More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2325 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_2322  YD repeat-containing protein  92.93 
 
 
730 aa  766    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.505225  decreased coverage  0.0077157 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  100 
 
 
6109 aa  12230    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2324  YD repeat-containing protein  91.13 
 
 
765 aa  1072    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.2713  decreased coverage  0.00718158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  35.13 
 
 
2030 aa  509  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3524  peptidase S8 and S53  44.72 
 
 
1748 aa  468  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3548  APHP domain-containing protein  45.19 
 
 
1613 aa  409  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107963  normal  0.0158906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.53 
 
 
1454 aa  363  6e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.85 
 
 
953 aa  273  8e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000882401  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2544  APHP domain protein  43.17 
 
 
405 aa  228  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1936  APHP domain protein  30.17 
 
 
1074 aa  203  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620471  normal  0.229187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2450  APHP  35.54 
 
 
1619 aa  181  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.804574  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  22.8 
 
 
2096 aa  159  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0498  APHP  29.77 
 
 
545 aa  151  4.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0698574  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4514  YD repeat-containing protein  23.57 
 
 
3689 aa  134  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.40016 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  21.12 
 
 
3027 aa  134  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2902  YD repeat protein  23.72 
 
 
1271 aa  133  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.729617  normal 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4560  YD repeat protein  27.8 
 
 
1485 aa  130  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0004  YD repeat-containing protein  22.28 
 
 
1942 aa  129  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  31.49 
 
 
3925 aa  125  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1371  YD repeat-containing protein  22.12 
 
 
1959 aa  125  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.72 
 
 
1576 aa  120  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2046  tryptophan synthase, beta chain  22.86 
 
 
1369 aa  119  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  23.45 
 
 
1467 aa  118  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3232  YD repeat-containing protein  21.67 
 
 
1669 aa  117  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0009  YD repeat-containing protein  21.13 
 
 
1840 aa  117  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.886586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1130  wall-associated protein  25.85 
 
 
2225 aa  117  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1373  YD repeat-containing protein  21.9 
 
 
1917 aa  116  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  27.38 
 
 
3586 aa  115  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  21.26 
 
 
2035 aa  112  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1938  YD repeat protein  25.72 
 
 
678 aa  112  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  24.65 
 
 
2942 aa  111  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.04 
 
 
627 aa  109  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  24.63 
 
 
1614 aa  110  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3576  YD repeat protein  23.26 
 
 
2149 aa  108  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  hitchhiker  0.00854554 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3445  wall-associated protein  25.62 
 
 
2178 aa  106  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.837931  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1275  wall-associated protein, putative  25.78 
 
 
2221 aa  106  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  25.74 
 
 
1572 aa  106  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  25.97 
 
 
1600 aa  105  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  35.43 
 
 
2632 aa  105  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1253  wall-associated protein  26.28 
 
 
765 aa  105  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1178  putative wall-associated protein  25.93 
 
 
2224 aa  104  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.811104 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2934  YD repeat protein  26.15 
 
 
1953 aa  104  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.601825 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1022  wall-associated protein  25.57 
 
 
2224 aa  102  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1094  wall-associated protein  25.57 
 
 
2224 aa  102  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  24.73 
 
 
1352 aa  103  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1201  wall associated protein, putative  24.9 
 
 
2246 aa  101  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.491377  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0132  YD repeat protein  24.81 
 
 
2349 aa  100  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  25.88 
 
 
1951 aa  100  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.66 
 
 
1726 aa  100  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1967  YD repeat-containing protein  25.62 
 
 
2486 aa  95.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0160  YD repeat protein  28.24 
 
 
2658 aa  94.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  25.25 
 
 
1362 aa  94  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  30.92 
 
 
898 aa  94  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4869  YD repeat protein  25.49 
 
 
2290 aa  92.8  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5146  YD repeat-containing protein  36.36 
 
 
2374 aa  92.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  24.93 
 
 
1531 aa  92  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  35.86 
 
 
440 aa  91.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  24.31 
 
 
1568 aa  90.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  23.34 
 
 
2277 aa  89.4  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  23.85 
 
 
1599 aa  87.8  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  33 
 
 
2042 aa  87.8  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  31.56 
 
 
913 aa  87.8  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  24.02 
 
 
1595 aa  87.4  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0148  YD repeat protein  24.38 
 
 
765 aa  87.4  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  23.22 
 
 
3193 aa  87.4  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  39.29 
 
 
456 aa  86.7  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  23.49 
 
 
1639 aa  85.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.03 
 
 
1586 aa  84.7  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  38.06 
 
 
727 aa  83.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  25.24 
 
 
903 aa  83.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  24.91 
 
 
1485 aa  82.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  38.32 
 
 
487 aa  82.4  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  27.69 
 
 
924 aa  82.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0874  YD repeat protein  23.7 
 
 
1732 aa  82.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.409966  normal  0.012689 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  26.49 
 
 
1673 aa  81.6  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3503  YD repeat protein  25.33 
 
 
2145 aa  81.6  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  33.09 
 
 
777 aa  82  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  29.69 
 
 
561 aa  81.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1452  YD repeat protein  24.7 
 
 
1464 aa  81.6  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  24.36 
 
 
1419 aa  80.5  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  23.37 
 
 
2552 aa  80.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1255  wall-associated protein  29.06 
 
 
504 aa  79.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  29.53 
 
 
899 aa  79.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  25 
 
 
1611 aa  79.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  24.17 
 
 
1976 aa  78.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  34.09 
 
 
320 aa  79  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1689  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  33.14 
 
 
482 aa  79  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1475  YD repeat-containing protein  23.04 
 
 
2294 aa  78.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.705972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2036  YD repeat-containing protein  24.51 
 
 
3073 aa  77.8  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6111  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.45 
 
 
1558 aa  77  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.25246 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  36.53 
 
 
478 aa  76.6  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  31.76 
 
 
916 aa  76.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7436  Rhs family protein-like protein  26.11 
 
 
2076 aa  76.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  26.15 
 
 
1447 aa  76.6  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  28.07 
 
 
451 aa  76.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  25.67 
 
 
1508 aa  76.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0303  YD repeat-containing protein  26.99 
 
 
3273 aa  76.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  27.32 
 
 
2528 aa  75.5  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  28.57 
 
 
1348 aa  75.1  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1682  YD repeat-containing protein  32.57 
 
 
474 aa  74.7  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>