242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2193 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  100 
 
 		 948 aa  1929    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  51.11 
 
 		 1406 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  41 
 
 		 933 aa  120  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  45.07 
 
 		 1024 aa  114  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  46.67 
 
 		 705 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  43.42 
 
 		 1799 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  41.55 
 
 		 801 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  41.55 
 
 		 918 aa  108  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  42.66 
 
 		 569 aa  107  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  38.19 
 
 		 526 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1393  thiol oxidoreductase-like  36.82 
 
 		 1707 aa  104  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.619739  normal  0.222979 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  41.67 
 
 		 550 aa  103  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  42.96 
 
 		 954 aa  103  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  31.18 
 
 		 863 aa  102  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  43.57 
 
 		 500 aa  102  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3003  hypothetical protein  41.13 
 
 		 1167 aa  102  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.25795  hitchhiker  0.000812606 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  40 
 
 		 798 aa  102  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  43.97 
 
 		 819 aa  102  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  30.25 
 
 		 982 aa  101  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  44.29 
 
 		 870 aa  102  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  31.45 
 
 		 965 aa  101  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  36.47 
 
 		 930 aa  101  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  43.97 
 
 		 823 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  43.57 
 
 		 1234 aa  98.6  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  42.55 
 
 		 1356 aa  98.6  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  38.07 
 
 		 1262 aa  98.2  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2494  hypothetical protein  42.28 
 
 		 610 aa  97.4  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  41.96 
 
 		 919 aa  97.4  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  42.55 
 
 		 802 aa  97.4  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  53.26 
 
 		 928 aa  97.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  40.14 
 
 		 845 aa  97.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  37.41 
 
 		 581 aa  96.3  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  46.79 
 
 		 1132 aa  96.3  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  38.64 
 
 		 735 aa  95.9  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2929  hypothetical protein  42.86 
 
 		 673 aa  95.1  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  36.88 
 
 		 1035 aa  95.5  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  37 
 
 		 627 aa  94  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  38.1 
 
 		 1295 aa  93.6  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  41.13 
 
 		 1380 aa  93.6  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  68.75 
 
 		 501 aa  93.2  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  40.43 
 
 		 777 aa  92.8  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  41.84 
 
 		 524 aa  92  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  41.13 
 
 		 719 aa  90.5  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  41.84 
 
 		 840 aa  90.1  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  39.86 
 
 		 1732 aa  89.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.46 
 
 		 1321 aa  90.1  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  35.66 
 
 		 1338 aa  89.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  36.84 
 
 		 503 aa  89  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0431  Carbohydrate binding family 6  33.57 
 
 		 966 aa  89  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.174739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  35.37 
 
 		 630 aa  88.2  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  38.62 
 
 		 1004 aa  87.8  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  63.77 
 
 		 837 aa  87  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  39.86 
 
 		 2554 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  36.13 
 
 		 855 aa  87.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  40.41 
 
 		 786 aa  86.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  38.03 
 
 		 3295 aa  85.5  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6229  Carbohydrate binding family 6  42.98 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2832  hypothetical protein  40.71 
 
 		 877 aa  83.2  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0897926  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  59.38 
 
 		 533 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  38.18 
 
 		 869 aa  82.8  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  61.9 
 
 		 707 aa  82.8  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  36.42 
 
 		 522 aa  82.8  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  64.52 
 
 		 982 aa  82  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  32.18 
 
 		 639 aa  81.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3536  Carbohydrate binding family 6  38.6 
 
 		 726 aa  80.1  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.414252  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2209  Carbohydrate binding family 6  36.17 
 
 		 739 aa  80.1  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.858511  normal  0.120589 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2179  Pectate lyase/Amb allergen  49.32 
 
 		 922 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  30.94 
 
 		 468 aa  79  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  38.74 
 
 		 1391 aa  78.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2186  glycoside hydrolase family 18  39.83 
 
 		 536 aa  78.2  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0363978  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  58.73 
 
 		 511 aa  78.2  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  40.28 
 
 		 627 aa  77  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  36.44 
 
 		 389 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  50.72 
 
 		 649 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0912  glycoside hydrolase family protein  58.06 
 
 		 1077 aa  76.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  64.41 
 
 		 679 aa  76.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2949  pectinesterase  48.57 
 
 		 567 aa  77  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.765546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0044  cellulosome enzyme, dockerin type I  61.29 
 
 		 533 aa  75.5  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1207  cellulosome protein dockerin type I  50 
 
 		 873 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  50 
 
 		 683 aa  75.5  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  32.86 
 
 		 1387 aa  75.1  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  44.3 
 
 		 736 aa  74.3  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3927  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  35.34 
 
 		 465 aa  72.8  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  42.42 
 
 		 334 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1472  carbohydrate-binding family 11 protein  35.59 
 
 		 900 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.980604  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2038  cellulosome enzyme, dockerin type I  55.56 
 
 		 807 aa  72  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  37.96 
 
 		 853 aa  72  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  60.32 
 
 		 741 aa  72  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2760  glycoside hydrolase family protein  52.94 
 
 		 961 aa  72  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26535  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  35.54 
 
 		 884 aa  71.6  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4175  glycoside hydrolase family protein  35.54 
 
 		 541 aa  71.6  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  37.29 
 
 		 957 aa  71.6  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  28.87 
 
 		 834 aa  70.9  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0269  glycoside hydrolase family protein  50.77 
 
 		 477 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.275199  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  49.41 
 
 		 895 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  41.44 
 
 		 383 aa  70.1  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  33.33 
 
 		 972 aa  70.1  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  52.17 
 
 		 730 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0032  glycoside hydrolase family protein  44.93 
 
 		 590 aa  68.6  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00146021  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2811  glycoside hydrolase family protein  41.89 
 
 		 591 aa  68.2  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>