83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0823 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 534 aa  1107    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  41.41 
 
 		 466 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  40.08 
 
 		 537 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  40.92 
 
 		 464 aa  361  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  38.4 
 
 		 505 aa  356  5e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  40.25 
 
 		 484 aa  355  1e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  37.15 
 
 		 532 aa  348  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  38.4 
 
 		 515 aa  343  5.999999999999999e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  37 
 
 		 606 aa  340  4e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  36.66 
 
 		 584 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  36.2 
 
 		 486 aa  277  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  34.77 
 
 		 495 aa  277  4e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4241  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L- fucosidase)  31.23 
 
 		 555 aa  270  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.525329  normal  0.717793 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  33.86 
 
 		 798 aa  257  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  32.8 
 
 		 516 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1302  glycoside hydrolase family alpha-L-fucosidase  30.75 
 
 		 540 aa  242  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.186001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  32.42 
 
 		 483 aa  223  6e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  31.78 
 
 		 663 aa  219  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  29.26 
 
 		 731 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  30.21 
 
 		 446 aa  182  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  29.84 
 
 		 478 aa  179  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  28.34 
 
 		 446 aa  177  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  31.31 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  30.2 
 
 		 490 aa  170  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  29.35 
 
 		 471 aa  169  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  26.4 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  27.36 
 
 		 482 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  26.59 
 
 		 500 aa  150  8e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  26.85 
 
 		 492 aa  149  9e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  27.92 
 
 		 435 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  26.77 
 
 		 627 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  28.5 
 
 		 474 aa  129  2.0000000000000002e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  27.52 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  24.07 
 
 		 581 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  25.87 
 
 		 441 aa  121  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  24.66 
 
 		 471 aa  120  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  26.23 
 
 		 473 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  27.37 
 
 		 446 aa  116  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  23.97 
 
 		 479 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  25.87 
 
 		 538 aa  114  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  27.4 
 
 		 464 aa  114  5e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  23.81 
 
 		 479 aa  114  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  26.52 
 
 		 408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  24.73 
 
 		 431 aa  109  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  24.44 
 
 		 478 aa  107  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  24.35 
 
 		 485 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  25.34 
 
 		 711 aa  105  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  24.53 
 
 		 473 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  23.4 
 
 		 440 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  27.03 
 
 		 596 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  27.17 
 
 		 674 aa  100  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  23.71 
 
 		 479 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  23.78 
 
 		 429 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  25.19 
 
 		 644 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  25.18 
 
 		 450 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  24.52 
 
 		 447 aa  94.4  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  21.91 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  21.89 
 
 		 445 aa  92  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  23.68 
 
 		 494 aa  90.9  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  22.83 
 
 		 429 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  24.15 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  27.85 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  26.65 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  22.19 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.33 
 
 		 487 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  27.62 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  24.65 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.57 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  26.53 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  25.16 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  24.84 
 
 		 704 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  23.55 
 
 		 690 aa  60.5  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.35 
 
 		 688 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.16 
 
 		 687 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  25 
 
 		 460 aa  58.9  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  22.07 
 
 		 932 aa  58.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  25.69 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  22.89 
 
 		 750 aa  58.2  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  24.83 
 
 		 606 aa  57.4  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.67 
 
 		 704 aa  54.7  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.4 
 
 		 709 aa  52  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  24.07 
 
 		 638 aa  50.4  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  22.83 
 
 		 581 aa  47.4  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>