More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5042 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.43 
 
 		 1158 aa  755    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  84.56 
 
 		 1338 aa  2055    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.62 
 
 		 1072 aa  642    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 1321 aa  2609    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.18 
 
 		 933 aa  671    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  53.93 
 
 		 987 aa  767    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  38.21 
 
 		 693 aa  432  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  36.53 
 
 		 731 aa  414  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7479  Carbohydrate binding family 6  61.13 
 
 		 918 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.19 
 
 		 755 aa  395  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  34.06 
 
 		 762 aa  382  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  35.59 
 
 		 733 aa  380  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  35.59 
 
 		 733 aa  380  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  35.59 
 
 		 733 aa  379  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.5 
 
 		 758 aa  376  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  35.4 
 
 		 733 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.5 
 
 		 749 aa  376  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  34.51 
 
 		 733 aa  371  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  32.9 
 
 		 755 aa  372  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  35.25 
 
 		 733 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  35.25 
 
 		 733 aa  367  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  33.76 
 
 		 800 aa  365  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  33.8 
 
 		 731 aa  365  3e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  35.49 
 
 		 760 aa  360  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  33.85 
 
 		 731 aa  357  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  33.47 
 
 		 922 aa  355  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  33.61 
 
 		 748 aa  353  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  31.45 
 
 		 829 aa  353  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  32.77 
 
 		 745 aa  352  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.45 
 
 		 734 aa  347  7e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.51 
 
 		 790 aa  343  1e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  31.13 
 
 		 747 aa  343  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.92 
 
 		 757 aa  342  2e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  34.6 
 
 		 748 aa  340  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  32.25 
 
 		 737 aa  340  1.9999999999999998e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  31.03 
 
 		 721 aa  338  3.9999999999999995e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  34.93 
 
 		 730 aa  336  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.26 
 
 		 757 aa  333  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.35 
 
 		 711 aa  332  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.71 
 
 		 756 aa  332  3e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  33.71 
 
 		 931 aa  328  3e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  34.83 
 
 		 740 aa  326  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  32.09 
 
 		 741 aa  325  3e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  34.45 
 
 		 757 aa  323  9.999999999999999e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  33.06 
 
 		 721 aa  323  9.999999999999999e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  34.76 
 
 		 737 aa  322  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  33.43 
 
 		 750 aa  320  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  31.98 
 
 		 708 aa  320  1e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  33.24 
 
 		 691 aa  319  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  30.7 
 
 		 717 aa  319  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  33.1 
 
 		 735 aa  319  2e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  32.69 
 
 		 722 aa  317  7e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  31.18 
 
 		 793 aa  317  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  31.04 
 
 		 793 aa  316  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  31.8 
 
 		 805 aa  314  7.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  30.27 
 
 		 814 aa  314  9e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  34.81 
 
 		 779 aa  313  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  31.74 
 
 		 701 aa  313  1e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  34.81 
 
 		 748 aa  312  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.51 
 
 		 777 aa  313  2e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  31.36 
 
 		 714 aa  313  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  30.71 
 
 		 716 aa  311  5e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  34.96 
 
 		 751 aa  311  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33 
 
 		 750 aa  311  6.999999999999999e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  30.46 
 
 		 738 aa  310  9e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  34.81 
 
 		 751 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  34.81 
 
 		 751 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.21 
 
 		 813 aa  308  5.0000000000000004e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  31.86 
 
 		 749 aa  306  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33.28 
 
 		 809 aa  306  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  32.08 
 
 		 731 aa  306  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.09 
 
 		 780 aa  305  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  30.75 
 
 		 819 aa  302  3e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.61 
 
 		 762 aa  301  5e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.91 
 
 		 742 aa  297  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  28.32 
 
 		 777 aa  296  1e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  31.17 
 
 		 772 aa  295  5e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  30.16 
 
 		 685 aa  295  5e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.48 
 
 		 751 aa  293  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.98 
 
 		 758 aa  291  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  30.09 
 
 		 874 aa  290  1e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  30.21 
 
 		 790 aa  288  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  31.94 
 
 		 743 aa  288  4e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  29.14 
 
 		 778 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  28.99 
 
 		 778 aa  285  4.0000000000000003e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  33.24 
 
 		 737 aa  285  5.000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475054 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  30.04 
 
 		 822 aa  283  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  39.9 
 
 		 927 aa  282  4e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.58 
 
 		 724 aa  280  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  29.49 
 
 		 772 aa  280  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.92 
 
 		 737 aa  278  5e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.63 
 
 		 782 aa  277  1.0000000000000001e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.59 
 
 		 746 aa  273  2e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  29.12 
 
 		 905 aa  269  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.2 
 
 		 748 aa  268  7e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2190  Beta-glucosidase  30.1 
 
 		 727 aa  265  6e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499174 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.12 
 
 		 807 aa  264  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  26.54 
 
 		 771 aa  261  8e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2862  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.81 
 
 		 757 aa  259  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.61 
 
 		 751 aa  255  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>