213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4175 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 541 aa  1091    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  45.34 
 
 		 536 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  66.82 
 
 		 884 aa  301  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  64.71 
 
 		 957 aa  285  1.0000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4560  glycoside hydrolase family protein  40.13 
 
 		 340 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  39.93 
 
 		 1115 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  66.94 
 
 		 389 aa  173  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  63.11 
 
 		 465 aa  156  7e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  42.13 
 
 		 726 aa  156  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  39.81 
 
 		 1132 aa  143  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  51.15 
 
 		 610 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  57.85 
 
 		 383 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  32.11 
 
 		 578 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  45.86 
 
 		 673 aa  139  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  45.65 
 
 		 569 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  47.9 
 
 		 1167 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  26.97 
 
 		 801 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  35.47 
 
 		 1391 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  49.11 
 
 		 461 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  44.72 
 
 		 705 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3523  glycoside hydrolase family protein  28.37 
 
 		 375 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.416811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  36 
 
 		 863 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  44.26 
 
 		 982 aa  99.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  44.63 
 
 		 639 aa  97.4  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  40.62 
 
 		 877 aa  95.5  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  40.8 
 
 		 503 aa  94  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  35.9 
 
 		 550 aa  91.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  41.48 
 
 		 501 aa  91.3  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  39.17 
 
 		 869 aa  90.5  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  41.32 
 
 		 853 aa  84.3  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  25.71 
 
 		 401 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  24.13 
 
 		 377 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  40.16 
 
 		 1444 aa  81.6  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  38.28 
 
 		 469 aa  80.9  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  36.23 
 
 		 1290 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  28.86 
 
 		 427 aa  80.5  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  37.31 
 
 		 566 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.11 
 
 		 933 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  28.34 
 
 		 827 aa  79  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  31.65 
 
 		 490 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  29.57 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  36.05 
 
 		 1015 aa  77.8  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  39.1 
 
 		 951 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  35.08 
 
 		 918 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  34.73 
 
 		 965 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  24.87 
 
 		 499 aa  76.6  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  36.52 
 
 		 1024 aa  75.9  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  37.59 
 
 		 470 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  25.12 
 
 		 634 aa  75.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  35 
 
 		 1091 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  26.37 
 
 		 521 aa  74.3  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1392  glycoside hydrolase family 18  31.44 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.282919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  38.38 
 
 		 845 aa  73.6  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  24.29 
 
 		 388 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  33.09 
 
 		 912 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  36.92 
 
 		 629 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  26.57 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  28.8 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  35.62 
 
 		 719 aa  72.8  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00541  conserved hypothetical protein  27.11 
 
 		 1598 aa  72  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  35.54 
 
 		 948 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_93383  predicted protein  28.04 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.111768  normal  0.0677184 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  25.07 
 
 		 372 aa  71.2  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  35.25 
 
 		 928 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  29.79 
 
 		 802 aa  70.5  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  33.58 
 
 		 1164 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  30.04 
 
 		 524 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  38 
 
 		 1380 aa  69.7  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  36 
 
 		 535 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  27.79 
 
 		 366 aa  69.3  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  37.76 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  35.34 
 
 		 604 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  41.35 
 
 		 618 aa  69.3  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  35.92 
 
 		 819 aa  68.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.85 
 
 		 945 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  29.18 
 
 		 792 aa  68.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  37.96 
 
 		 823 aa  67.8  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  26.78 
 
 		 536 aa  68.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  31.97 
 
 		 630 aa  67.8  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  33.08 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  28.03 
 
 		 1271 aa  67.4  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  34.31 
 
 		 1356 aa  67.4  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  36 
 
 		 870 aa  67.4  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  27.46 
 
 		 652 aa  67.4  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  25.53 
 
 		 1782 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  23.43 
 
 		 674 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44884  chitinase glycoside hydrolase family 1  24.05 
 
 		 344 aa  66.6  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  34.92 
 
 		 1122 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  22.83 
 
 		 505 aa  65.5  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  26.51 
 
 		 639 aa  65.9  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  27.15 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  35.71 
 
 		 1707 aa  65.1  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  36.05 
 
 		 746 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  23.63 
 
 		 674 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  24.42 
 
 		 674 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  40.23 
 
 		 1295 aa  64.3  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  27.85 
 
 		 780 aa  64.3  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  23.98 
 
 		 674 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  23.71 
 
 		 674 aa  63.9  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  25.39 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>