44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0498 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0498  APHP  100 
 
 
545 aa  1100    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0698574  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  30.83 
 
 
6109 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.88 
 
 
1454 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3524  peptidase S8 and S53  29.28 
 
 
1748 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  27.51 
 
 
2030 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2544  APHP domain protein  31.3 
 
 
405 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3548  APHP domain-containing protein  26.54 
 
 
1613 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107963  normal  0.0158906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.64 
 
 
953 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000882401  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.67 
 
 
627 aa  94.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2450  APHP  28.12 
 
 
1619 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.804574  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  27.92 
 
 
2632 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0899  hypothetical protein  24.62 
 
 
557 aa  68.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00051112  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2325  APHP  27.46 
 
 
290 aa  66.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1936  APHP domain protein  26.06 
 
 
1074 aa  63.5  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620471  normal  0.229187 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  29.84 
 
 
620 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.88 
 
 
1726 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2171  hypothetical protein  25.94 
 
 
1879 aa  57.4  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 
1192 aa  56.6  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  37.35 
 
 
1276 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 
4489 aa  50.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
452 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 
162 aa  48.9  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04725  Subtilase family protein  31.09 
 
 
145 aa  48.5  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.808731  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.5 
 
 
606 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.47 
 
 
397 aa  48.5  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 
162 aa  48.5  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  28.5 
 
 
1200 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 
471 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0980  hypothetical protein  27.72 
 
 
859 aa  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.266991 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 
4079 aa  47.8  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1915  hypothetical protein  53.49 
 
 
606 aa  47.4  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 
589 aa  47  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.13 
 
 
707 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  27.27 
 
 
2528 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.51 
 
 
784 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  37.31 
 
 
562 aa  46.2  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0396  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.71 
 
 
479 aa  45.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000000170755  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  21.77 
 
 
656 aa  44.7  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
1827 aa  44.7  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1852  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
318 aa  44.3  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.776683 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3839  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 
326 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120659 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25 
 
 
1979 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.68 
 
 
466 aa  43.9  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  33.33 
 
 
560 aa  43.9  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>