29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0980 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0980  hypothetical protein  100 
 
 
859 aa  1754    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.266991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2604  hypothetical protein  34.33 
 
 
266 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0456  hypothetical protein  34.44 
 
 
1062 aa  110  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.97303  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  32.92 
 
 
853 aa  88.6  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.99 
 
 
1454 aa  84.7  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  27.42 
 
 
6109 aa  69.7  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.92 
 
 
627 aa  60.1  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  34.74 
 
 
455 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  26.07 
 
 
351 aa  55.1  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.33 
 
 
1726 aa  54.7  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.4 
 
 
953 aa  54.7  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000882401  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  24.36 
 
 
288 aa  53.5  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3524  peptidase S8 and S53  27.6 
 
 
1748 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2450  APHP  28.39 
 
 
1619 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.804574  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  26.79 
 
 
279 aa  51.6  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  27.8 
 
 
2030 aa  51.2  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  25.97 
 
 
322 aa  50.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  31.43 
 
 
615 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  32.11 
 
 
333 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  37.31 
 
 
713 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04725  Subtilase family protein  30.61 
 
 
145 aa  48.9  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.808731  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0498  APHP  27.72 
 
 
545 aa  48.1  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0698574  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  30.83 
 
 
334 aa  47.8  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3548  APHP domain-containing protein  25 
 
 
1613 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107963  normal  0.0158906 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  25.41 
 
 
306 aa  47.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  23.77 
 
 
713 aa  46.6  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  30.69 
 
 
311 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  27.04 
 
 
425 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0902  hypothetical protein  30.88 
 
 
545 aa  44.3  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.440975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>