36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17060 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  100 
 
 		 351 aa  717    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  59.64 
 
 		 327 aa  260  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  59.56 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  58.53 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  47.83 
 
 		 334 aa  251  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  56.31 
 
 		 338 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.647344 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  48.72 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  44.31 
 
 		 333 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  49.3 
 
 		 288 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  46.93 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  42.67 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  45.05 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  43.24 
 
 		 279 aa  170  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  36.07 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  32.53 
 
 		 713 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4597  hypothetical protein  34.03 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  42.54 
 
 		 712 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  34.48 
 
 		 361 aa  102  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45412  predicted protein  29.08 
 
 		 500 aa  101  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0911606  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45988  predicted protein  32.92 
 
 		 693 aa  97.8  2e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  34.87 
 
 		 311 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  41.26 
 
 		 788 aa  96.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  33.77 
 
 		 679 aa  94  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43196  predicted protein  32.92 
 
 		 588 aa  93.2  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45995  predicted protein  32.1 
 
 		 559 aa  90.5  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0105991  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  32.78 
 
 		 303 aa  89.4  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  29.74 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  29.89 
 
 		 623 aa  82.8  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  29.46 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  35.29 
 
 		 669 aa  73.2  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  27.8 
 
 		 853 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0980  hypothetical protein  26.07 
 
 		 859 aa  54.7  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.266991 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2734  hypothetical protein  30.33 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000198645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2701  hypothetical protein  29.88 
 
 		 355 aa  50.8  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.627939  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0456  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1062 aa  47  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.97303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  24.49 
 
 		 601 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>