84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0010 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 
538 aa  1121    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  40.63 
 
 
435 aa  277  3e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  41.71 
 
 
435 aa  276  7e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  42.06 
 
 
441 aa  276  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  39.27 
 
 
452 aa  256  8e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  37.57 
 
 
445 aa  241  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  38.57 
 
 
431 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  35.25 
 
 
473 aa  226  7e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  36.89 
 
 
429 aa  226  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  37.71 
 
 
440 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  36.59 
 
 
464 aa  223  7e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  34.16 
 
 
479 aa  220  6e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  34.89 
 
 
596 aa  216  8e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  36.89 
 
 
429 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  35.38 
 
 
415 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  33 
 
 
581 aa  201  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  31.57 
 
 
446 aa  193  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  29.95 
 
 
473 aa  187  5e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  31.98 
 
 
408 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  29.36 
 
 
479 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  31.64 
 
 
471 aa  180  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  30.53 
 
 
627 aa  177  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  30.47 
 
 
485 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  32.05 
 
 
711 aa  174  3.9999999999999995e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  29.57 
 
 
471 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  29.37 
 
 
674 aa  164  3e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  31.08 
 
 
478 aa  161  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  26.88 
 
 
479 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  30.59 
 
 
450 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  33.61 
 
 
731 aa  157  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  27.21 
 
 
494 aa  154  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  30.1 
 
 
474 aa  153  8.999999999999999e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  31.36 
 
 
478 aa  152  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  29.34 
 
 
340 aa  151  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  32.1 
 
 
492 aa  149  9e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  31.78 
 
 
490 aa  148  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  27.33 
 
 
482 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  27.21 
 
 
463 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  30.05 
 
 
505 aa  143  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  30.29 
 
 
446 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  27.81 
 
 
447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  30.21 
 
 
446 aa  140  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  28.44 
 
 
484 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  25.76 
 
 
644 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  32.13 
 
 
464 aa  137  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  29.79 
 
 
532 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  29.87 
 
 
466 aa  134  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  29.21 
 
 
606 aa  133  6.999999999999999e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  29.7 
 
 
584 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  30.68 
 
 
500 aa  131  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  31.2 
 
 
474 aa  130  8.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  28.38 
 
 
473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  28.76 
 
 
495 aa  124  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  26.13 
 
 
537 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  29.4 
 
 
515 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  25.87 
 
 
534 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  26.26 
 
 
463 aa  113  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  27.52 
 
 
798 aa  113  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.04 
 
 
467 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  25.33 
 
 
663 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  25.7 
 
 
434 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  28.27 
 
 
410 aa  103  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  22.9 
 
 
638 aa  95.5  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  24.18 
 
 
483 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  32.13 
 
 
212 aa  92.4  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.83 
 
 
698 aa  90.5  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  24.41 
 
 
932 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.62 
 
 
688 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  24.04 
 
 
690 aa  87.4  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  23.82 
 
 
750 aa  87  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  26.02 
 
 
516 aa  84  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.53 
 
 
687 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  25 
 
 
486 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  21.75 
 
 
709 aa  80.1  0.00000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  22.58 
 
 
460 aa  79.3  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  22.49 
 
 
460 aa  79.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  22.87 
 
 
606 aa  78.2  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  25.26 
 
 
704 aa  77  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  24.08 
 
 
581 aa  73.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.47 
 
 
704 aa  70.5  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  24.38 
 
 
470 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4241  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L- fucosidase)  37.78 
 
 
555 aa  63.9  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.525329  normal  0.717793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.97 
 
 
487 aa  63.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1302  glycoside hydrolase family alpha-L-fucosidase  32.53 
 
 
540 aa  54.7  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.186001 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>