42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0902 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0902  hypothetical protein  100 
 
 		 545 aa  1116    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.440975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02276  vcbs repeat-containing protein  29.87 
 
 		 6276 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  31.54 
 
 		 8871 aa  144  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1047  hypothetical protein  35.79 
 
 		 492 aa  139  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000670981  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5708  peptidase domain protein  23.58 
 
 		 492 aa  91.7  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4802  hypothetical protein  23.31 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  25.96 
 
 		 1764 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  30.66 
 
 		 615 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  22.73 
 
 		 1263 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0783  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  24.75 
 
 		 3323 aa  57.8  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2523  hypothetical protein  22.03 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  34.48 
 
 		 613 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  31.97 
 
 		 3394 aa  53.9  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  29.67 
 
 		 884 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0797  hypothetical protein  24.73 
 
 		 1140 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  34.44 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4119  hypothetical protein  22.38 
 
 		 422 aa  52  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000696005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2387  hypothetical protein  25.24 
 
 		 419 aa  51.2  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0871  hypothetical protein  23.38 
 
 		 419 aa  50.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0922  hypothetical protein  35.21 
 
 		 730 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0622402  normal  0.970472 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  28.92 
 
 		 655 aa  48.1  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  24.43 
 
 		 16322 aa  47.4  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0145  hypothetical protein  24.62 
 
 		 961 aa  46.6  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2102  immunoreactive 61 kDa antigen PG91  34.72 
 
 		 540 aa  46.6  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1456  hypothetical protein  30.56 
 
 		 1024 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00611896  normal  0.0757666 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  36.11 
 
 		 1126 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4032  hypothetical protein  22.64 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.786838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6926  hypothetical protein  26.67 
 
 		 502 aa  45.8  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2716  PKD domain containing protein  26.05 
 
 		 664 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575961  normal  0.0544825 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1599  BNR/Asp-box repeat-containing protein  23.62 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.157669  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  27.27 
 
 		 957 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  32.98 
 
 		 981 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1243 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  36.23 
 
 		 1441 aa  44.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  32.86 
 
 		 541 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0980  hypothetical protein  30.88 
 
 		 859 aa  44.3  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.266991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  32.97 
 
 		 1275 aa  43.9  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01825  hypothetical protein  34.72 
 
 		 654 aa  43.9  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  28.24 
 
 		 927 aa  43.9  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1798  immunoreactive 46 kDa antigen PG99  24.21 
 
 		 405 aa  43.9  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  32.47 
 
 		 2239 aa  43.9  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2998  hypothetical protein  22.67 
 
 		 416 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>