More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2530 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.13 
 
 		 750 aa  635    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.94 
 
 		 749 aa  636    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  58.88 
 
 		 740 aa  832    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  56.47 
 
 		 750 aa  848    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 748 aa  1496    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.25 
 
 		 755 aa  637    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  56.85 
 
 		 737 aa  672    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.65 
 
 		 758 aa  633  1e-180  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  42.63 
 
 		 762 aa  617  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.64 
 
 		 757 aa  611  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.36 
 
 		 751 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  48.76 
 
 		 742 aa  599  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  49.36 
 
 		 760 aa  599  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.42 
 
 		 758 aa  598  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  43.94 
 
 		 747 aa  595  1e-169  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  43.37 
 
 		 755 aa  598  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  46.97 
 
 		 777 aa  591  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  44.51 
 
 		 757 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  43.47 
 
 		 800 aa  560  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.99 
 
 		 790 aa  561  1e-158  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  40.88 
 
 		 741 aa  550  1e-155  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  45.83 
 
 		 749 aa  545  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  41.43 
 
 		 737 aa  546  1e-154  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.42 
 
 		 813 aa  534  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  47.09 
 
 		 809 aa  519  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  42.6 
 
 		 874 aa  501  1e-140  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.54 
 
 		 780 aa  492  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  36.36 
 
 		 793 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  36.5 
 
 		 793 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  35.8 
 
 		 745 aa  429  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  38.06 
 
 		 708 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  35.53 
 
 		 814 aa  409  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.69 
 
 		 711 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  38.06 
 
 		 721 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  37.3 
 
 		 722 aa  396  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  40 
 
 		 701 aa  397  1e-109  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  35.37 
 
 		 738 aa  398  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.14 
 
 		 734 aa  390  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  32.58 
 
 		 721 aa  387  1e-106  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  35.55 
 
 		 717 aa  370  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  34.49 
 
 		 714 aa  368  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.69 
 
 		 757 aa  365  2e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  32.64 
 
 		 716 aa  362  1e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.65 
 
 		 756 aa  342  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.05 
 
 		 933 aa  334  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.26 
 
 		 497 aa  328  3e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.81 
 
 		 1072 aa  326  8.000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  33.95 
 
 		 731 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  37.64 
 
 		 691 aa  317  4e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  33.57 
 
 		 685 aa  317  5e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.41 
 
 		 724 aa  316  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  35.14 
 
 		 731 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  35.26 
 
 		 987 aa  313  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  37.3 
 
 		 751 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  37.3 
 
 		 751 aa  310  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  34.75 
 
 		 737 aa  309  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  36.76 
 
 		 751 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  34.88 
 
 		 922 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  33.91 
 
 		 731 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  37.46 
 
 		 779 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  37.93 
 
 		 693 aa  305  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  37.02 
 
 		 748 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  35.87 
 
 		 735 aa  301  3e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  34.68 
 
 		 733 aa  299  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  34.19 
 
 		 733 aa  296  7e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  34.49 
 
 		 733 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  34.39 
 
 		 733 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  34.39 
 
 		 733 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  34.19 
 
 		 733 aa  296  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.09 
 
 		 820 aa  293  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  34.03 
 
 		 733 aa  292  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  31.53 
 
 		 772 aa  291  3e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  35.08 
 
 		 731 aa  291  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  42.97 
 
 		 823 aa  291  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  32.24 
 
 		 829 aa  290  7e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  34.4 
 
 		 730 aa  290  1e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.38 
 
 		 1158 aa  286  9e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  34.31 
 
 		 748 aa  285  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  31.38 
 
 		 772 aa  281  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  32.61 
 
 		 805 aa  280  6e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  31.91 
 
 		 763 aa  280  8e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  31.9 
 
 		 778 aa  278  2e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  31.75 
 
 		 778 aa  276  8e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  31.31 
 
 		 763 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  31.31 
 
 		 763 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  42.01 
 
 		 845 aa  274  4.0000000000000004e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  34.46 
 
 		 748 aa  274  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  31.16 
 
 		 763 aa  273  9e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  29.6 
 
 		 822 aa  272  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  41.99 
 
 		 914 aa  272  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  42.86 
 
 		 915 aa  272  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  30.15 
 
 		 819 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.86 
 
 		 814 aa  270  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  30.99 
 
 		 808 aa  270  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.03 
 
 		 762 aa  268  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.14 
 
 		 751 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  30.55 
 
 		 763 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  33.33 
 
 		 774 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.53 
 
 		 760 aa  265  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.34 
 
 		 771 aa  265  2e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>