86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2190 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 435 aa  908    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  54.46 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  54.93 
 
 		 435 aa  504  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  44.71 
 
 		 431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  44.94 
 
 		 452 aa  339  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  41.83 
 
 		 429 aa  329  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  41.56 
 
 		 445 aa  324  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  43.17 
 
 		 440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  44.11 
 
 		 429 aa  310  4e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  40.63 
 
 		 538 aa  277  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  36.5 
 
 		 415 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  35.39 
 
 		 479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  34.56 
 
 		 408 aa  243  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  33.03 
 
 		 464 aa  238  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  32.57 
 
 		 446 aa  234  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  34.44 
 
 		 473 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  33.5 
 
 		 596 aa  217  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  34.69 
 
 		 581 aa  214  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  32.04 
 
 		 479 aa  202  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  32.59 
 
 		 711 aa  201  3e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  33.63 
 
 		 340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  31.85 
 
 		 627 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  32.98 
 
 		 479 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  34.11 
 
 		 450 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  29.37 
 
 		 474 aa  186  6e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  32.21 
 
 		 471 aa  186  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  31.7 
 
 		 485 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  31.49 
 
 		 473 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  31.07 
 
 		 478 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  29.45 
 
 		 644 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  29.87 
 
 		 494 aa  164  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  30.89 
 
 		 731 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  30.79 
 
 		 447 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  31.38 
 
 		 471 aa  161  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  31.38 
 
 		 446 aa  157  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  32.41 
 
 		 478 aa  157  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  30.79 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  30.62 
 
 		 474 aa  149  8e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  30.69 
 
 		 464 aa  147  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  28.44 
 
 		 532 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  27.91 
 
 		 537 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  29.13 
 
 		 674 aa  142  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  28.76 
 
 		 463 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  28.2 
 
 		 490 aa  139  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.37 
 
 		 467 aa  139  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  28.72 
 
 		 505 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  28.23 
 
 		 495 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  27.44 
 
 		 482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  29.11 
 
 		 466 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  28.84 
 
 		 484 aa  134  5e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  29.35 
 
 		 500 aa  131  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  26.3 
 
 		 492 aa  128  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  27.42 
 
 		 515 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  25.64 
 
 		 473 aa  127  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  27.52 
 
 		 534 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  31.44 
 
 		 690 aa  115  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  28.83 
 
 		 750 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  25.94 
 
 		 663 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  27.17 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  27.93 
 
 		 932 aa  110  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.8 
 
 		 698 aa  109  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  40.3 
 
 		 606 aa  108  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  28.9 
 
 		 581 aa  107  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  27.22 
 
 		 434 aa  106  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  40.46 
 
 		 584 aa  106  8e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  24.93 
 
 		 798 aa  104  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  27.01 
 
 		 638 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.78 
 
 		 688 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  25.14 
 
 		 516 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.9 
 
 		 487 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  25.46 
 
 		 483 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  34.62 
 
 		 704 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  27.36 
 
 		 463 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  25.93 
 
 		 486 aa  100  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  25.21 
 
 		 606 aa  99.4  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.74 
 
 		 709 aa  99.4  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  31.97 
 
 		 212 aa  99.4  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.66 
 
 		 687 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  25.7 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  26.44 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  26.44 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.64 
 
 		 704 aa  77.8  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4241  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L- fucosidase)  32.35 
 
 		 555 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.525329  normal  0.717793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1302  glycoside hydrolase family alpha-L-fucosidase  24.81 
 
 		 540 aa  65.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.186001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5083  hypothetical protein  26.42 
 
 		 715 aa  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365257  normal  0.435002 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2318  hypothetical protein  22.84 
 
 		 663 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>