More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3622 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  51.35 
 
 
737 aa  642    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  52.61 
 
 
735 aa  704    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  51.38 
 
 
931 aa  672    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  100 
 
 
748 aa  1524    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  54.05 
 
 
730 aa  708    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  66.85 
 
 
748 aa  952    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  44.33 
 
 
731 aa  612  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  48.37 
 
 
691 aa  559  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  45.87 
 
 
731 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  43.12 
 
 
733 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  43.12 
 
 
733 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  43.12 
 
 
733 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  45.71 
 
 
751 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  45.84 
 
 
751 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  45.98 
 
 
748 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  43.25 
 
 
733 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  45.84 
 
 
751 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  43.09 
 
 
733 aa  490  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  42.38 
 
 
731 aa  492  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  43.12 
 
 
733 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  46.16 
 
 
779 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  42.84 
 
 
733 aa  487  1e-136  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  41.37 
 
 
922 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  41.38 
 
 
731 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.8 
 
 
933 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  33.13 
 
 
829 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.19 
 
 
749 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.34 
 
 
758 aa  376  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  38.44 
 
 
987 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.38 
 
 
1072 aa  375  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.62 
 
 
1158 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  35.6 
 
 
755 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.64 
 
 
757 aa  369  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  37.24 
 
 
693 aa  366  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.21 
 
 
755 aa  365  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  33.68 
 
 
745 aa  365  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.08 
 
 
757 aa  363  6e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  34.18 
 
 
738 aa  363  8e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  33.1 
 
 
762 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.02 
 
 
734 aa  356  7.999999999999999e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.19 
 
 
711 aa  352  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  33.15 
 
 
800 aa  349  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  32.43 
 
 
721 aa  347  7e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  33.38 
 
 
747 aa  345  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  32.28 
 
 
721 aa  342  1e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.95 
 
 
750 aa  341  2e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.04 
 
 
790 aa  341  2.9999999999999998e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.47 
 
 
1321 aa  340  7e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  33.06 
 
 
793 aa  335  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  34.14 
 
 
737 aa  334  3e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  35.79 
 
 
740 aa  334  4e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  32.22 
 
 
722 aa  334  5e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  32.93 
 
 
793 aa  334  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  32.12 
 
 
814 aa  332  1e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  31.95 
 
 
717 aa  332  2e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  31.91 
 
 
714 aa  332  2e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  33.01 
 
 
685 aa  331  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.29 
 
 
746 aa  329  1.0000000000000001e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  35.74 
 
 
750 aa  328  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  34.76 
 
 
701 aa  325  2e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  32.59 
 
 
741 aa  322  1.9999999999999998e-86  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  32.78 
 
 
1338 aa  319  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  34.52 
 
 
708 aa  319  1e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.18 
 
 
737 aa  318  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.34 
 
 
742 aa  317  5e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  32.66 
 
 
757 aa  315  2.9999999999999996e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.6 
 
 
780 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.42 
 
 
777 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  33.87 
 
 
760 aa  308  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.73 
 
 
758 aa  306  8.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.71 
 
 
813 aa  305  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  32.45 
 
 
749 aa  303  5.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.65 
 
 
809 aa  296  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2327  beta-glucosidase  42.27 
 
 
549 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268142  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.18 
 
 
751 aa  291  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  30.25 
 
 
772 aa  291  3e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  30.22 
 
 
716 aa  291  4e-77  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  35.21 
 
 
737 aa  287  5.999999999999999e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.32 
 
 
724 aa  286  7e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.92 
 
 
756 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.38 
 
 
748 aa  280  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  29.83 
 
 
819 aa  278  3e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  29.73 
 
 
874 aa  277  5e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.91 
 
 
762 aa  270  8e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 
805 aa  263  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  28.01 
 
 
777 aa  258  3e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  29.37 
 
 
743 aa  256  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04102  beta-glucosidase (Eurofung)  29.88 
 
 
854 aa  251  4e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  29.79 
 
 
822 aa  250  5e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  29.99 
 
 
772 aa  250  9e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1704  beta-glucosidase  41.19 
 
 
380 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1911  beta-glucosidase  41.19 
 
 
380 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  32.67 
 
 
905 aa  243  9e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  28.49 
 
 
772 aa  243  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  29.88 
 
 
764 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  30.7 
 
 
859 aa  241  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  27.92 
 
 
759 aa  241  4e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  28.95 
 
 
790 aa  240  6.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1703  putative beta-glucosidase  41.38 
 
 
375 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.821899  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1910  putative beta-glucosidase  41.38 
 
 
375 aa  236  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>