More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2459 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  95.07 
 
 		 751 aa  1326    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  95.34 
 
 		 751 aa  1329    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  100 
 
 		 779 aa  1566    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  97.99 
 
 		 748 aa  1341    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  95.34 
 
 		 751 aa  1329    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  46.19 
 
 		 731 aa  630  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  49.37 
 
 		 733 aa  598  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  49.37 
 
 		 733 aa  598  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  49.37 
 
 		 733 aa  598  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  47.67 
 
 		 922 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  47.54 
 
 		 731 aa  592  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  47.72 
 
 		 731 aa  588  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  47.44 
 
 		 733 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  49.09 
 
 		 733 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  48.4 
 
 		 733 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  48.4 
 
 		 733 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  45.99 
 
 		 737 aa  541  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  46.29 
 
 		 748 aa  539  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  45.31 
 
 		 748 aa  534  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  43.96 
 
 		 735 aa  514  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  43.94 
 
 		 730 aa  501  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  42.33 
 
 		 931 aa  496  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  38.6 
 
 		 731 aa  442  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  42.86 
 
 		 691 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  40.7 
 
 		 987 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.91 
 
 		 933 aa  428  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.75 
 
 		 1072 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.79 
 
 		 758 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.79 
 
 		 749 aa  405  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  36.33 
 
 		 755 aa  397  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.73 
 
 		 755 aa  397  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  35.06 
 
 		 762 aa  393  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  35.05 
 
 		 745 aa  395  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.03 
 
 		 1158 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  39.73 
 
 		 740 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2327  beta-glucosidase  51.85 
 
 		 549 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268142  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.43 
 
 		 734 aa  382  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.9 
 
 		 757 aa  379  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.83 
 
 		 750 aa  365  1e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  33.24 
 
 		 800 aa  365  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  38.23 
 
 		 693 aa  364  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.19 
 
 		 757 aa  363  8e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  32.12 
 
 		 738 aa  361  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  36.1 
 
 		 749 aa  356  8.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.64 
 
 		 790 aa  355  1e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  34.31 
 
 		 747 aa  355  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  32.96 
 
 		 829 aa  355  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.06 
 
 		 711 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  37.63 
 
 		 750 aa  354  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.52 
 
 		 777 aa  353  5e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  33.92 
 
 		 721 aa  352  2e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  33.67 
 
 		 737 aa  349  9e-95  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.09 
 
 		 758 aa  347  7e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36 
 
 		 746 aa  345  1e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.69 
 
 		 737 aa  346  1e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.59 
 
 		 742 aa  344  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  33.42 
 
 		 722 aa  343  5e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  33.56 
 
 		 685 aa  343  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  33.38 
 
 		 793 aa  341  2.9999999999999998e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  30.62 
 
 		 721 aa  341  2.9999999999999998e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  32.92 
 
 		 793 aa  340  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1704  beta-glucosidase  53.54 
 
 		 380 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1911  beta-glucosidase  53.54 
 
 		 380 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  35.67 
 
 		 760 aa  338  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  31.68 
 
 		 717 aa  338  1.9999999999999998e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.87 
 
 		 748 aa  333  7.000000000000001e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  34.09 
 
 		 757 aa  333  1e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  32.87 
 
 		 741 aa  331  3e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  34.22 
 
 		 701 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.11 
 
 		 1321 aa  326  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  31.39 
 
 		 714 aa  325  2e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  32.17 
 
 		 814 aa  325  3e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  34.12 
 
 		 874 aa  320  7.999999999999999e-86  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  33.63 
 
 		 708 aa  318  2e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.15 
 
 		 751 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.58 
 
 		 780 aa  315  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  33.61 
 
 		 1338 aa  311  2.9999999999999997e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.13 
 
 		 809 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.84 
 
 		 813 aa  303  6.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  30.71 
 
 		 716 aa  295  2e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  31.04 
 
 		 772 aa  292  2e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151913 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  35.47 
 
 		 737 aa  290  6e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.33 
 
 		 762 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  31.43 
 
 		 819 aa  281  4e-74  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.92 
 
 		 756 aa  279  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  31.6 
 
 		 822 aa  272  1e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2190  Beta-glucosidase  32.84 
 
 		 727 aa  271  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499174 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.52 
 
 		 724 aa  264  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  32.11 
 
 		 790 aa  263  8.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  32.48 
 
 		 905 aa  261  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10482  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  34.26 
 
 		 868 aa  260  7e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.584678 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  28.33 
 
 		 777 aa  260  7e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  29.51 
 
 		 805 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.81 
 
 		 783 aa  254  6e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.75 
 
 		 736 aa  253  7e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1703  putative beta-glucosidase  42.12 
 
 		 375 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.821899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.67 
 
 		 782 aa  252  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1910  putative beta-glucosidase  42.12 
 
 		 375 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.52 
 
 		 755 aa  251  4e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.16 
 
 		 771 aa  251  5e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>