148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3218 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 798 aa  1642    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  48.96 
 
 		 663 aa  598  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  57.05 
 
 		 483 aa  560  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  40 
 
 		 464 aa  334  5e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  41.98 
 
 		 466 aa  326  9e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  40.91 
 
 		 532 aa  323  9.000000000000001e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  39.54 
 
 		 515 aa  302  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  37.85 
 
 		 505 aa  293  1e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  37.18 
 
 		 484 aa  292  2e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  36.13 
 
 		 537 aa  291  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  36.09 
 
 		 606 aa  287  4e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  36.09 
 
 		 584 aa  287  5.999999999999999e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  36.14 
 
 		 495 aa  265  3e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  33.86 
 
 		 534 aa  258  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1302  glycoside hydrolase family alpha-L-fucosidase  31.42 
 
 		 540 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.186001 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  32.68 
 
 		 516 aa  207  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  32.61 
 
 		 486 aa  205  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  32.02 
 
 		 731 aa  200  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4241  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L- fucosidase)  29.21 
 
 		 555 aa  198  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.525329  normal  0.717793 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  30.97 
 
 		 446 aa  184  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  30.77 
 
 		 446 aa  184  8.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  31.82 
 
 		 490 aa  177  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  29.98 
 
 		 478 aa  177  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  33.07 
 
 		 463 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  30.26 
 
 		 471 aa  167  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  29.72 
 
 		 473 aa  162  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  26.29 
 
 		 500 aa  150  6e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  30.3 
 
 		 482 aa  146  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  31.28 
 
 		 474 aa  140  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  27.45 
 
 		 464 aa  137  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  27.08 
 
 		 492 aa  134  5e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  29.23 
 
 		 408 aa  127  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  41.26 
 
 		 801 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  25.2 
 
 		 435 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0488  Carbohydrate binding family 6  43.05 
 
 		 1799 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  42.36 
 
 		 972 aa  113  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  27.52 
 
 		 538 aa  113  1.0000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  26.08 
 
 		 441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  24.75 
 
 		 446 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1961  Endo-1,4-beta-xylanase  39.22 
 
 		 524 aa  111  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1779  Carbohydrate binding family 6  35.37 
 
 		 526 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00214562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  39.46 
 
 		 1035 aa  107  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  24.88 
 
 		 452 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  41.22 
 
 		 581 aa  105  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  24.93 
 
 		 435 aa  104  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  27.59 
 
 		 596 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  43.2 
 
 		 948 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  41.06 
 
 		 823 aa  103  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  39.46 
 
 		 1132 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  24.23 
 
 		 431 aa  102  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  39.74 
 
 		 845 aa  101  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  39.73 
 
 		 819 aa  101  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  25.69 
 
 		 473 aa  101  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  39.29 
 
 		 982 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  25.14 
 
 		 429 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  39.04 
 
 		 870 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  36.49 
 
 		 1234 aa  99.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  37.93 
 
 		 1732 aa  99.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  38.36 
 
 		 1356 aa  99.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  24.89 
 
 		 445 aa  99.4  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  39.04 
 
 		 802 aa  99  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  32.72 
 
 		 1295 aa  98.6  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  22.63 
 
 		 479 aa  98.6  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  36.77 
 
 		 1004 aa  98.2  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  37.93 
 
 		 2554 aa  98.2  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  38.93 
 
 		 918 aa  96.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  26.03 
 
 		 644 aa  95.1  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  36.91 
 
 		 840 aa  94.7  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2137  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 1262 aa  94.4  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.138075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.83 
 
 		 933 aa  94  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  25.85 
 
 		 440 aa  94  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  36.55 
 
 		 3295 aa  93.6  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  37.93 
 
 		 1380 aa  93.6  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  23.19 
 
 		 479 aa  93.6  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  24.59 
 
 		 711 aa  93.2  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  25 
 
 		 415 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  40.82 
 
 		 735 aa  93.2  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  33.11 
 
 		 930 aa  93.2  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.84 
 
 		 1321 aa  91.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  23.6 
 
 		 429 aa  91.3  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  24.19 
 
 		 627 aa  90.9  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  24.61 
 
 		 447 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  37.5 
 
 		 1338 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  35.62 
 
 		 719 aa  90.1  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  34.59 
 
 		 627 aa  89.4  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  39.44 
 
 		 468 aa  88.6  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0675  Carbohydrate binding family 6  36.24 
 
 		 875 aa  88.2  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  36 
 
 		 777 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  36.6 
 
 		 786 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  32.67 
 
 		 855 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  32.39 
 
 		 630 aa  84.7  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  39.33 
 
 		 954 aa  84.7  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  26.61 
 
 		 212 aa  83.6  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  24.19 
 
 		 473 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  23.24 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  23.26 
 
 		 494 aa  79  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  33.95 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3260  hypothetical protein  32.69 
 
 		 500 aa  78.6  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293464 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  38.26 
 
 		 919 aa  79  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  35.71 
 
 		 627 aa  77  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>