More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0220 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 721 aa  1489    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.91 
 
 		 711 aa  644    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  42.9 
 
 		 745 aa  615  9.999999999999999e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.72 
 
 		 734 aa  570  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  42.64 
 
 		 738 aa  557  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.83 
 
 		 749 aa  482  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.83 
 
 		 758 aa  483  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.55 
 
 		 755 aa  483  1e-135  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  39.02 
 
 		 755 aa  479  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.38 
 
 		 750 aa  462  9.999999999999999e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  37.66 
 
 		 762 aa  456  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.29 
 
 		 790 aa  441  9.999999999999999e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.35 
 
 		 777 aa  436  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.43 
 
 		 751 aa  438  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.97 
 
 		 757 aa  434  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  35.36 
 
 		 800 aa  423  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  34.82 
 
 		 760 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  34.54 
 
 		 757 aa  422  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  35.34 
 
 		 740 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.41 
 
 		 757 aa  420  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  35.89 
 
 		 750 aa  420  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  35.38 
 
 		 737 aa  414  1e-114  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  35.75 
 
 		 747 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.91 
 
 		 780 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  34.98 
 
 		 741 aa  405  1e-111  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  33.6 
 
 		 717 aa  396  1e-109  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.85 
 
 		 758 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  36.18 
 
 		 721 aa  395  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  36.28 
 
 		 722 aa  390  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  33.47 
 
 		 749 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.79 
 
 		 813 aa  389  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  33.06 
 
 		 793 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  33.2 
 
 		 793 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.59 
 
 		 809 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.36 
 
 		 742 aa  379  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.71 
 
 		 748 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  33.38 
 
 		 814 aa  375  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  34.27 
 
 		 733 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  33.85 
 
 		 733 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  33.85 
 
 		 733 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  34.13 
 
 		 733 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  33.85 
 
 		 733 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  33.92 
 
 		 714 aa  372  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  34 
 
 		 874 aa  372  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.57 
 
 		 737 aa  366  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  33.75 
 
 		 922 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  33.61 
 
 		 733 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  33.75 
 
 		 731 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  33.56 
 
 		 716 aa  366  1e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.5 
 
 		 933 aa  365  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  45.45 
 
 		 857 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  33.71 
 
 		 733 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  48.07 
 
 		 866 aa  362  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  34.43 
 
 		 708 aa  362  2e-98  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  33.01 
 
 		 731 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  33.24 
 
 		 701 aa  359  9.999999999999999e-98  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  32.93 
 
 		 731 aa  355  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  45.89 
 
 		 870 aa  353  5e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  46.84 
 
 		 887 aa  353  5e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  34.86 
 
 		 987 aa  351  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  44.27 
 
 		 832 aa  343  5.999999999999999e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  32.7 
 
 		 748 aa  342  2e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.47 
 
 		 724 aa  339  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  32.48 
 
 		 737 aa  336  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  32.23 
 
 		 748 aa  325  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  30.79 
 
 		 685 aa  324  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.47 
 
 		 1158 aa  324  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  30.69 
 
 		 735 aa  323  6e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.44 
 
 		 746 aa  320  6e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  32.66 
 
 		 691 aa  318  2e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  30.4 
 
 		 931 aa  316  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.93 
 
 		 1321 aa  313  7.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  31.4 
 
 		 805 aa  310  9e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  30.57 
 
 		 748 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  30.71 
 
 		 779 aa  306  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  30.9 
 
 		 751 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  30.9 
 
 		 751 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  30.9 
 
 		 751 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.23 
 
 		 756 aa  303  8.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  29.11 
 
 		 731 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.37 
 
 		 762 aa  294  4e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  28.9 
 
 		 1338 aa  293  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  28.57 
 
 		 829 aa  293  9e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  38.42 
 
 		 831 aa  290  7e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.07 
 
 		 792 aa  289  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  32.48 
 
 		 778 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.15 
 
 		 784 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  32.18 
 
 		 778 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  30.94 
 
 		 777 aa  283  8.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  30.52 
 
 		 743 aa  279  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.87 
 
 		 769 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.452314  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  30.45 
 
 		 759 aa  275  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  39.66 
 
 		 845 aa  275  3e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  41.34 
 
 		 843 aa  275  3e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.72 
 
 		 769 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  29.22 
 
 		 759 aa  274  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.13 
 
 		 712 aa  272  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  29.84 
 
 		 772 aa  271  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  29.38 
 
 		 765 aa  271  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.61 
 
 		 766 aa  271  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>