More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1839 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.49 
 
 		 750 aa  722    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.17 
 
 		 749 aa  666    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  56.47 
 
 		 748 aa  823    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.17 
 
 		 755 aa  670    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.66 
 
 		 758 aa  679    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  59 
 
 		 740 aa  871    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  49.4 
 
 		 777 aa  668    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.87 
 
 		 751 aa  678    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.16 
 
 		 758 aa  654    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.85 
 
 		 757 aa  647    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  44.87 
 
 		 747 aa  643    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.6 
 
 		 742 aa  672    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  45.54 
 
 		 762 aa  672    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 750 aa  1528    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  45.11 
 
 		 755 aa  657    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  50.94 
 
 		 760 aa  642    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  47.98 
 
 		 757 aa  640    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  56.75 
 
 		 737 aa  728    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.83 
 
 		 790 aa  612  9.999999999999999e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  44.11 
 
 		 741 aa  612  9.999999999999999e-175  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  46.25 
 
 		 800 aa  598  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  43.72 
 
 		 737 aa  580  1e-164  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  49.33 
 
 		 809 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.66 
 
 		 813 aa  573  1.0000000000000001e-162  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  42.95 
 
 		 749 aa  565  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  43.38 
 
 		 874 aa  536  1e-151  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.57 
 
 		 780 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  38.03 
 
 		 793 aa  456  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  38.03 
 
 		 793 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  37.24 
 
 		 814 aa  446  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  36.8 
 
 		 745 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  37.97 
 
 		 721 aa  438  1e-121  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  37.64 
 
 		 708 aa  438  1e-121  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.5 
 
 		 711 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  37.5 
 
 		 722 aa  430  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.32 
 
 		 734 aa  427  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  38.57 
 
 		 701 aa  422  1e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  35.89 
 
 		 721 aa  420  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  36.51 
 
 		 738 aa  409  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  36.48 
 
 		 716 aa  397  1e-109  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  36.15 
 
 		 717 aa  395  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  35.33 
 
 		 714 aa  390  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.84 
 
 		 757 aa  377  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  36.03 
 
 		 685 aa  363  7.0000000000000005e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.9 
 
 		 1072 aa  358  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.93 
 
 		 933 aa  358  1.9999999999999998e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.4 
 
 		 497 aa  355  1e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  37.87 
 
 		 987 aa  350  4e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  36.75 
 
 		 737 aa  345  1e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  34.2 
 
 		 731 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.56 
 
 		 756 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  35.2 
 
 		 733 aa  327  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  35.2 
 
 		 733 aa  327  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  35.2 
 
 		 733 aa  327  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  35.63 
 
 		 748 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.58 
 
 		 724 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  34.63 
 
 		 731 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  34.48 
 
 		 733 aa  320  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  34.92 
 
 		 733 aa  319  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  36.02 
 
 		 693 aa  318  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  35.71 
 
 		 733 aa  317  4e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  34.18 
 
 		 733 aa  317  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  34.47 
 
 		 922 aa  317  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2190  Beta-glucosidase  34.4 
 
 		 727 aa  315  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499174 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  35 
 
 		 691 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  34.16 
 
 		 731 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  38.13 
 
 		 748 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  35.99 
 
 		 735 aa  310  5e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  37.97 
 
 		 779 aa  310  9e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  36.93 
 
 		 751 aa  309  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  36.93 
 
 		 751 aa  307  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  36.93 
 
 		 751 aa  307  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.85 
 
 		 1158 aa  305  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  35 
 
 		 730 aa  305  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  35.58 
 
 		 731 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  36.81 
 
 		 748 aa  303  9e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  32.17 
 
 		 772 aa  298  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  45.86 
 
 		 823 aa  295  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  31.5 
 
 		 778 aa  293  1e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  31.37 
 
 		 829 aa  292  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  31.4 
 
 		 778 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.6 
 
 		 1321 aa  290  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  32.98 
 
 		 790 aa  290  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  30.47 
 
 		 777 aa  288  2e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.19 
 
 		 760 aa  288  2e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  32.29 
 
 		 737 aa  287  5.999999999999999e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.72 
 
 		 762 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.18 
 
 		 820 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.57 
 
 		 814 aa  284  4.0000000000000003e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  41.33 
 
 		 914 aa  284  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  32.02 
 
 		 805 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.03 
 
 		 783 aa  282  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  32.06 
 
 		 772 aa  281  4e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151913 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  30.2 
 
 		 822 aa  278  2e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.98 
 
 		 751 aa  278  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  32.72 
 
 		 808 aa  276  7e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  34 
 
 		 931 aa  276  8e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.93 
 
 		 771 aa  273  8.000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  33.73 
 
 		 1338 aa  272  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  30.12 
 
 		 819 aa  271  4e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>