More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00676 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  70.97 
 
 
931 aa  1014    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  52.98 
 
 
748 aa  702    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  54.87 
 
 
748 aa  696    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  100 
 
 
735 aa  1496    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  50.62 
 
 
730 aa  644    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  47.87 
 
 
737 aa  585  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  41.37 
 
 
731 aa  570  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  48.85 
 
 
691 aa  552  1e-156  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  43.86 
 
 
731 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  43.83 
 
 
751 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  43.94 
 
 
748 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  43.83 
 
 
751 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  43.83 
 
 
751 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  40.86 
 
 
922 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  43.73 
 
 
779 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  40.86 
 
 
731 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  40.14 
 
 
731 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  41.03 
 
 
733 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  41.26 
 
 
733 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  40.25 
 
 
733 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  41.03 
 
 
733 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  41.46 
 
 
733 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  40.25 
 
 
733 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  40.26 
 
 
733 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.92 
 
 
1072 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.9 
 
 
933 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.53 
 
 
758 aa  371  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.53 
 
 
749 aa  371  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  32.26 
 
 
745 aa  356  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.02 
 
 
711 aa  354  4e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  32.12 
 
 
829 aa  353  7e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.44 
 
 
757 aa  352  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  33.29 
 
 
738 aa  350  4e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  35.73 
 
 
987 aa  346  7e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.67 
 
 
1158 aa  345  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.31 
 
 
734 aa  345  2e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  33.58 
 
 
755 aa  345  2e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  37.67 
 
 
740 aa  342  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.66 
 
 
755 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  36.41 
 
 
693 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  32.06 
 
 
762 aa  335  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  30.77 
 
 
721 aa  330  7e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.13 
 
 
757 aa  329  1.0000000000000001e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  32.1 
 
 
717 aa  327  6e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  34.18 
 
 
737 aa  326  7e-88  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  33.48 
 
 
747 aa  326  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  35.87 
 
 
750 aa  323  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.78 
 
 
790 aa  319  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  32.32 
 
 
714 aa  318  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.85 
 
 
746 aa  317  4e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  31.56 
 
 
814 aa  312  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.67 
 
 
758 aa  311  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  31.07 
 
 
800 aa  308  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.87 
 
 
1321 aa  307  4.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.97 
 
 
750 aa  305  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.38 
 
 
742 aa  303  9e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  31.16 
 
 
749 aa  302  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  31.87 
 
 
721 aa  300  7e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  33.72 
 
 
701 aa  298  2e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  34.49 
 
 
708 aa  297  6e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  32.87 
 
 
1338 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.52 
 
 
813 aa  295  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  31.77 
 
 
716 aa  295  2e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  30.52 
 
 
793 aa  294  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  31.98 
 
 
741 aa  294  5e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  30.39 
 
 
793 aa  293  6e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.1 
 
 
748 aa  291  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  31.11 
 
 
722 aa  286  7e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  34.65 
 
 
777 aa  286  7e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.95 
 
 
737 aa  286  8e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  31.67 
 
 
757 aa  280  6e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  30.04 
 
 
822 aa  274  4.0000000000000004e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  29.83 
 
 
685 aa  273  6e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2327  beta-glucosidase  40.49 
 
 
549 aa  273  9e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268142  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  29.49 
 
 
772 aa  271  2.9999999999999997e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  29.22 
 
 
874 aa  266  8e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.41 
 
 
724 aa  266  1e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.41 
 
 
809 aa  266  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.65 
 
 
780 aa  264  4e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  33.87 
 
 
760 aa  264  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.75 
 
 
751 aa  260  7e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.23 
 
 
756 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  32.7 
 
 
737 aa  253  6e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  27.56 
 
 
819 aa  253  7e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.2 
 
 
762 aa  247  6.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  28.61 
 
 
765 aa  245  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04102  beta-glucosidase (Eurofung)  29.82 
 
 
854 aa  240  8e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1703  putative beta-glucosidase  41.51 
 
 
375 aa  239  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.821899  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1910  putative beta-glucosidase  41.51 
 
 
375 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  31.87 
 
 
772 aa  238  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  28.61 
 
 
743 aa  238  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  27.66 
 
 
777 aa  236  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1704  beta-glucosidase  40.91 
 
 
380 aa  234  5e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1911  beta-glucosidase  40.91 
 
 
380 aa  234  5e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  29.63 
 
 
805 aa  233  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10482  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  31.16 
 
 
868 aa  233  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.584678 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  29.2 
 
 
859 aa  233  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  29.47 
 
 
905 aa  232  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.7 
 
 
783 aa  230  7e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.67 
 
 
804 aa  230  8e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>