More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1729 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  55.18 
 
 
730 aa  712    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  100 
 
 
737 aa  1481    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  52.39 
 
 
748 aa  642    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  53.42 
 
 
748 aa  649    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  47.76 
 
 
735 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  48.86 
 
 
691 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  45.14 
 
 
731 aa  570  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  45.99 
 
 
931 aa  560  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  43.15 
 
 
731 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  45.15 
 
 
779 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  45.44 
 
 
751 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  45.44 
 
 
751 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  45.3 
 
 
751 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  45.44 
 
 
748 aa  483  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  40.81 
 
 
922 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  41.68 
 
 
733 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  41.68 
 
 
733 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  40.93 
 
 
731 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  41.4 
 
 
733 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  41.05 
 
 
731 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  41.4 
 
 
733 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  41.26 
 
 
733 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  40.98 
 
 
733 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  40.53 
 
 
733 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.51 
 
 
758 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.29 
 
 
749 aa  372  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.61 
 
 
933 aa  363  8e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  34.21 
 
 
755 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.25 
 
 
757 aa  357  5.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.82 
 
 
755 aa  356  6.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  38.11 
 
 
987 aa  355  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  34.7 
 
 
745 aa  356  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  35.11 
 
 
829 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  34.88 
 
 
762 aa  352  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.29 
 
 
734 aa  347  4e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.54 
 
 
1072 aa  347  6e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  36.75 
 
 
750 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  31.98 
 
 
800 aa  344  4e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.44 
 
 
1158 aa  343  7e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.07 
 
 
750 aa  342  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  39.54 
 
 
693 aa  342  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  31.41 
 
 
738 aa  341  2.9999999999999998e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  32.68 
 
 
747 aa  339  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  32.48 
 
 
721 aa  336  9e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.15 
 
 
757 aa  336  1e-90  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.33 
 
 
790 aa  334  3e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.06 
 
 
711 aa  332  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  33.2 
 
 
721 aa  330  6e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  31.88 
 
 
717 aa  330  6e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  37.33 
 
 
740 aa  328  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  32.6 
 
 
722 aa  321  3.9999999999999996e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  34.9 
 
 
701 aa  319  1e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  30.91 
 
 
737 aa  316  9.999999999999999e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  35.77 
 
 
760 aa  314  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  32.4 
 
 
685 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  30.93 
 
 
757 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.33 
 
 
742 aa  307  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  32.87 
 
 
741 aa  307  4.0000000000000004e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.68 
 
 
746 aa  307  5.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.75 
 
 
813 aa  305  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  30.98 
 
 
793 aa  304  3.0000000000000004e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  32.46 
 
 
749 aa  304  4.0000000000000003e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  31.54 
 
 
714 aa  304  5.000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  30.85 
 
 
793 aa  303  7.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  32.05 
 
 
716 aa  303  1e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.31 
 
 
758 aa  302  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 
756 aa  301  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  34.11 
 
 
1338 aa  299  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.49 
 
 
809 aa  297  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  31.46 
 
 
814 aa  297  6e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  32.8 
 
 
708 aa  296  1e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.62 
 
 
1321 aa  295  2e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.82 
 
 
777 aa  293  6e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.09 
 
 
748 aa  291  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.14 
 
 
780 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.33 
 
 
751 aa  287  5e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2327  beta-glucosidase  44.88 
 
 
549 aa  286  9e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268142  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.65 
 
 
737 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.33 
 
 
762 aa  280  6e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  31.15 
 
 
874 aa  275  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2190  Beta-glucosidase  34.2 
 
 
727 aa  273  6e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.499174 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  30.96 
 
 
772 aa  273  7e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  31.77 
 
 
790 aa  270  8e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.02 
 
 
724 aa  269  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  30.1 
 
 
777 aa  267  5.999999999999999e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  30.55 
 
 
778 aa  263  6e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  30.4 
 
 
778 aa  262  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  30.57 
 
 
805 aa  257  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.79 
 
 
783 aa  252  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1704  beta-glucosidase  43.61 
 
 
380 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1911  beta-glucosidase  43.61 
 
 
380 aa  248  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  30.57 
 
 
772 aa  247  4e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23450  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  31.21 
 
 
773 aa  247  4.9999999999999997e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.594543  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  30.08 
 
 
905 aa  246  9.999999999999999e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.43 
 
 
760 aa  245  1.9999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.58 
 
 
751 aa  243  6e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.63 
 
 
754 aa  237  6e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.84 
 
 
760 aa  235  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.42 
 
 
792 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04102  beta-glucosidase (Eurofung)  30.81 
 
 
854 aa  233  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>