100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3927 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  100 
 
 		 465 aa  957    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  47.25 
 
 		 726 aa  208  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  58.04 
 
 		 389 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  41.23 
 
 		 884 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  59.52 
 
 		 957 aa  160  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  63.11 
 
 		 541 aa  157  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  57.94 
 
 		 536 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  57.72 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  52.03 
 
 		 610 aa  133  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  46.85 
 
 		 569 aa  127  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  49.21 
 
 		 673 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  49.17 
 
 		 1167 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3094  beta and gamma crystallin  57.95 
 
 		 450 aa  110  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.439475 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  47.06 
 
 		 705 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  45.53 
 
 		 1391 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  46.79 
 
 		 461 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2446  hypothetical protein  33.33 
 
 		 599 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0772125  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  36.67 
 
 		 982 aa  96.7  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  40.34 
 
 		 1132 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28100  hypothetical protein  31.37 
 
 		 602 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  36.11 
 
 		 869 aa  89.7  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  40.83 
 
 		 877 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4162  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  28.35 
 
 		 596 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3651  glycoside hydrolase family 76  46.34 
 
 		 613 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120555  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  35.04 
 
 		 1091 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  37.01 
 
 		 863 aa  81.3  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0043  hypothetical protein  28.69 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  33.81 
 
 		 503 aa  78.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2188  peptidase domain protein  46.84 
 
 		 692 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000255141  hitchhiker  0.000237212 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  33.1 
 
 		 853 aa  77.4  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  32.34 
 
 		 483 aa  76.6  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  35.11 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  39.67 
 
 		 639 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  36.52 
 
 		 550 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  35.34 
 
 		 948 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  41.28 
 
 		 615 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  33.91 
 
 		 918 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  35.88 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.2 
 
 		 933 aa  70.5  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  37.93 
 
 		 1187 aa  70.1  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2581  hypothetical protein  39.8 
 
 		 484 aa  70.1  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000219453  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  31.03 
 
 		 500 aa  69.7  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  33.03 
 
 		 1141 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  34.11 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  26.48 
 
 		 823 aa  67  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  40.7 
 
 		 1295 aa  66.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1024 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0017  hypothetical protein  28.83 
 
 		 630 aa  61.6  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 845 aa  61.6  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  30 
 
 		 719 aa  61.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.92 
 
 		 1321 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1414  hypothetical protein  34.31 
 
 		 1292 aa  60.1  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  29.08 
 
 		 802 aa  59.7  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  34.81 
 
 		 951 aa  59.3  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  32.69 
 
 		 840 aa  58.9  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  32.56 
 
 		 1444 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  28.37 
 
 		 870 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  34.09 
 
 		 1707 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  32.65 
 
 		 798 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  25.93 
 
 		 2062 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  28.79 
 
 		 1290 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.51 
 
 		 945 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  28.26 
 
 		 819 aa  57.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  26.67 
 
 		 1338 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  30.69 
 
 		 1380 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  31.76 
 
 		 955 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0346  hypothetical protein  32.61 
 
 		 569 aa  53.9  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  32.54 
 
 		 501 aa  53.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  24.77 
 
 		 526 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  30.16 
 
 		 912 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0320  Ricin B lectin  27.55 
 
 		 565 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  0.136179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  26.32 
 
 		 664 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  41.43 
 
 		 972 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  28.43 
 
 		 1356 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  30.36 
 
 		 630 aa  51.6  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  28.19 
 
 		 965 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  26.24 
 
 		 786 aa  50.8  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  33.33 
 
 		 490 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  26.76 
 
 		 777 aa  49.7  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  33.59 
 
 		 1164 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  28 
 
 		 928 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  27.86 
 
 		 535 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  29.01 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.82 
 
 		 1505 aa  48.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  31.52 
 
 		 1200 aa  47.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  29 
 
 		 735 aa  47.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  25.89 
 
 		 930 aa  47  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  30.11 
 
 		 966 aa  47  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  26.6 
 
 		 1799 aa  47  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  22.22 
 
 		 1234 aa  47  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  30.61 
 
 		 801 aa  46.6  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  31.37 
 
 		 2554 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  27.45 
 
 		 524 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5002  Carbohydrate binding family 6  25.44 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173534  normal  0.970629 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  28.79 
 
 		 479 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  28.23 
 
 		 604 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1051  Serine O-acetyltransferase  32.94 
 
 		 700 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  32.69 
 
 		 3295 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  27.2 
 
 		 746 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  29.41 
 
 		 1732 aa  43.9  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>