175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4947 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 644 aa  1306    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  32.33 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  32.04 
 
 		 441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  29.44 
 
 		 435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  27.82 
 
 		 431 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  29.8 
 
 		 452 aa  148  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  26.69 
 
 		 473 aa  147  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  29.17 
 
 		 415 aa  147  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  28.27 
 
 		 408 aa  143  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  29.08 
 
 		 440 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  26.05 
 
 		 596 aa  140  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  27.36 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  27.59 
 
 		 429 aa  139  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  25.76 
 
 		 538 aa  138  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  27.67 
 
 		 464 aa  137  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  28.51 
 
 		 429 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  24.92 
 
 		 581 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  28.25 
 
 		 711 aa  131  5.0000000000000004e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  27.13 
 
 		 445 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  30.37 
 
 		 471 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  29.69 
 
 		 478 aa  128  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  25.44 
 
 		 627 aa  123  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  29.79 
 
 		 731 aa  121  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  27.2 
 
 		 446 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  26.06 
 
 		 463 aa  120  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  25.54 
 
 		 479 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  26.94 
 
 		 446 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  25.98 
 
 		 450 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  26.09 
 
 		 482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  26.82 
 
 		 484 aa  116  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  25.57 
 
 		 479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  25.59 
 
 		 537 aa  115  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  24.45 
 
 		 473 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  26.56 
 
 		 466 aa  114  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  27.27 
 
 		 447 aa  113  9e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  25.41 
 
 		 485 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  25.63 
 
 		 495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  25.44 
 
 		 490 aa  112  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  26.41 
 
 		 473 aa  110  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  25.07 
 
 		 340 aa  110  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  27.88 
 
 		 474 aa  108  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  24.62 
 
 		 494 aa  108  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  24.81 
 
 		 479 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  25.96 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  22.83 
 
 		 674 aa  105  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  23.39 
 
 		 492 aa  104  5e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  24.43 
 
 		 464 aa  103  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  27.27 
 
 		 500 aa  103  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  26.12 
 
 		 474 aa  99.8  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  24.94 
 
 		 534 aa  98.2  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  26.03 
 
 		 798 aa  95.1  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  22.73 
 
 		 471 aa  91.3  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  38.12 
 
 		 606 aa  90.9  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  37.5 
 
 		 584 aa  89.7  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  24.3 
 
 		 663 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  40.91 
 
 		 986 aa  84.7  0.000000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  36.11 
 
 		 532 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  35.34 
 
 		 505 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  34.21 
 
 		 1439 aa  82.4  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  30.1 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  23.18 
 
 		 483 aa  78.2  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  23.33 
 
 		 486 aa  77.8  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.15 
 
 		 688 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4241  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L- fucosidase)  26.15 
 
 		 555 aa  75.5  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.525329  normal  0.717793 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  35.38 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  24.15 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  22.9 
 
 		 932 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  24.37 
 
 		 581 aa  73.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  23.2 
 
 		 750 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  25.45 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  24.61 
 
 		 516 aa  72.8  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  25.47 
 
 		 410 aa  73.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  35.04 
 
 		 752 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  25.68 
 
 		 638 aa  69.3  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.71 
 
 		 756 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1751  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.33 
 
 		 1088 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.11 
 
 		 1321 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  24.47 
 
 		 704 aa  65.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  36.3 
 
 		 1441 aa  64.3  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.45 
 
 		 687 aa  64.3  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.88 
 
 		 1007 aa  63.9  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  36.72 
 
 		 433 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  26.25 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.88 
 
 		 755 aa  62.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  29.22 
 
 		 690 aa  62.4  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1480  coagulation factor 5/8 type domain protein  36.43 
 
 		 722 aa  62  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.5 
 
 		 962 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4824  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  37.84 
 
 		 1117 aa  62.4  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.90345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.64 
 
 		 1158 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.93 
 
 		 1246 aa  62  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  25 
 
 		 606 aa  62  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3687  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.5 
 
 		 674 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0980417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  34.88 
 
 		 850 aa  60.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.87 
 
 		 698 aa  60.8  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.04 
 
 		 709 aa  60.5  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  33.33 
 
 		 722 aa  60.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  34.51 
 
 		 801 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  34.48 
 
 		 460 aa  60.1  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0034  hypothetical protein  29.53 
 
 		 768 aa  59.7  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6675  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.33 
 
 		 929 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>