36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1071 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1071  metalloprotease  100 
 
 		 425 aa  883    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25226  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1918  hypothetical protein  39.51 
 
 		 455 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.169156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  38.27 
 
 		 788 aa  209  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2972  metalloprotease  34.8 
 
 		 623 aa  199  9e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.603107  normal  0.306607 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  34.51 
 
 		 669 aa  176  7e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4597  hypothetical protein  36.88 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04980  hypothetical protein  37.99 
 
 		 361 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4712  hypothetical protein  32.59 
 
 		 712 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148255  normal  0.0369897 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4907  hypothetical protein  36.05 
 
 		 303 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2485  hypothetical protein  33.52 
 
 		 679 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2377  hypothetical protein  35.4 
 
 		 311 aa  136  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.599854  hitchhiker  0.00155806 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0319  hypothetical protein  31.72 
 
 		 713 aa  132  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503952  normal  0.313139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1716  hypothetical protein  29.96 
 
 		 311 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal  0.128089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0377  Peptidase M43B pregnancy-associated plasma-A  31.4 
 
 		 327 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0063  hypothetical protein  30.21 
 
 		 334 aa  91.3  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.430351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0488  hypothetical protein  29.41 
 
 		 306 aa  90.1  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4739  hypothetical protein  28.98 
 
 		 312 aa  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.765345 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17060  Pregnancy-associated plasma protein-A  29.25 
 
 		 351 aa  89.7  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0928  hypothetical protein  28.19 
 
 		 322 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3880  hypothetical protein  30.31 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3096  metalloprotease MEP1-like protein  28.4 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06426  conserved hypothetical protein  27.43 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00000204888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0549  hypothetical protein  28.02 
 
 		 338 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.647344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2505  metalloprotease MEP1-like protein  25.18 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4297  metalloprotease MEP1-like protein  28.47 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.101108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  22.31 
 
 		 601 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05101  metalloprotease MEP1 (AFU_orthologue; AFUA_1G07730)  24.58 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000175375 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  29.33 
 
 		 957 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0980  hypothetical protein  27.04 
 
 		 859 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.266991 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  35.37 
 
 		 797 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0354  hypothetical protein  27.71 
 
 		 287 aa  43.9  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0589799  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10753  putative membrane-anchored cell surface protein  28.75 
 
 		 827 aa  43.9  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2259  Carbohydrate binding family 6  28.42 
 
 		 713 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5267  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 426 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  38.03 
 
 		 1154 aa  43.1  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0074  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.24 
 
 		 1133 aa  43.1  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659099  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>