More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0886 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.14 
 
 		 758 aa  704    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.89 
 
 		 750 aa  724    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.57 
 
 		 758 aa  654    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.94 
 
 		 749 aa  709    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  53.06 
 
 		 757 aa  660    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.68 
 
 		 755 aa  720    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  49.33 
 
 		 740 aa  684    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  55.03 
 
 		 760 aa  712    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  47.48 
 
 		 749 aa  641    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  56.23 
 
 		 777 aa  733    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.88 
 
 		 742 aa  649    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  45.62 
 
 		 747 aa  653    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 751 aa  1499    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  51.21 
 
 		 757 aa  696    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  49.87 
 
 		 750 aa  703    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  47.23 
 
 		 762 aa  723    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  47.94 
 
 		 755 aa  726    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.56 
 
 		 790 aa  644    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  48.52 
 
 		 800 aa  633  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  46.77 
 
 		 737 aa  619  1e-176  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.6 
 
 		 748 aa  609  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  45.13 
 
 		 741 aa  605  9.999999999999999e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.39 
 
 		 737 aa  593  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.13 
 
 		 813 aa  575  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  52.01 
 
 		 809 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  45.08 
 
 		 874 aa  531  1e-149  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.11 
 
 		 780 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  39.56 
 
 		 793 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  39.56 
 
 		 793 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  37.43 
 
 		 721 aa  458  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.43 
 
 		 734 aa  457  1e-127  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  36.18 
 
 		 745 aa  459  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  39.34 
 
 		 738 aa  445  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.47 
 
 		 711 aa  425  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  39.25 
 
 		 708 aa  419  1e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  36.54 
 
 		 714 aa  416  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  36.21 
 
 		 717 aa  419  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  36.68 
 
 		 721 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  39.24 
 
 		 701 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  36.22 
 
 		 722 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  36.7 
 
 		 716 aa  392  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  35.81 
 
 		 814 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.36 
 
 		 757 aa  372  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.52 
 
 		 933 aa  365  1e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.83 
 
 		 497 aa  361  3e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.95 
 
 		 756 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  34.27 
 
 		 731 aa  355  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  38.69 
 
 		 693 aa  346  8e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.11 
 
 		 1072 aa  340  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  37.4 
 
 		 987 aa  338  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  33.62 
 
 		 685 aa  327  4.0000000000000003e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.08 
 
 		 724 aa  325  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  35.52 
 
 		 733 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  35.52 
 
 		 733 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  35.15 
 
 		 733 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  35.52 
 
 		 733 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  33.04 
 
 		 829 aa  315  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  34.73 
 
 		 733 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  36.43 
 
 		 748 aa  312  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  34.82 
 
 		 733 aa  312  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  34.31 
 
 		 733 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  36.71 
 
 		 691 aa  310  8e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.43 
 
 		 754 aa  308  3e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  35.33 
 
 		 737 aa  307  5.0000000000000004e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  34.9 
 
 		 730 aa  306  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  33.8 
 
 		 731 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.92 
 
 		 1158 aa  304  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.62 
 
 		 762 aa  301  4e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  33.52 
 
 		 731 aa  301  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  35.18 
 
 		 748 aa  300  6e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  33.52 
 
 		 922 aa  299  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  34.79 
 
 		 751 aa  297  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  35.9 
 
 		 779 aa  296  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  34.79 
 
 		 748 aa  296  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  34.79 
 
 		 751 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  34.79 
 
 		 751 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.31 
 
 		 760 aa  295  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  33.38 
 
 		 805 aa  295  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  35.36 
 
 		 738 aa  295  2e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  32.23 
 
 		 763 aa  294  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  32.62 
 
 		 808 aa  293  6e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2190  Beta-glucosidase  32.92 
 
 		 727 aa  293  9e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499174 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  32.7 
 
 		 765 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.73 
 
 		 814 aa  291  4e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  32.85 
 
 		 753 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.55 
 
 		 820 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  30.37 
 
 		 777 aa  290  6e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  32.7 
 
 		 755 aa  290  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.38 
 
 		 792 aa  289  1e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4290  beta-glucosidase  32.51 
 
 		 765 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  32.55 
 
 		 755 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  32.55 
 
 		 755 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2512  periplasmic beta-glucosidase  32.55 
 
 		 755 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  45.04 
 
 		 823 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  43.14 
 
 		 914 aa  288  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  41.99 
 
 		 831 aa  288  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  43.42 
 
 		 915 aa  287  5.999999999999999e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  32.08 
 
 		 763 aa  287  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.44 
 
 		 1321 aa  286  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  32.79 
 
 		 772 aa  285  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>