31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2450 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2450  APHP  100 
 
 		 1619 aa  3188    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.804574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  36.91 
 
 		 6109 aa  195  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  31.89 
 
 		 2030 aa  185  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3524  peptidase S8 and S53  34.53 
 
 		 1748 aa  182  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.13 
 
 		 1454 aa  172  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3548  APHP domain-containing protein  32.32 
 
 		 1613 aa  171  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107963  normal  0.0158906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.61 
 
 		 953 aa  131  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000882401  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2544  APHP domain protein  35.77 
 
 		 405 aa  128  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0498  APHP  27.96 
 
 		 545 aa  94.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0698574  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.22 
 
 		 627 aa  78.2  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  49.02 
 
 		 683 aa  75.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0899  hypothetical protein  27.24 
 
 		 557 aa  72.8  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00051112  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1936  APHP domain protein  24.96 
 
 		 1074 aa  72.4  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620471  normal  0.229187 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0401  hypothetical protein  31.88 
 
 		 497 aa  62  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.46 
 
 		 1726 aa  59.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3525  Ig family protein  42.34 
 
 		 638 aa  59.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.464381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  27.53 
 
 		 2528 aa  59.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0980  hypothetical protein  28.66 
 
 		 859 aa  56.6  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.266991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  44.05 
 
 		 3563 aa  56.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  28.63 
 
 		 2632 aa  55.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  30.38 
 
 		 913 aa  55.5  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  35.29 
 
 		 857 aa  53.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  29.73 
 
 		 631 aa  52.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  32.97 
 
 		 477 aa  48.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  32 
 
 		 483 aa  47.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0673  APHP domain-containing protein  25 
 
 		 857 aa  48.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  30.87 
 
 		 767 aa  47  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  28.43 
 
 		 926 aa  47  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  33.53 
 
 		 655 aa  46.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2325  APHP  26.98 
 
 		 290 aa  46.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  26.4 
 
 		 644 aa  46.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>