More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0447 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 734 aa  1524    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  67.76 
 
 		 738 aa  1016    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  43.96 
 
 		 745 aa  621  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.89 
 
 		 711 aa  585  1e-166  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  42.72 
 
 		 721 aa  570  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.69 
 
 		 755 aa  524  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.34 
 
 		 758 aa  522  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  41.62 
 
 		 755 aa  523  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.34 
 
 		 749 aa  522  1e-147  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  40.54 
 
 		 762 aa  510  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  39.77 
 
 		 749 aa  471  1.0000000000000001e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.29 
 
 		 757 aa  468  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.6 
 
 		 790 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  39.72 
 
 		 800 aa  452  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  39.37 
 
 		 747 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  38.64 
 
 		 793 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  38.5 
 
 		 793 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.74 
 
 		 757 aa  444  1e-123  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.43 
 
 		 751 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.5 
 
 		 750 aa  430  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.3 
 
 		 933 aa  428  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  37.32 
 
 		 750 aa  428  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  37.66 
 
 		 757 aa  424  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  37.12 
 
 		 740 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.23 
 
 		 777 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  36 
 
 		 737 aa  419  1e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  37.06 
 
 		 814 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  36.76 
 
 		 717 aa  408  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  36.17 
 
 		 731 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  36.98 
 
 		 721 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  36.67 
 
 		 722 aa  397  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  45.56 
 
 		 857 aa  397  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  44.55 
 
 		 870 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  48.4 
 
 		 832 aa  392  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  47.87 
 
 		 866 aa  395  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  35.07 
 
 		 874 aa  394  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  35.64 
 
 		 741 aa  393  1e-108  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.74 
 
 		 756 aa  391  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.15 
 
 		 780 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  35.24 
 
 		 987 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  35.19 
 
 		 760 aa  390  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  36.83 
 
 		 714 aa  388  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.41 
 
 		 813 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  46.44 
 
 		 887 aa  382  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.17 
 
 		 1072 aa  382  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.15 
 
 		 758 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.1 
 
 		 742 aa  378  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  36.66 
 
 		 708 aa  377  1e-103  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.57 
 
 		 809 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  34.77 
 
 		 701 aa  376  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.14 
 
 		 748 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.55 
 
 		 762 aa  366  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  34.24 
 
 		 731 aa  366  1e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  34.92 
 
 		 693 aa  364  3e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  35.42 
 
 		 730 aa  364  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.11 
 
 		 1158 aa  363  8e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  33.99 
 
 		 731 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.47 
 
 		 737 aa  361  3e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  33.99 
 
 		 922 aa  360  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  36.14 
 
 		 731 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  33.15 
 
 		 733 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  33.15 
 
 		 733 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  33.15 
 
 		 733 aa  360  5e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  32.7 
 
 		 685 aa  358  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  34.1 
 
 		 805 aa  355  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  33.33 
 
 		 733 aa  354  4e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.16 
 
 		 724 aa  353  8.999999999999999e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  33.61 
 
 		 733 aa  352  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  33.83 
 
 		 748 aa  351  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  33.1 
 
 		 716 aa  350  4e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.16 
 
 		 746 aa  350  5e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  33.16 
 
 		 905 aa  350  5e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  35.55 
 
 		 691 aa  349  9e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  33.29 
 
 		 748 aa  347  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.19 
 
 		 712 aa  346  8e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  33.97 
 
 		 737 aa  345  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  33.25 
 
 		 743 aa  345  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  31.84 
 
 		 777 aa  335  2e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  31.79 
 
 		 735 aa  333  5e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  33.54 
 
 		 778 aa  333  7.000000000000001e-90  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  35.52 
 
 		 779 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  33.38 
 
 		 763 aa  331  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  33.5 
 
 		 778 aa  330  4e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  33.78 
 
 		 931 aa  329  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  33.85 
 
 		 774 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  35.08 
 
 		 748 aa  327  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  35.37 
 
 		 751 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  35.37 
 
 		 751 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  35.23 
 
 		 751 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  34.43 
 
 		 753 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  30.28 
 
 		 859 aa  323  7e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  32.32 
 
 		 790 aa  323  8e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.72 
 
 		 766 aa  323  8e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.7 
 
 		 1321 aa  322  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.74 
 
 		 792 aa  319  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  32.74 
 
 		 765 aa  319  1e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.17 
 
 		 771 aa  318  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  41.94 
 
 		 831 aa  317  6e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  34.01 
 
 		 765 aa  317  6e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.77 
 
 		 784 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>