32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4297 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  100 
 
 
279 aa  590  1e-168  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  42.12 
 
 
294 aa  211  7.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  43.24 
 
 
351 aa  170  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  41.78 
 
 
306 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  35.74 
 
 
312 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  37.45 
 
 
327 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  36.13 
 
 
338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.647344 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  33.81 
 
 
327 aa  152  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  38.24 
 
 
334 aa  152  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  39.09 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  33.82 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  33.77 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  35.59 
 
 
311 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  30.72 
 
 
311 aa  109  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45412  predicted protein  32.54 
 
 
500 aa  90.1  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0911606  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  30.96 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45988  predicted protein  30.33 
 
 
693 aa  87  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.284744  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43196  predicted protein  29.71 
 
 
588 aa  86.3  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4597  hypothetical protein  38.85 
 
 
318 aa  85.9  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45995  predicted protein  35.4 
 
 
559 aa  85.1  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0105991  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  29.79 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  24.56 
 
 
713 aa  80.1  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  28.78 
 
 
788 aa  70.5  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  32.7 
 
 
712 aa  69.3  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  32.1 
 
 
669 aa  69.3  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  33.33 
 
 
311 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  26.45 
 
 
623 aa  65.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  32.05 
 
 
679 aa  65.1  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  29.88 
 
 
425 aa  61.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  39.13 
 
 
455 aa  58.9  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0456  hypothetical protein  26.95 
 
 
1062 aa  56.6  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.97303  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0980  hypothetical protein  26.79 
 
 
859 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.266991 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>