95.9  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  23.3 
 
 		 1495 aa  95.9  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  23.34 
 
 		 1541 aa  95.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  24.19 
 
 		 2294 aa  94.7  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  24.08 
 
 		 2138 aa  94.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  23.9 
 
 		 1520 aa  94.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4142  YD repeat protein  24.37 
 
 		 1046 aa  93.2  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  24.1 
 
 		 1381 aa  93.6  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  23.38 
 
 		 1487 aa  93.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  23.25 
 
 		 1541 aa  93.2  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2324  YD repeat-containing protein  25.78 
 
 		 765 aa  92.8  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.2713  decreased coverage  0.00718158 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  23.25 
 
 		 1381 aa  92.8  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  22.72 
 
 		 1976 aa  92.4  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0467  YD repeat-containing protein  25.17 
 
 		 1081 aa  92  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1603  YD repeat protein  25.11 
 
 		 840 aa  92.4  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  23.69 
 
 		 1673 aa  91.3  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  23.82 
 
 		 1560 aa  90.9  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>